m6A研究又有新手段了？趕緊來了解一下吧！欄目：研究動態(tài)發(fā)布時間：2019-08-14RNA甲基化m6A是如今的研究熱點之一,Cell上新發(fā)表了一篇介紹不使用m6A抗體的檢測mRNAm6A水平的Resource文章......RNA甲基化m6A是如今的研究熱點之一，目前主要的研究思路包括差異表達的write，reader和eraser基因分析；m6A抗體檢測全轉錄組甲基化水平；分析m6A甲基化水平變化的靶基因和下游機制研究。而在7月25日的Cell上新發(fā)表了一篇介紹不使用m6A抗體的檢測mRNAm6A水平的Resource文章，小編時間和大家分享一下。作者開發(fā)這一方法的前提是有研究報道了MazF能特異性的識別無修飾的ACA序列并發(fā)揮RNA酶活性在ACA之前剪切底物。但ACA序列的個A發(fā)生m6A甲基化之后將無法被MazF所識別，如圖一所示。圖1MazFRNA酶作用示意圖根據(jù)這一原理，作者將純化后的mRNA進行MazF酶處理，然后再對打斷的RNA進行逆轉建庫測序。對于無修飾的位點，ACA處被完全剪切，測序reads正好分布于該位點上下游而且比對至該處的上下游reads數(shù)是相同的.如圖2所示。而甲基化位點的reads會包含上下游的序列。作者開發(fā)了MAZTER-MINE軟件包專門進行分析（圖3）。生物分子學的研究范圍非常廣，包括蛋白質、核酸、糖類、脂質等生物分子的結構、功能和相互作用等方面。湖北大鼠科研技術服務實驗室

    代謝組學的研究對象大都是相對分子量在1000以內的小分子物質，因此常用的血液樣本在取樣后，應小心操作，防止溶血，盡快分離出血清，分置于溫環(huán)境下保存。由于用于理實驗的動物采集相對其他樣品的采集，操作更繁瑣，在處理過程中許多細節(jié)容易忽略，造成數(shù)據(jù)不完美（甚至不能用）。因此接下來將重點介紹樣品采集的注意事項及其固定。樣品采集注意事項應新鮮，操作時間盡可能短，否則細胞發(fā)生死后變化、自融及現(xiàn)象。是動物心臟還在跳動時采集，樣本取出后在5分鐘以內置于固定液內，避免長時間暴露在空氣環(huán)境中。塊盡量小而薄。塊的厚度以不超過5mm為宜，較為理想的厚度為2mm左右，主要目的是使固定液迅速而均勻的滲入塊內部。勿使塊受擠壓。在采集過程中，應盡量選擇較為鋒利的手術，如手術刀片等，避免操作過程中擠壓挫傷標本。擠壓過的均不可用。固定液的量一般以塊大小的20倍為宜，能夠在容器內自由移動。盡量保持的原有形態(tài)。新鮮經(jīng)固定后，或多或少產(chǎn)生收縮現(xiàn)象（如胃腸），為此可將展平，以盡可能維持原形。保持清潔。塊上如有血液、污物、粘液、食物、糞便等，可用生理鹽水沖洗，然后再入固定液，但要注意防止損傷。要熟悉采集部位。要能準確的按解剖部位采集。湖北大鼠科研技術服務實驗室科研中我們涉及到的免疫沉淀實驗通常指：免疫共沉淀（Co-IP）、RIP、Chip等等，將幾種實驗簡單概述一下。

    3）基因/蛋白質表達定性或定量檢測在進行分子檢測的過程中，保持核酸和蛋白質的完整性至關重要，因此在取樣過程中，應盡量避免核酸及蛋白質的降解。如不注意采樣過程，將會導致樣本中的核酸及蛋白質的無差別降解，嚴重影響后續(xù)分子檢測結果。在條件允許的情況下，樣本在離體后應立刻裝入凍存管內，并立即放入液氮中進行冷凍。在RNA提取樣本的保存過程中，可以選擇非冷凍型RNA保存液或Trizol試劑進行RNA酶的。針對蛋白質提取樣本的保存，我們同樣可以使用商品化的蛋白酶劑進行短期處理。聚合酶鏈式反應（PolymeraseChnReaction，PCR）及免印跡（Westernblotting，WB），這兩種實驗手段是分子學檢測中不可或缺的一部分，也是發(fā)表至關重要的分子檢測數(shù)據(jù)。PCR主要用來對基因在基因組層面或轉錄層面的變化進行定性或定量檢測，而WB則主要用來對某一蛋白質的表達進行定量檢測。（4）轉錄組學、蛋白質組學及代謝組學檢測隨著檢測水平及相關產(chǎn)業(yè)的不斷發(fā)展，各類組學檢測的價格降低，實驗設計中也常常運用組學檢測來提升實驗設計的檔次。在我們進行轉錄組學及蛋白質組學的檢測過程中，同樣是要首先確保目標RNA或蛋白質的片段完整性。

    靜置25分鐘后把酒精倒干，用吸水紙吸出多余的酒精，然后配壓縮膠，同樣的操作，關鍵是梳子要插得快，要小心梳子下產(chǎn)生氣泡，然后靜置30分鐘。如果是當天跑膠，我會等上層膠凝2個小時再用，但要注意防干燥縮水，可以在一個小時的時候沿著梳子上緣加點電泳液。所以我一般提前一晚制膠，泡于純水或者電泳液里置于4度冰箱暫存。三、蛋白電泳1、上樣前準備把膠組裝到電泳芯上，注意密閉性(否則漏液)，如果內槽漏液就不是勻強電場了，條帶可能就不是一條直線。然后內槽倒?jié)M電泳液，拔梳子，這一步要小心，梳子要兩邊一起緩緩往上拔出，然后觀察泳道內有無脫落的膠?；蛘吣z絲，有的話用1毫升注射器吸出。然后從冰箱取出蛋白樣品，解凍。準備振蕩器。2、上樣和電泳注意，上樣后蛋白會開始慢慢在膠中彌散，所以上樣越快越好。我習慣先上蛋白Marker,再上蛋白樣品，蛋白上樣前確保樣品完全解凍和充分振蕩(推薦使用振蕩器振蕩)，吸的時候沒有拉絲即可，建議上樣分鐘把樣品從冰上取出來，不然樣品中SDS可能會結晶析出，從而影響電泳效果。上層膠80V25分鐘，下層膠120V65分鐘。四、轉膜1、轉膜前準備我會在電泳結束0分鐘準備，把轉膜液配好置于4度冰箱預冷，然后裁膜，準備轉膜裝置。干貨分享 | 瓊脂糖核酸電泳，選擇紫外還是藍光？

    一種是用beta巰基乙醇打開蛋白質分子二硫鍵的，另一種是用DTT(二硫蘇糖醇)。兩者的作用是一樣的，但特點不一樣，前者更容易與氧氣反應，穩(wěn)定性比后者差，如果在常溫下暴露在空中，前者只能維持24小時的活性，后者卻可以維持7天左右。所以該如何選擇?如果是蛋白樣品較少，跑幾次就可以用完的樣品，這時選擇beta巰基乙醇。如果樣品很多，計劃跑上幾十次的，優(yōu)先選擇DTT,建議變性后分裝保存。二、SDS-PAGE凝膠配制1、配膠前準備首先強調一下，一塊好的膠是跑好蛋白的前提，所以這個環(huán)節(jié)也不容忽視。玻璃板的選擇，一種是1毫米厚度的，另一種是，這個厚度選擇也是有講究的，如果上樣體積小于10微升，優(yōu)先選1毫米，否則選。原因是什么?答案在轉膜部分揭曉。還有分離膠的濃度也要選擇適合的。然后玻璃板和梳子要洗干凈，晾干。裝板，注意厚板和薄板的底部要對齊，否則會漏膠。加制膠的各成分前，要觀察液體是否有沉淀，有沉淀的盡量不要用。2、制膠按配方說明依次加入各組分，加完SDS后先簡單手動搖勻幾下，然后迅速加入過硫酸銨和TEMED,搖勻，緊接著就灌膠。然后我習慣用95%的酒精壓膠，我也用過純水，感覺純水壓沒那么好，由于水的密度較大，會把分界處的膠壓得膨大?？梢云毡閼糜谏镝t(yī)學研究、藥物篩選、腫、瘤診斷等領域。廣西大鼠科研技術服務外包

RNA提取過程中試劑的作用是什么？湖北大鼠科研技術服務實驗室

    動物模型在科研中有著普遍的應用。首先，它們可以幫助科研人員深入理解的共同性，即不同物種之間存在的共有理變化過程。通過對動物模型的研究，科研人員可以更清楚地了解的發(fā)展過程和機制，為人類的檢查提供理論依據(jù)。其次，動物模型還為新研發(fā)和苗測試提供了的平臺。在研發(fā)過程中，科研人員可以通過對動物模型進行處理，觀察其和副作用，為新的臨床試驗提供依據(jù)。而在苗測試中，動物模型則可以用來評估苗的性和安全性。此外，動物模型還為科研人員提供了研究人類的跨學科方法。例如，通過比較人類和動物模型的基因組學、蛋白質組學等數(shù)據(jù)，可以發(fā)現(xiàn)與發(fā)生相關的關鍵基因和蛋白質，從而為的和檢查提供新的思路。雖然動物模型在科研中發(fā)揮了巨大的作用，但也存在一些挑戰(zhàn)。首先，由于物種差異的存在，動物模型的表現(xiàn)與人類可能存在差異，因此需要謹慎使用。此外，動物模型的倫理問題也不容忽視，科研人員需要在符合倫理規(guī)定的前提下進行相關研究。盡管存在挑戰(zhàn)，動物模型的發(fā)展前景仍然值得期待。隨著科技的不斷進步，科研人員將能夠開發(fā)出更為精確、實用的動物模型。湖北大鼠科研技術服務實驗室