圖2MAZTER-Seq實驗流程圖圖3MAZTER-MINE分析m6A示意圖接下來作者便是要驗證這一新方法的可行性了。在酵母中敲除IME4的情況下,檢測到的剪切效率高于野生型(剪切效率高低m6A水平),m6A抗體富集后的樣品剪切效率也低于未富集的Input組。整體水平可靠,那檢測的特異性位點是否準確呢?作者也將該方法檢測到的新甲基化位點使用放射標記層析檢測,發(fā)現預測的位點準確存在而且與剪切效率相符合。如圖5所示。而圖6中,作者則是與m6A抗體IP的方法進行了比較,也證實了這一方法的可行性。圖5MAZTER-Seq檢測結果驗證圖6MAZTER-Seq與m6A-Seq比較分析此外,后文中作者也在大規(guī)模的CRISPR-Cas9改變m6A狀態(tài)和酵母減數分裂模型中檢測了MAZTER-Seq這一系統(tǒng);并進一步通過這一方法檢測了哺乳動物不同細胞間m6A水平的保守性;也探究了去甲基化酶FTO對整體m6A甲基化水平的影響等。這里小編主要給大家分享這一新技術,其他部分暫不過多分析了。新的技術能拓展我們的研究內容;對于這一技術。動物實驗這些取樣細節(jié),你有注意嗎?湖南哪里有科研技術服務購買
m6A研究又有新手段了?趕緊來了解一下吧!欄目:研究動態(tài)發(fā)布時間:2019-08-14RNA甲基化m6A是如今的研究熱點之一,Cell上新發(fā)表了一篇介紹不使用m6A抗體的檢測mRNAm6A水平的Resource文章......RNA甲基化m6A是如今的研究熱點之一,目前主要的研究思路包括差異表達的write,reader和eraser基因分析;m6A抗體檢測全轉錄組甲基化水平;分析m6A甲基化水平變化的靶基因和下游機制研究。而在7月25日的Cell上新發(fā)表了一篇介紹不使用m6A抗體的檢測mRNAm6A水平的Resource文章,小編時間和大家分享一下。作者開發(fā)這一方法的前提是有研究報道了MazF能特異性的識別無修飾的ACA序列并發(fā)揮RNA酶活性在ACA之前剪切底物。但ACA序列的個A發(fā)生m6A甲基化之后將無法被MazF所識別,如圖一所示。圖1MazFRNA酶作用示意圖根據這一原理,作者將純化后的mRNA進行MazF酶處理,然后再對打斷的RNA進行逆轉建庫測序。對于無修飾的位點,ACA處被完全剪切,測序reads正好分布于該位點上下游而且比對至該處的上下游reads數是相同的.如圖2所示。而甲基化位點的reads會包含上下游的序列。作者開發(fā)了MAZTER-MINE軟件包專門進行分析(圖3)。貴州豚鼠科研技術服務購買細胞污染的處理的技術。
建議按照2×106每孔的數量將293T細胞均勻鋪入。(2)第二天:在24小時之內,觀察293T細胞的匯合度在90%~95%之間時,向其中加入DNA-脂質體復合體,DNA-脂質體復合體制備方法如下:a)輕輕混勻LipoMax,根據說明書加入相應量于500μlOpti-MEM無血清培養(yǎng)基中,混合均勻并置于室溫5分鐘。b)在500μlOpti-MEM無血清培養(yǎng)基中稀釋DNA,總質量為15μg按照載體質粒:psPAX2:=4:3:1的比例加入DNA。c)將稀釋后的LipoMax和稀釋后的DNA輕輕混勻,常溫靜置20分鐘,形成DNA-LipoMax復合體。(3)將DNA-LipoMax復合體輕柔地滴加至細胞培養(yǎng)皿中,輕輕搖晃培養(yǎng)皿混勻,放入細胞培養(yǎng)箱中培養(yǎng)。(4)病毒收集濃縮病毒:加入DNA-LipoMax復合體48小時后,收集病毒上清,同時加入10ml預溫的293T培養(yǎng)基到細胞培養(yǎng)皿中。將收集到的病毒上清存在4℃冰箱中;收集72小時病毒上清,與48小時病毒上清混在一起。將離心機溫度降溫到4℃,600g,離心5分鐘,去除其中的細胞碎片,上清液經μm濾頭過濾,加入病毒濃縮液,配制濃縮病毒液。將濃縮后的病毒放于4℃冰箱搖床上,旋轉過夜。第二天,4度離心機,3000~4000g離心15分鐘。棄掉上清液,加入1Xpbs或培養(yǎng)基重懸。
保存于嚴密緊塞或加蓋的容器里,同時在容器外上標簽,并隨同材料在溶液中投入相應的標簽,以免相互混淆。標簽上注明固定液、材料來源、日期等。標簽上的文字,應用黑色鉛筆或繪圖黑墨水書寫。3.脫水注意事項(1)脫水原理:乙醇與石蠟不相溶,而二甲苯既能溶于乙醇又能溶于石蠟。當組織中全部被二甲苯占有時,光線可以透過,組織呈現出不同程度的透明狀態(tài)。(2)脫水必須在有蓋的玻璃品中進行,防止吸收空氣中的水分。(3)在更換高一級的脫水劑時,不要移動材料以免損壞,可用吸管吸出器皿中的脫水劑,再用吸水吸盡器皿內剩余液,然后于皿中加入高一級脫水劑。(4)在低濃度酒精中,每級停留不宜太長,否則易使組織變軟,助長材料的解體。(5)在高濃度或純酒精中,每級停留的時間也不宜太長,否則會使組織變脆,影響切片。(6)如需過夜,應停留在70%酒精中。(7)脫水必須徹底,否則不易透明,甚至使透明劑內出現白色混濁現象。4.透明注意事項(1)使用透明劑時,要隨時蓋緊蓋子,以免空氣中的水分進入。(2)更換每級透明劑,動作要迅速,一方面為了不使材料塊干涸,另一方面能避免吸收濕氣。(3)在透明過程中,如果材料周圍出現白色霧狀,說明材料中的水未被脫凈。腫瘤細胞具有極強的增殖能力,在一個適宜,裸鼠成瘤是常見的驗證腫瘤細胞體內增殖模型。
外泌體的功能外泌體可能作為細胞之間物質和信號通訊的途徑,不同的細胞通過分泌攜帶不同組分的外泌體實現細胞間通訊,這些外泌體被受體細胞吸收,通過物質交換或釋放內含物實現物質和信號的交流。外泌體與受體細胞的信息交流可能通過以下4種途徑實現:外泌體表面膜蛋白質被目的細胞表面的受體識別,從而靶細胞;外泌體在蛋白酶作用下產生的表面膜蛋白質碎片可作為目的細胞表面受體的配體;外泌體脂膜可以與目的細胞膜融合,將蛋白質和RNA等內容物釋放進去,此類膜融合可能改變靶細胞的一些膜特性,例如脂質和膜蛋白質的密度及種類;目的細胞通過胞吞的形式攝入外泌體經由以上幾種途徑,外泌體將其攜帶的生物信息運輸到周邊靶細胞或經血液等體液運輸而被遠處組織細胞攝取,進而影響目的細胞的基本功能和基因表達。幾乎所有的細胞都可以在自發(fā)或在一定刺激條件下產生外泌體,不同的細胞產生的外泌體具有不同的功能,這些外泌體參與了一系列生理和病理過程,如發(fā)生與發(fā)展、抗原呈遞、免疫調節(jié)、組織愈合等。此外,外泌體與疾病的研究表明:外泌體可能在代謝性疾病的出現以及心血管健康中發(fā)揮作用。細胞器是細胞內的各種功能結構,如線粒體、內質網、高爾基體等,它們各自承擔著不同的生理功能。海南疾病模型科研技術服務服務
流式細胞周期檢測試劑盒是一種用于研究細胞周期的重要工具。湖南哪里有科研技術服務購買
這種細胞保持著其原始的生物學特性,具有高度的活性和分裂能力。原代細胞在許多生物醫(yī)學研究中具有重要地位,包括藥物篩選、疾病模型的建立以及疫苗研發(fā)等。原代細胞的獲得通常是通過組織剪切、消化或酶解等方式從機體或組織中分離出來。這些細胞脫離了它們在生物體中的環(huán)境,但是仍然保持著其基本的生物學特性,包括細胞膜、細胞核、細胞器以及其他重要的生物分子。原代細胞在未經過傳代培養(yǎng)的情況下,保持著其原始的生物學特性,因此,它們常常被用于藥物篩選、毒理學研究等。同時,由于原代細胞具有高度活性和分裂能力,它們也被用于組織工程和再生醫(yī)學中,如皮膚移植、骨頭修復和神經再生等。此外,原代細胞模型在疾病研究中也扮演著重要角色。由于原代細胞具有更高的生物真實性,使用它們建立的疾病模型能夠更準確地模擬疾病的發(fā)展過程和藥物的作用機制,從而為新藥研發(fā)和疾病治、療提供更有效的工具??傊?,原代細胞是一種具有高度活性和分裂能力的細胞,在生物醫(yī)學研究中具有重要的作用。由于其原始的生物學特性。湖南哪里有科研技術服務購買