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湖北常規(guī)靶向代謝組學領(lǐng)域

來源: 發(fā)布時間:2022-02-23

代謝組學發(fā)展至今,代謝組學技術(shù)已經(jīng)遠遠超出了標準臨床化學技術(shù)的范圍,能夠精確分析數(shù)百至數(shù)千種代謝物。代謝組學提供了代謝表型的詳細表征,并可以在許多水平上進行精密醫(yī)學研究,包括表征疾病基礎的代謝紊亂,發(fā)現(xiàn)新的治靶標以及發(fā)現(xiàn)可用于診斷疾病或監(jiān)測藥物的活性。比較常見的代謝組學分析方法是質(zhì)譜(MS)核磁共振(NMR)光譜。質(zhì)譜技術(shù)又分為LC-MS和GC-MS。其基本原理是使試樣中各組分在離子源中發(fā)生電離,生成不同荷質(zhì)比的帶電荷的離子,經(jīng)加速電場的作用,形成離子束,進入質(zhì)量分析器。與基因組學和蛋白質(zhì)組學相比,代謝組學與生理學的聯(lián)系更加緊密。湖北常規(guī)靶向代謝組學領(lǐng)域

代謝組學樣本收集植物組織:果實、種子:1)對于含水量高、體積較大的果實(番茄、西瓜、蘋果等)需要先將樣品分成“均勻”的小塊(≈ 200 mg/樣本)分裝至2 mL離心管中,標號后迅速放入液氮中冷凍處理至少15 min。2)對于細小的顆粒種子(擬南芥種子、谷物種子等),可以先將同一組的植株種子混勻后再分裝(≈ 200 mg/樣本)至離心管中,標號后迅速放入液氮中冷凍處理至少15 min。3)對于要求對整個果實進行提取的(整粒葡萄等),需要把果實裝在50 mL離心管/自封袋中,標號后迅速放入液氮中冷凍處理至少15min,-80 ℃凍存,干冰寄送。湖北常規(guī)靶向代謝組學領(lǐng)域代謝組學的研究對象與層次有哪些?

代謝組學有哪些特點?(1) 代謝處于系統(tǒng)生物學的末端,更能反映基因與外部環(huán)境互作的真實情況,因此,在多數(shù)生物表型研究上更加適用。(2) 常規(guī)代謝組學只關(guān)注內(nèi)源性化合物,也有使用代謝組學技術(shù)測定外源性化合物的。內(nèi)源性化合物的上調(diào)和下調(diào)指示了與疾病、毒性、基因修飾或環(huán)境因子的影響。(3) 高通量定量和定性研究生物小分子化合物。(4) 內(nèi)源性化合物的結(jié)果可以作為疾病的診斷、藥物篩選或者其他分型評估等潛在生物標志物。謝組學通過揭示內(nèi)在和外在因素影響下,生物體的代謝整體的變化軌跡來反映某種生理或病理的一系列發(fā)展過程。

代謝組學什么類型的樣本更適合,樣本采集需要注意什么?絕大多數(shù)可以可靠收集的生物樣本都適用于代謝組學研究。常見的樣本主要有:臨床和動物的血清、血漿、尿液、糞便、各類組織、體液;細胞和微生物、培養(yǎng)液和發(fā)酵液;植物的根、莖、葉、花等。代謝每時每刻都在發(fā)生變化,我們需要研究的是某個或多個瞬時狀態(tài),因此樣本采集一般需要保證“快速、一致、簡單”的,采集后通過低溫淬滅(如液氮淬滅或低溫凍存等)的方法阻止離體后的樣本的代謝活動。另外,不同的檢測要求也需要配合不同的收集方法,具體步驟請參照譜領(lǐng)生物樣本收集步驟文件。代謝組學主要研究的是各種代謝路徑的底物。

代謝組學的研究領(lǐng)域有哪些?1、疾病機制研究。2、疾病診斷與防治。3、新藥篩選和開發(fā)。4、藥物作用機制的研究。5、藥物毒性評價。6、植物的細胞代謝組學研究。7、微生物代謝組學研究。代謝組能夠檢測到的代謝物含量是多少?不同檢測平臺的靈敏度不一樣,靈敏度比較高,可達到fM級。另外,相同含量的不同物質(zhì),由于自身化學性質(zhì)不同,質(zhì)譜的離子化效率、信號響應強度會差異很大。物質(zhì)的檢測靈敏度跟自身的化學性質(zhì)有關(guān),化學性質(zhì)的影響主要表現(xiàn)在離子化效率和質(zhì)譜碎裂行為兩方面。因此,相同含量的不同物質(zhì),可能一個能檢測出來,另一個檢測不出來。代謝組學研究對象大都是相對分子質(zhì)量1000以內(nèi)的小分子物質(zhì)。浙江個性化定制靶向代謝組學方法

相比于其他組學,代謝組學有哪些特殊的優(yōu)勢?湖北常規(guī)靶向代謝組學領(lǐng)域

靶向代謝組學的一般分析流程為:1. 數(shù)據(jù)采集 第1步是得到標準品。如果無法從市場上買到,就必須定制合成。然后通過優(yōu)化產(chǎn)物離子碰撞能量以得到的信號,再通過測定三重串聯(lián)四極桿測定代謝物的 MRM 躍遷值。2. 定量 接下來用定量分析軟件對 MRM 數(shù)據(jù)進行處理,得到報告。3. 統(tǒng)計分析和解釋 將定量報告輸入統(tǒng)計分析軟件包,用統(tǒng)計工具,如ANOVA,對數(shù)據(jù)進行處理。靶向分析:在基于質(zhì)譜的代謝組學分析中,要意識到離子強度和色譜保留時間都會隨著時間的推移而產(chǎn)生漂移,所以在實驗中,要按隨機順序?qū)颖具M行檢測,且數(shù)據(jù)需要在同天同一批次進行采集,以減少誤差。湖北常規(guī)靶向代謝組學領(lǐng)域

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