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山東蛋白質(zhì)翻譯后修飾組學(xué)有哪些

來(lái)源: 發(fā)布時(shí)間:2022-03-01

翻譯后修飾蛋白組:翻譯后修飾蛋白組分析是指在組學(xué)水平上對(duì)存在翻譯后修飾的蛋白質(zhì)進(jìn)行分析。翻譯后修飾蛋白組是指細(xì)胞或組織等整體水平上的翻譯后修飾蛋白。蛋白質(zhì)的翻譯后修飾(Post Translational Modifications, PTMs)是蛋白質(zhì)在翻譯中或翻譯后經(jīng)歷的一個(gè)共價(jià)加工過(guò)程。蛋白翻譯后修飾通過(guò)在一個(gè)或多個(gè)氨基酸殘基上加修飾基團(tuán)或通過(guò)蛋白質(zhì)水解去基團(tuán)而改變蛋白質(zhì)的性質(zhì),調(diào)節(jié)蛋白質(zhì)的功能。經(jīng)過(guò)翻譯后修飾的蛋白質(zhì)稱(chēng)為翻譯后修飾蛋白。目前,已知的蛋白質(zhì)翻譯后修飾主要包括糖基化、磷酸化、乙酰化、泛素化、二硫鍵配對(duì)、甲基化和亞硝基化等等。常見(jiàn)的蛋白質(zhì)翻譯后修飾包括泛素化。山東蛋白質(zhì)翻譯后修飾組學(xué)有哪些

蛋白質(zhì)乙酰化修飾組學(xué)技術(shù):乙?;揎検求w內(nèi)保守的可逆轉(zhuǎn)的蛋白修飾,對(duì)細(xì)胞核內(nèi)轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子的刺激有著重要的作用。此外,還存在的非組蛋白乙?;揎梾⑴c了代謝通路及代謝酶活性的調(diào)節(jié)。采用肽段預(yù)分離降低高豐度組蛋白對(duì)蛋白乙?;b定的影響,再結(jié)合免疫共沉淀通過(guò)抗體富集乙?;碾亩危瑥亩鴮?shí)現(xiàn)乙?;蔫b定及定量。樣品要求:1、SDS-PAGE條帶:5個(gè)以上可見(jiàn)考染條帶。2、溶液(目標(biāo)蛋白質(zhì)):目標(biāo)蛋白總量>50μg,目標(biāo)蛋白濃度>80%。3、溶液(大規(guī)模混合蛋白質(zhì)):蛋白總量>1mg,蛋白濃度>1μg/μl。貴州磷酸化修飾蛋白質(zhì)組學(xué)類(lèi)型泛素化修飾還可以直接影響蛋白質(zhì)的活性和定位。

蛋白質(zhì)學(xué)組翻譯后修飾的研究策略:目前,有幾種分析蛋白質(zhì)翻譯后修飾的策略,包括質(zhì)譜(MS)、Eastern blotting、放射性標(biāo)記和Western blotting。放射性標(biāo)記和Western blotting是比較傳統(tǒng)、特異性和相對(duì)定量的方法。該過(guò)程需要事先知道翻譯后修飾類(lèi)型。局限性包括抗體的特異性和可用性。質(zhì)譜技術(shù)也常被用于翻譯后修飾分析,不受修飾類(lèi)型和相關(guān)修飾位點(diǎn)的現(xiàn)有知識(shí)的限制。自下而上:自下而上的技術(shù)是蛋白質(zhì)組學(xué)研究中使用的質(zhì)譜策略之一。在根據(jù)序列鑒定肽之前,需要使用蛋白酶消化蛋白質(zhì)。由于該技術(shù)不能保證在檢測(cè)過(guò)程中被檢測(cè)肽的完整性和穩(wěn)定性,因此無(wú)法獲得不同蛋白質(zhì)翻譯后修飾之間關(guān)系的信息,這意味著它無(wú)法檢測(cè)到某些修飾。因此,該方法不適用于分析組蛋白的組合翻譯后修飾。

蛋白磷酸化修飾過(guò)程:蛋白磷酸化修飾這一過(guò)程是通過(guò)蛋白激酶催化,將磷酸基團(tuán)從ATP轉(zhuǎn)移到多肽底物的絲氨酸、蘇氨酸,或酪氨酸殘基上。并且磷酸化修飾的過(guò)程是可逆的,去磷酸化反應(yīng)由蛋白磷酸酶催化完成。蛋白磷酸化檢測(cè)方法:Western Blot檢測(cè)方法:Western Blot是檢測(cè)蛋白磷酸化水平的常用方法,主要過(guò)程為先利用SDS-PAGE分離蛋白質(zhì),隨后將蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)移到PVDF膜上,然后使用特異性識(shí)別磷酸化蛋白的抗體來(lái)鑒定目標(biāo)蛋白的磷酸化水平。只有被磷酸化修飾的蛋白才會(huì)在相應(yīng)分子質(zhì)量的地方顯現(xiàn)特異性蛋白條帶。蛋白質(zhì)翻譯后修飾的作用主要是改變蛋白質(zhì)的定位。

蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用是蛋白質(zhì)發(fā)揮功能的主要機(jī)制之一,在DNA損傷修復(fù),自噬和代謝等過(guò)程中都扮演著非常重要的角色,蛋白相互作用異常便會(huì)導(dǎo)致疾病的發(fā)生.在蛋白質(zhì)的賴(lài)氨酸,絲氨酸和蘇氨酸等氨基酸殘基上,可發(fā)生甲基化,乙?;?磷酸化和泛素化等200多種翻譯后修飾,這些修飾通常能改變蛋白質(zhì)的電性,疏水性和空間結(jié)構(gòu)等屬性,為與之結(jié)合的蛋白提供結(jié)合的錨定或產(chǎn)生位阻效應(yīng),像一把開(kāi)關(guān)在時(shí)空上精確調(diào)控蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用的發(fā)生以及動(dòng)態(tài)變化.結(jié)構(gòu)研究表明,蛋白質(zhì)之間的相互作用通常由臨近的幾個(gè)氨基酸殘基直接結(jié)合,替換該區(qū)域的氨基酸殘基,通常能破壞結(jié)合,使其失去部分功能或酶活性,可以針對(duì)性地開(kāi)發(fā)和設(shè)計(jì)抑制劑,用于疾病的診療。蛋白質(zhì)乙?;揎椊M學(xué)技術(shù)對(duì)細(xì)胞核內(nèi)轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子的刺激有著重要的作用。深圳蛋白質(zhì)丙?;揎椊M學(xué)鑒定

蛋白質(zhì)糖基化指碳水化合物通過(guò)共翻譯或翻譯后修飾的方式附著到蛋白質(zhì)上的過(guò)程。山東蛋白質(zhì)翻譯后修飾組學(xué)有哪些

蛋白質(zhì)乙?;揎椊M學(xué)定量分析:1. SILAC細(xì)胞標(biāo)記,組織/細(xì)胞破碎,提取、提純目的蛋白質(zhì)(基于SILAC的乙酰化修飾組學(xué)定量)。2. 使用胰蛋白酶將目的蛋白酶解成多肽片段。3. 對(duì)多肽片段進(jìn)行iTRAQ標(biāo)記(基于iTRAQ的乙?;揎椊M學(xué)定量)。4. 使用高效特異性乙?;贵w對(duì)乙酰化修飾肽段進(jìn)行免疫富集。5. 使用LC-MS/MS對(duì)富集的乙?;亩芜M(jìn)行序列分析。6. 數(shù)據(jù)分析,比對(duì)不同樣本中蛋白乙?;揎椝讲町?,并對(duì)產(chǎn)生變化的生物學(xué)意義進(jìn)行解釋。山東蛋白質(zhì)翻譯后修飾組學(xué)有哪些

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