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浙江蛋白質(zhì)亞硝基化修飾組學(xué)服務(wù)

來(lái)源: 發(fā)布時(shí)間:2022-03-08

蛋白質(zhì)磷酸化修飾鑒定方法:免疫印跡技術(shù):技術(shù)優(yōu)勢(shì)特點(diǎn)。1、 檢測(cè)特異性高。2、能夠特異鑒定單個(gè)磷酸化位點(diǎn)。同位素標(biāo)記(Isotope Labeled)結(jié)合免疫印跡法:此方法的原理是當(dāng)?shù)鞍装l(fā)生磷酸化時(shí),放射性32P的摻入和分子質(zhì)量變化引起的凝膠遷移(gelshift),再通過(guò)免疫印跡方法檢測(cè)同位素標(biāo)記,從而達(dá)到鑒定磷酸化蛋白的目的。技術(shù)優(yōu)勢(shì)特點(diǎn):1、檢測(cè)技術(shù)靈敏并且直觀。2、常用于體外磷酸化反應(yīng)結(jié)果檢測(cè)。3、 磷酸化鑒定不受抗體限制。4、可同時(shí)分析多個(gè)蛋白磷酸化。乙?;揎検求w內(nèi)保守的可逆轉(zhuǎn)的蛋白修飾。浙江蛋白質(zhì)亞硝基化修飾組學(xué)服務(wù)

蛋白質(zhì)翻譯后修飾在蛋白質(zhì)中磷酸化位點(diǎn)分析時(shí)應(yīng)該注意些什么問(wèn)題?覆蓋率:覆蓋率越高,檢測(cè)和鑒定含有修飾基團(tuán)的肽幾率就越大。修飾位點(diǎn)的占有率:被修飾的蛋白質(zhì)的百分比低,則檢測(cè)到修飾肽的機(jī)會(huì)會(huì)隨之減少。如果百分比較高(> 30%),則有助于識(shí)別修飾位點(diǎn)。棕櫚酰化蛋白修飾質(zhì)譜鑒定方法:S-棕櫚?;闹饕δ苁谴龠M(jìn)蛋白質(zhì)與細(xì)胞膜的結(jié)合。蛋白質(zhì)可以由一個(gè)棕櫚?;M成,也可以與更多棕櫚基或與其他脂質(zhì),如豆蔻?;S捎趯?duì)S-棕櫚?;鞍追治鋈匀痪哂刑魬?zhàn)性,由于S-棕櫚酰化修飾蛋白亞水平以及疏水性和潛在不穩(wěn)定的硫代質(zhì)鏈的S-脂酰化肽?,F(xiàn)在常用的幾種方法可以捕獲S-脂酰化蛋白以及對(duì)目標(biāo)修飾蛋白進(jìn)行捕獲。浙江蛋白質(zhì)亞硝基化修飾組學(xué)服務(wù)常見(jiàn)的蛋白質(zhì)翻譯后修飾包括糖基化。

蛋白質(zhì)修飾位點(diǎn)分析:基于LC-MS/MS分析能夠精確測(cè)定蛋白質(zhì)或多肽分子質(zhì)量這一特性,從而檢測(cè)蛋白質(zhì)或者多肽上位點(diǎn)發(fā)生何種修飾??蓹z測(cè)修飾類型如下: 磷酸化、糖基化、乙?;?、泛素化、丙酰化、丁酰化、丙二酰化、戊二酰化、琥珀?;?、單甲基化、二甲基化、三甲基化。1、磷酸化:信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)、細(xì)胞周期、生長(zhǎng)發(fā)育機(jī)理等;2、糖基化:蛋白質(zhì)折疊、更新以及免疫應(yīng)答等;3、乙酰化:基因表達(dá)調(diào)控、細(xì)胞凋亡、細(xì)胞代謝、蛋白質(zhì)穩(wěn)定性以及神經(jīng)退行性的病變等;4、泛素化:細(xì)胞周期、細(xì)胞凋亡、轉(zhuǎn)錄調(diào)控、DNA修復(fù)以及信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)等;5、甲基化:染色質(zhì)結(jié)構(gòu)及轉(zhuǎn)錄調(diào)控等;6、丙酰化 / 丙二?;?/ 戊二?;?/ 琥珀酰化:主要存在于線粒體和細(xì)菌中,與代謝過(guò)程密切相關(guān)。

蛋白翻譯后修飾:蛋白質(zhì)氨基酸序列的特定位置可以與化學(xué)基團(tuán)或者小分子量的蛋白共價(jià)結(jié)合從而發(fā)生蛋白質(zhì)翻譯后修飾(post-translational modifications,PTMs)。翻譯后修飾是蛋白質(zhì)生物合成的一個(gè)步驟,翻譯后多肽鏈在成為成熟的蛋白質(zhì)產(chǎn)品之前要經(jīng)過(guò)修飾,PTMs的類型包括磷酸化、乙?;⑻腔?、泛素化和二硫鍵等等,它導(dǎo)致蛋白質(zhì)組復(fù)雜性的大幅增加。對(duì)于任何給定的蛋白質(zhì),各種各樣的PTMs提供了一種通過(guò)改變蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)和功能來(lái)促進(jìn)細(xì)胞快速變化的方法。PTMs在信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)、蛋白質(zhì)穩(wěn)定性和周轉(zhuǎn)率、蛋白質(zhì)與蛋白質(zhì)識(shí)別和相互作用以及空間定位中起著至關(guān)重要的作用。蛋白質(zhì)的翻譯后修飾調(diào)控著底物的酶活性、功能以及三級(jí)結(jié)構(gòu)的變化。

蛋白質(zhì)學(xué)組翻譯后修飾的研究策略:目前,有幾種分析蛋白質(zhì)翻譯后修飾的策略,包括質(zhì)譜(MS)、Eastern blotting、放射性標(biāo)記和Western blotting。放射性標(biāo)記和Western blotting是比較傳統(tǒng)、特異性和相對(duì)定量的方法。該過(guò)程需要事先知道翻譯后修飾類型。局限性包括抗體的特異性和可用性。質(zhì)譜技術(shù)也常被用于翻譯后修飾分析,不受修飾類型和相關(guān)修飾位點(diǎn)的現(xiàn)有知識(shí)的限制。自下而上:自下而上的技術(shù)是蛋白質(zhì)組學(xué)研究中使用的質(zhì)譜策略之一。在根據(jù)序列鑒定肽之前,需要使用蛋白酶消化蛋白質(zhì)。由于該技術(shù)不能保證在檢測(cè)過(guò)程中被檢測(cè)肽的完整性和穩(wěn)定性,因此無(wú)法獲得不同蛋白質(zhì)翻譯后修飾之間關(guān)系的信息,這意味著它無(wú)法檢測(cè)到某些修飾。因此,該方法不適用于分析組蛋白的組合翻譯后修飾。蛋白質(zhì)翻譯后修飾的作用主要是改變蛋白質(zhì)的功能。四川蛋白質(zhì)棕櫚?;揎椊M學(xué)方法

泛素化修飾是一種重要的翻譯后修飾。浙江蛋白質(zhì)亞硝基化修飾組學(xué)服務(wù)

翻譯后修飾蛋白組:翻譯后修飾蛋白組分析是指在組學(xué)水平上對(duì)存在翻譯后修飾的蛋白質(zhì)進(jìn)行分析。翻譯后修飾蛋白組是指細(xì)胞或組織等整體水平上的翻譯后修飾蛋白。蛋白質(zhì)的翻譯后修飾(Post Translational Modifications, PTMs)是蛋白質(zhì)在翻譯中或翻譯后經(jīng)歷的一個(gè)共價(jià)加工過(guò)程。蛋白翻譯后修飾通過(guò)在一個(gè)或多個(gè)氨基酸殘基上加修飾基團(tuán)或通過(guò)蛋白質(zhì)水解去基團(tuán)而改變蛋白質(zhì)的性質(zhì),調(diào)節(jié)蛋白質(zhì)的功能。經(jīng)過(guò)翻譯后修飾的蛋白質(zhì)稱為翻譯后修飾蛋白。目前,已知的蛋白質(zhì)翻譯后修飾主要包括糖基化、磷酸化、乙?;?、泛素化、二硫鍵配對(duì)、甲基化和亞硝基化等等。浙江蛋白質(zhì)亞硝基化修飾組學(xué)服務(wù)

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