蛋白磷酸化檢測方法:一、Western Blot檢測方法優(yōu)勢:1. WB方法簡便,多數(shù)實驗室具備Western Blot設(shè)備條件。2. 許多磷酸化抗體十分靈敏,能夠檢測低至10ug的蛋白樣品。3. 對于豐度低的蛋白,可以先通過IP使用目標(biāo)蛋白的抗體對目標(biāo)蛋白進行富集,再進行WB檢測被磷酸化的蛋白,檢測效率可以提高幾倍甚至幾十倍。二、質(zhì)譜檢測方法:Western Blot的方法雖然簡便,但是對于大規(guī)模分析復(fù)雜的生物樣品的磷酸化水平就不再適用了。而質(zhì)譜卻能很好的解決這一問題。依靠高準(zhǔn)確度質(zhì)譜儀,如今快速準(zhǔn)確分析細(xì)胞中高豐度蛋白的磷酸化修飾已是非常簡單的事。具體的檢測方法為先通過SDS-PAGE膠,或者2D-PAGE膠等分離目標(biāo)蛋白,將含有目標(biāo)蛋白的條帶切下,胰酶消化,LC-MS/MS檢測分析蛋白序列和相應(yīng)位點的磷酸化修飾。這個方法適用于同時檢測多個目標(biāo)蛋白的磷酸化水平。常見的蛋白質(zhì)翻譯后修飾包括乙酰化。深圳糖基化修飾蛋白質(zhì)組學(xué)分析價格
蛋白質(zhì)磷酸化修飾類型:根據(jù)磷酸氨基酸殘基的不同,可將磷酸化蛋白質(zhì)分為4類,即O-磷酸鹽蛋白質(zhì)、N-磷酸鹽蛋白質(zhì)、?;姿猁}蛋白質(zhì)和S-磷酸鹽蛋白質(zhì)。1、O-磷酸鹽蛋白質(zhì)通過羥氨基酸(如絲氨酸、蘇氨酸或酪氨酸)的磷酸化形成。2、 N-磷酸鹽蛋白質(zhì)通過精氨酸、賴氨酸或組氨酸的磷酸化形成。3、 ?;姿猁}蛋白質(zhì)通過天冬氨酸或谷氨酸的磷酸化形成。4、 S-磷酸鹽蛋白質(zhì)通過半胱氨酸磷酸化形成。蛋白質(zhì)磷酸化修飾鑒定方法:免疫印跡技術(shù)是在凝膠電泳和固相免疫測定技術(shù)基礎(chǔ)上發(fā)展起來的、根據(jù)特定抗原-抗體的特異性反應(yīng)來檢測復(fù)雜樣品中的某種蛋白質(zhì)的免疫生化分析方法。廣東甲基化修飾蛋白質(zhì)組學(xué)價錢泛素化修飾還可以直接影響蛋白質(zhì)的活性和定位。
蛋白質(zhì)翻譯后修飾組學(xué):蛋白質(zhì)翻譯后修飾(Post-translational modification, PTM)是指對翻譯后的蛋白質(zhì)進行共價加工的過程。它通過在一個或多個氨基酸殘基加上修飾基團,可以改變蛋白質(zhì)的物理、化學(xué)性質(zhì),進而影響蛋白質(zhì)的空間構(gòu)象和活性狀態(tài)、亞細(xì)胞定位、折疊及其穩(wěn)定性以及蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用。蛋白質(zhì)翻譯后修飾的豐度變化在生命活動研究中具有重大意義,異常的翻譯后修飾會導(dǎo)致多種疾病的發(fā)生。質(zhì)譜可以分辨蛋白質(zhì)修飾前和修飾后分子量上的變化,因此只要知道靶蛋白翻譯后修飾前后分子量的變化,就能對翻譯后修飾方式進行鑒定和定量。
蛋白質(zhì)乙酰化修飾定義:蛋白質(zhì)在細(xì)胞中經(jīng)過翻譯后,到被運輸?shù)较鄳?yīng)的細(xì)胞器并且發(fā)生特定的生物學(xué)作用前會經(jīng)過很重要的一步加工,那就是蛋白質(zhì)翻譯后修飾加工。蛋白質(zhì)翻譯后修飾的作用主要是改變蛋白質(zhì)的活性、定位或功能。通過蛋白質(zhì)翻譯后修飾也進一步增加了細(xì)胞通路機制和生命活動的多樣性和復(fù)雜性。常見的蛋白質(zhì)翻譯后修飾包括磷酸化,乙酰化,糖基化,泛素化等。蛋白質(zhì)乙酰化修飾,顧名思義指的就是在蛋白質(zhì)原有基礎(chǔ)上面嫁接上乙?;鶊F。在細(xì)胞中,乙酰化修飾的反應(yīng)由乙?;D(zhuǎn)移酶所催化,將乙酰輔酶A的乙?;D(zhuǎn)移并添加在蛋白質(zhì)賴氨酸殘基上。在早期的研究中,乙?;揎椧恢北徽J(rèn)為是真核細(xì)胞所特有的一種翻譯后修飾,直到后來研究發(fā)現(xiàn)原核細(xì)胞中年也存在著蛋白質(zhì)乙酰化修飾。所以,乙?;揎検窃撕驼婧松锼灿械囊环N翻譯后修飾類型。蛋白質(zhì)磷酸化修飾組學(xué)具有全方面性。
翻譯后修飾蛋白組學(xué)分析:在蛋白翻譯后修飾方式的鑒定過程中,蛋白會首先被酶切成肽段,然后進入質(zhì)譜進行分析。通過質(zhì)譜分析,得到的是一系列肽段的分子質(zhì)量信息。對于某一個特定肽段而言,在沒有發(fā)生任何翻譯后修飾的情況下,其序列信息和分子量是確定的。當(dāng)它發(fā)生了某種翻譯后修飾之后,例如磷酸化修飾,由于序列信息和分子量是確定的,磷酸根的分子量也是確定的。在質(zhì)譜檢測過程中發(fā)現(xiàn)其中的部分肽段的分子量剛好增加了一個磷酸根的分子量,假設(shè)這個肽段就發(fā)生了磷酸化修飾,再通過二級質(zhì)譜圖進行二次確認(rèn)。蛋白質(zhì)有哪些翻譯后修飾?湖北丙?;揎椀鞍踪|(zhì)組學(xué)質(zhì)譜鑒定
質(zhì)譜是蛋白質(zhì)翻譯后修飾檢測的常用技術(shù)之一。深圳糖基化修飾蛋白質(zhì)組學(xué)分析價格
質(zhì)譜分析蛋白翻譯后修飾:相對于蛋白質(zhì)印跡等技術(shù),質(zhì)譜技術(shù)能更有效的對蛋白質(zhì)的翻譯后修飾進行分析,且可以對常規(guī)的Western blot 翻譯后修飾蛋白鑒定進行補充。質(zhì)譜分析蛋白翻譯后修飾一般使用自下而上的基于肽段的方法。但是自下而上的質(zhì)譜方法無法保證可以完全識別目的蛋白的特定翻譯后修飾,因為質(zhì)譜是通過蛋白質(zhì)序列內(nèi)的多個肽段來鑒定的,這很大程度上降低了翻譯后修飾肽段被識別的機會。一種提高質(zhì)譜儀檢測到修飾肽段數(shù)量的策略是使用PTM親和試劑進行肽段富集,而不是使用PTM親和試劑進行蛋白富集,這將減少富集的未修飾肽段的數(shù)量。深圳糖基化修飾蛋白質(zhì)組學(xué)分析價格
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