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深圳SmalIRNA轉錄組學技術分析

來源: 發(fā)布時間:2022-04-02

什么叫轉錄組學?廣義轉錄組是指生命單元(通常是一種細胞)中所有按基因信息單元轉錄和加工的RNA分子(包括編碼和非編碼RNA功能單元),或者是一個特定細胞所有轉錄本的總和.它的研究對象就是這些RNA與蛋白質分子和它們所組成的基因功能網(wǎng)絡以及它們與細胞功能的關系.而狹義轉錄組是指可直接參與翻譯蛋白質的mRNA總和.研究生物細胞中轉錄組的發(fā)生和變化規(guī)律的科學就稱為轉錄組學(tran—scriptomics)。轉錄組學即特定細胞在某一功能狀態(tài)下轉錄出來的所有RNA的總和,包括mRNA和非編碼RNA。轉錄組學包括:mRNA、ncRNA、rRNA等。深圳SmalIRNA轉錄組學技術分析

轉錄組學即特定細胞在某一功能狀態(tài)下轉錄出來的所有RNA的總和,包括mRNA和非編碼RNA。轉錄組學(transcriptomics),是一門在整體水平上研究細胞中基因轉錄的情況及轉錄調(diào)控規(guī)律的學科。簡而言之,轉錄組學是從RNA水平研究基因表達的情況。轉錄組即一個活細胞所能轉錄出來的所有RNA的總和,是研究細胞表型和功能的一個重要手段。轉錄組學(transcriptomics),是一門在整體水平上研究細胞中基因轉錄的情況及轉錄調(diào)控規(guī)律的學科。簡而言之,轉錄組學是從RNA水平研究基因表達的情況。杭州單細胞轉錄組學分析鑒定轉錄組學能夠同時鑒定和定量稀有轉錄本和正常轉錄本。

全轉錄組測序為什么需要構建兩個文庫?全轉錄組測序需要構建2個測序文庫,一個小RNA文庫和一個去除核糖體RNA的鏈特異性文庫,然后分別上機測序。小RNA長度較短,一般小于50nt,采用測序策略為50SE。其他三類RNA序列一般大于200,通常在1000以上,可達幾萬,通過片段化構建150PE測序文庫。然后小RNA文庫可以獲得miRNA序列信息,去核糖體的鏈特異性文庫可以獲得mRNA、lncRNA和circRNA的序列信息。轉錄組學即特定細胞在某一功能狀態(tài)下轉錄出來的所有RNA的總和,包括mRNA和非編碼RNA。

轉錄組學測序類型:1.根據(jù)RNA種類:可以分為mRNA測序,SmallRNA測序,LncRNA測序、CircRNA測序、全轉錄組測序等。2.根據(jù)物種特點:比如真核生物或者原核生物,是否有參考基因組,測序平臺的不同,分為真核有參和無參轉錄組測序,原核轉錄組測序,全長轉錄組測序等。3.根據(jù)相互關系:分為互作轉錄組,比較轉錄組等等;此外,基因組甲基化會影響到基因的轉錄調(diào)控,也屬于轉錄調(diào)控測序范疇;還有用于研究轉錄因子與DNA的交互作用或組蛋白修飾在基因組上的分布的ChIP-Seq,研究RNA與蛋白互作關系的RIP-Seq,以及研究RNA甲基化的MeRIP-Seq等。轉錄組學可應用于基因點突變及多態(tài)性檢測。

轉錄組學(transcriptomics)是功能基因組學(FunctionalGenomics)研究的重要組成部分,是一門在整體水平上研究細胞中所有基因轉錄及轉錄調(diào)控規(guī)律的學科。隨著人類基因組計劃HGP(HumanGenomeProject)的完成,科學家也逐漸認識到對基因結構序列的研究只是基因組學研究的一部分,并不能揭示所有的生命奧秘,所以接下來需要解決的問題是:研究這些基因序列的功能、參與的生命過程、表達調(diào)控方式,以及這些基因在不同的時空條件下的表達差異等。這些問題都需要功能基因組學技術來解決,而轉錄組學技術是功能基因組學研究的重要組成部分。對基因及其轉錄表達產(chǎn)物功能研究的功能基因組學,將為疾病控制和新藥開發(fā)、作物和畜禽品種的改良提供新思路,為人類解決健康問題、食物問題、能源問題和環(huán)境問題提供新方法。轉錄組學測序的研究對象為特定細胞在某一功能狀態(tài)下所能轉錄出來的所有RNA的總和。杭州全轉錄學組分析

轉錄學組測序是目前深入研究轉錄組復雜性的強大工具。深圳SmalIRNA轉錄組學技術分析

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