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山東動物靶向代謝組學(xué)分析研究

來源: 發(fā)布時間:2022-04-10

代謝組學(xué)可以檢測的樣品種類有哪些?代謝組學(xué)主要研究的是作為各種代謝路徑的底物和產(chǎn)物的小分子代謝物(分子量<1000)。其樣品主要是血漿或血清,尿液,唾液,以及細胞和組織的提取液。我們也和一些公司或單位(如茶葉公司、制酒公司、酸奶公司、醫(yī)院等)合作,做過植物,微生物提取物,腦脊液,昆蟲血淋巴,羊水,卵泡液,膝蓋滑液,眼淚,胎盤,糞便及腸道內(nèi)容物提取液等。一般代謝組學(xué)能檢測出多少物質(zhì)?不同的質(zhì)譜平臺靈敏度及偏向性都不一樣,而且不同平臺之間具有互補性。一般來說GC/MS檢測血清樣品能準確定性的物質(zhì)約200個左右,檢測尿液樣品定性的物質(zhì)約200個左右,其他樣品(如肝臟,糞便,腸道內(nèi)容物)也在幾百這個數(shù)量級。代謝組學(xué)主要技術(shù)手段是色譜(HPLC,GC)。山東動物靶向代謝組學(xué)分析研究

為什么選擇代謝組學(xué)作為科研技術(shù)手段?1)小分子的產(chǎn)生和代謝是生物機體作用的結(jié)果,生物體液的代謝產(chǎn)物分析能夠更直接,更準確的反映生物體的病理生理狀態(tài)。2)基因和蛋白質(zhì)表達的有效微小變化會在代謝物上得到放大,從而使檢測更容易;3)代謝組學(xué)的代謝物信息庫簡單,但它遠沒有全基因組測序及大量表達序列標簽的數(shù)據(jù)庫那么復(fù)雜;4)代謝物的種類少,要遠小于基因和蛋白質(zhì)的數(shù)據(jù),物質(zhì)的分子結(jié)構(gòu)要簡單得多。5)代謝產(chǎn)物在各個生物體系中都是類似的,所以代謝組學(xué)研究中采用的技術(shù)更容易在各個領(lǐng)域中通用,也更容易被人接受。杭州個性化定制靶向代謝組學(xué)定量分析代謝組學(xué)的研究方法與蛋白質(zhì)組學(xué)的方法類似,通常有兩種方法。

代謝組學(xué)疾病診斷應(yīng)用:與基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)相比, 代謝組學(xué)的研究側(cè)重于相關(guān)特定組分的共性,是要涉及研究每一個代謝組分的共性、特性和規(guī)律,目前據(jù)此目標相距甚遠。盡管充滿了挑戰(zhàn),研究人員仍然堅信,與基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)相比,代謝組學(xué)與生理學(xué)的聯(lián)系更加緊密。疾病導(dǎo)致機體病理生理過程變化,引起代謝產(chǎn)物發(fā)生相應(yīng)的改變,通過對某些代謝產(chǎn)物進行分析,并與 正常人的代謝產(chǎn)物比較,尋找疾病的生物標記物,將提供一種較好的疾病診斷方法。

代謝組學(xué)的概念:代謝組學(xué)的概念來源于代謝組,代謝組是指某一生物或細胞在一特定生理時期內(nèi)所有的低分子量代謝產(chǎn)物,代謝組學(xué)則是對某一生物或細胞在一特定生理時期內(nèi)所有低分子量代謝產(chǎn)物同時進行定性和定量分析的一門新學(xué)科。它是以組群指標分析為基礎(chǔ),以高通量檢測和數(shù)據(jù)處理為手段,以信息建模與系統(tǒng)整合為目標的系統(tǒng)生物學(xué)的一個分支。 代謝組學(xué)主要研究的是作為各種代謝路徑的底物和產(chǎn)物的小分子代謝物(MW<1000)。 在食品安全領(lǐng)域,利用代謝組學(xué)工具發(fā)現(xiàn)農(nóng)獸藥等在動植物體內(nèi)的相關(guān)生物標志物也是一個熱點領(lǐng)域。其樣品主要是動植物的細胞和組織的提取液。主要技術(shù)手段是核磁共振,質(zhì)譜,色譜,其中以NMR為主。通過檢測一系列樣品的NMR 譜圖,再結(jié)合模式識別方法,可以判斷出生物體的病理生理狀態(tài),并有可能找出與之相關(guān)的生物標志物。為相關(guān)預(yù)警信號提供一個預(yù)知平臺。選擇代謝組學(xué)作為科研技術(shù)手段的優(yōu)勢有哪些?

靶向代謝組學(xué)分析成功的關(guān)鍵因素是準確度、高通量和可靠性。靶向代謝組學(xué)鑒定一般采用 GC/MS 系統(tǒng)的選擇性離子監(jiān)測 (SIM),或在三重串聯(lián)四極桿 LC/MS 系統(tǒng)上用多反應(yīng)離子監(jiān)測 (MRM) 進行靶向 MS/MS。SIM 比全掃描圖譜采集具有更高的靈敏度,在單四極桿質(zhì)譜中,這種靈敏度增強的原因是延長了所選擇離子的采集時間。因為監(jiān)測的是一個很小的質(zhì)量窗口,所以質(zhì)量色譜圖只表示對極為特定質(zhì)量的檢測。在大多數(shù)情況下,靈敏度可以提高 10 倍。MRM 是進行質(zhì)譜定量的選擇方法,與 SIM 相比更為靈敏、更加特異??梢援a(chǎn)生獨特的碎片離子,可對非常復(fù)雜基質(zhì)中的目標化合物進行監(jiān)測和定量。代謝組學(xué)的研究介于基因、蛋白質(zhì)和細胞、組織之間。廣州LC-MS/MS非靶向代謝組學(xué)費用

代謝組學(xué)是對某一生物或細胞中相對分子量小于1,000的小分子代謝產(chǎn)物進行定性和定量分析的一門新學(xué)科。山東動物靶向代謝組學(xué)分析研究

代謝組學(xué)有哪些特點?(1) 代謝處于系統(tǒng)生物學(xué)的末端,更能反映基因與外部環(huán)境互作的真實情況,因此,在多數(shù)生物表型研究上更加適用。(2) 常規(guī)代謝組學(xué)只關(guān)注內(nèi)源性化合物,也有使用代謝組學(xué)技術(shù)測定外源性化合物的。內(nèi)源性化合物的上調(diào)和下調(diào)指示了與疾病、毒性、基因修飾或環(huán)境因子的影響。(3) 高通量定量和定性研究生物小分子化合物。(4) 內(nèi)源性化合物的結(jié)果可以作為疾病的診斷、藥物篩選或者其他分型評估等潛在生物標志物。謝組學(xué)通過揭示內(nèi)在和外在因素影響下,生物體的代謝整體的變化軌跡來反映某種生理或病理的一系列發(fā)展過程。山東動物靶向代謝組學(xué)分析研究