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浙江新型修飾蛋白組學(xué)研究

來(lái)源: 發(fā)布時(shí)間:2022-04-10

LabelFree(非標(biāo)記蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)):在非標(biāo)記策略的定量模型中,主要涉及兩種不同的算法:其一,以肽段的色譜峰積分面積為基礎(chǔ),通過(guò)比較一對(duì)生物樣品中相對(duì)應(yīng)到蛋白質(zhì)酶解多肽的色譜積分面積而得到兩者的相對(duì)豐度;其二,以肽段被質(zhì)譜檢測(cè)的計(jì)數(shù)為基礎(chǔ),通過(guò)歸一化來(lái)表征被檢測(cè)蛋白質(zhì)的相對(duì)豐度。非標(biāo)記技術(shù)認(rèn)為肽段在質(zhì)譜中被捕獲檢測(cè)的頻率(Counts)與其在混合物中的豐度成正相關(guān),因此蛋白質(zhì)被質(zhì)譜檢測(cè)的計(jì)數(shù)反映了蛋白質(zhì)的豐度,通過(guò)適當(dāng)?shù)臄?shù)學(xué)公式可以將質(zhì)譜檢測(cè)計(jì)數(shù)與蛋白質(zhì)的量聯(lián)系起來(lái),從而對(duì)蛋白質(zhì)進(jìn)行定量。蛋白質(zhì)組學(xué)可系統(tǒng)研究農(nóng)作物在特定環(huán)境或某個(gè)發(fā)育階段的組織中蛋白質(zhì)的表達(dá)變化。浙江新型修飾蛋白組學(xué)研究

蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)發(fā)展方面:蛋白質(zhì)組學(xué)的研究方法將出現(xiàn)多種技術(shù)并存,各有優(yōu)勢(shì)和局限的特點(diǎn),而難以象基因組研究一樣形成比較一致的方法。除了發(fā)展新方法外,更強(qiáng)調(diào)各種方法間的整合和互補(bǔ),以適應(yīng)不同蛋白質(zhì)的不同特征。另外,蛋白質(zhì)組學(xué)與其它學(xué)科的交叉也將日益明顯和重要,這種交叉是新技術(shù)新方法的活水之源,特別是,蛋白質(zhì)組學(xué)與其它大規(guī)??茖W(xué)如基因組學(xué),生物信息學(xué)等領(lǐng)域的交叉,構(gòu)成組學(xué)(omics)生物技術(shù)研究方法,所呈現(xiàn)出的系統(tǒng)生物學(xué)(System Biology)研究模式,將成為未來(lái)生命科學(xué)比較令人激動(dòng)的新前沿。四川Label free非標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組學(xué)研究?jī)?nèi)容DIA 定量蛋白質(zhì)組學(xué)是高通量,能同時(shí)監(jiān)測(cè)所有目標(biāo)蛋白。

蛋白質(zhì)組學(xué)(英語(yǔ):proteomics,又譯作蛋白質(zhì)體學(xué)),是以蛋白質(zhì)組為研究對(duì)象,研究細(xì)胞、組織或生物體蛋白質(zhì)組成及其變化規(guī)律的科學(xué)。蛋白質(zhì)組學(xué)研究不只是探索生命奧秘的必須工作,也能為人類(lèi)健康事業(yè)帶來(lái)巨大的利益,是生命科學(xué)進(jìn)入后基因時(shí)代的特征。蛋白質(zhì)是生命存在和運(yùn)動(dòng)的物質(zhì)基礎(chǔ),是細(xì)胞增殖、分化、衰老和凋亡等重大生命活動(dòng)的執(zhí)行者,亦是基因功能活動(dòng)的之后的執(zhí)行者,是生命現(xiàn)象復(fù)雜性和多變性的直接體現(xiàn)者。蛋白質(zhì)組研究是為了識(shí)別及鑒定一個(gè)細(xì)胞或組織所表達(dá)的全部蛋白質(zhì)以及它們的表達(dá)模式,是對(duì)基因組研究的重要補(bǔ)充,是對(duì)生物體在蛋白質(zhì)水平上定量、動(dòng)態(tài)、整體性的研究。這類(lèi)研究有助于了解蛋白的結(jié)構(gòu)、細(xì)胞的功能、生命的本質(zhì)及活動(dòng)規(guī)律,為疾病的診斷、疫苗及新藥開(kāi)發(fā)提供科學(xué)依據(jù)。

蛋白質(zhì)組學(xué)在生物學(xué)領(lǐng)域的研究中的應(yīng)用是怎樣的?研究對(duì)象涉及到生物體且生物體內(nèi)表達(dá)蛋白,理論上都可以應(yīng)用蛋白質(zhì)組學(xué)。蛋白質(zhì)組學(xué)是以研究生物體蛋白組成及其變化規(guī)律為目的的應(yīng)用科學(xué)。主要使用的儀器為液質(zhì)聯(lián)用高分辨率質(zhì)譜儀。詳細(xì)來(lái)說(shuō),蛋白質(zhì)組學(xué)包含許多分支:非標(biāo)定量蛋白質(zhì)組學(xué)(定性研究生物體的蛋白組成),定量蛋白質(zhì)組學(xué)(對(duì)生物體蛋白表達(dá)含量進(jìn)行測(cè)定),修飾蛋白質(zhì)組學(xué)(對(duì)蛋白質(zhì)翻譯后修飾進(jìn)行檢測(cè))及相互作用蛋白質(zhì)組研究(蛋白質(zhì)直接相互作用機(jī)制解析)等。蛋白質(zhì)組學(xué)屬于后基因組時(shí)代的科學(xué)研究,針對(duì)基因表達(dá)產(chǎn)物進(jìn)行檢測(cè)與定量。因此更能反應(yīng)出生物體生理?xiàng)l件下的水平與狀態(tài)。蛋白質(zhì)組學(xué)本質(zhì)上指的是在大規(guī)模水平上研究蛋白質(zhì)的特征。

蛋白質(zhì)組學(xué)介紹:蛋白質(zhì)組學(xué),指對(duì)某一基因組所表達(dá)的所有蛋白質(zhì)及其特征進(jìn)行大規(guī)模、系統(tǒng)化地研究,以期望在蛋白質(zhì)水平上解釋控制復(fù)雜的生命活動(dòng)的分子網(wǎng)絡(luò)。研究的內(nèi)容主要包括:組成蛋白質(zhì)一級(jí)結(jié)構(gòu)氨基酸的序列特征、蛋白質(zhì)的豐度、蛋白質(zhì)活性、蛋白質(zhì)的修飾、亞細(xì)胞定位和三維結(jié)構(gòu)、蛋白質(zhì)之間的相互作用以及對(duì)蛋白質(zhì)的高階復(fù)合物結(jié)構(gòu)。蛋白質(zhì)組主要通過(guò)蛋白質(zhì)雙向電泳、氨基酸序列測(cè)定、質(zhì)譜、生物信息等方法,研究某個(gè)基因組對(duì)應(yīng)的所有蛋白質(zhì)特征,包括蛋白質(zhì)含量、亞細(xì)胞定位、活性以及蛋白修飾等內(nèi)容。什么樣本能做蛋白組學(xué)檢測(cè)?濟(jì)南定量N糖基化蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)

蛋白質(zhì)組學(xué)由此獲得蛋白質(zhì)水平上的關(guān)于疾病發(fā)生,細(xì)胞代謝等過(guò)程的整體而全方面的認(rèn)識(shí)。浙江新型修飾蛋白組學(xué)研究

定量蛋白質(zhì)組學(xué)方法學(xué)介紹:Label-free:Label-free定量,即非標(biāo)記的定量蛋白質(zhì)組學(xué),不需要對(duì)比較樣本做特定標(biāo)記處理,只需要比較特定肽段/蛋白在不同樣品間的色譜質(zhì)譜響應(yīng)信號(hào)便可得到樣品間蛋白表達(dá)量的變化,通常用于分析大規(guī)模蛋白鑒定和定量時(shí)所產(chǎn)生的質(zhì)譜數(shù)據(jù)。Label-free定量不需要標(biāo)記處理,操作簡(jiǎn)單,可以做任意樣本的總蛋白質(zhì)差異定量,但對(duì)實(shí)驗(yàn)操作的穩(wěn)定性、重復(fù)性要求較高,準(zhǔn)確性也較標(biāo)記定量差。因此,Label-free技術(shù)適合于大樣本量的定量比較,以及對(duì)無(wú)法用標(biāo)記定量實(shí)現(xiàn)的實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)。浙江新型修飾蛋白組學(xué)研究