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蛋白質(zhì)組學(xué)的重要應(yīng)用領(lǐng)域有:在臨床疾病中的應(yīng)用、在微生物蛋白質(zhì)組學(xué)中的應(yīng)用、在植物研究中的應(yīng)用、在腎臟病學(xué)領(lǐng)域的應(yīng)用。我們通過研究蛋白質(zhì)組,可以為患者提供有用的疾病診斷、預(yù)后評估信息;可以早期更為準(zhǔn)確的診斷出胰腺病;也可以為AD的診斷、治理藥物的設(shè)計(jì)和篩選奠定基礎(chǔ)。這項(xiàng)研究技術(shù)其實(shí)離我們生活非常近,對我們生命而言尤為重要。近年來,高通量蛋白質(zhì)分離與鑒定技術(shù),如雙向電泳、生物質(zhì)譜、蛋白質(zhì)芯片、酵母雙雜交系統(tǒng)、生物信息學(xué)等相繼建立并日趨完善,加速了蛋白質(zhì)組學(xué)的發(fā)展。蛋白質(zhì)組學(xué)可以通過系統(tǒng)性地研究蛋白質(zhì)表達(dá)和翻譯后修飾變化對疾病的影響。深圳PRM靶向定量蛋白質(zhì)組學(xué)一般流程
蛋白質(zhì)組學(xué)在醫(yī)療和健康方面有什么應(yīng)用?具體而言,蛋白質(zhì)組學(xué)在此類應(yīng)用中,更多地用于提供高通量蛋白質(zhì)定性定量信息。作為檢測手段的蛋白質(zhì)組學(xué):事實(shí)上,在當(dāng)前的生物醫(yī)學(xué)研究和臨床診斷中,蛋白質(zhì)組學(xué)相關(guān)技術(shù)有非常多的應(yīng)用。因?yàn)榈鞍踪|(zhì)組學(xué)技術(shù)的本質(zhì)(從分析化學(xué)角度來看),就是對蛋白質(zhì)的定性定量分析。生物醫(yī)學(xué)和臨床診斷中,需要大量表征一種或多種蛋白質(zhì)的含量、氨基酸序列、翻譯后修飾等信息。蛋白質(zhì)組學(xué)相關(guān)技術(shù)目前在一小部分]應(yīng)用中具有獨(dú)特優(yōu)勢。有很多蛋白質(zhì)組學(xué)的研究者在工業(yè)界和醫(yī)院進(jìn)行相關(guān)研究和日常工作。很容易發(fā)現(xiàn),當(dāng)前蛋白質(zhì)組學(xué)的臨床應(yīng)用更多地集中在第二類。第1類的應(yīng)用更接近于生物醫(yī)學(xué)基礎(chǔ)研究,目前還沒有和大部分人的現(xiàn)實(shí)生活產(chǎn)生關(guān)系。貴陽修飾蛋白組學(xué)研究方法蛋白質(zhì)組學(xué)的研究方法將出現(xiàn)多種技術(shù)并存,各有優(yōu)勢和局限的特點(diǎn)。
蛋白質(zhì)組結(jié)果一般需要做哪些方面的生物信息學(xué)分析?目前一般文獻(xiàn)中的分析主要為維恩圖分析、熱圖分析、火山圖分析、層次聚類分析、蛋白質(zhì)功能分析(GO分類為主)、蛋白質(zhì)所屬代謝通路富集分析(基于KEGG的pathway)、差異蛋白互作網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建、轉(zhuǎn)錄因子預(yù)測等方面。其它一些比較特異的高級分析包括多組數(shù)據(jù)關(guān)聯(lián)分析、多pathway延伸分析、磷酸蛋白激酶預(yù)測分析、互作網(wǎng)絡(luò)及生物調(diào)控模型構(gòu)建分析。定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)主要分為標(biāo)記(label)和非標(biāo)記(labelfree)定量策略,標(biāo)記策略又分為體內(nèi)標(biāo)記和體外標(biāo)記兩種。細(xì)胞內(nèi)蛋白質(zhì)組豐度的動(dòng)態(tài)變化對各種生命過程有重要影響。例如在許多疾病的發(fā)生和發(fā)展進(jìn)程中,常常伴隨著某些蛋白質(zhì)的表達(dá)異常。定量蛋白質(zhì)組學(xué)就是把一個(gè)基因組表達(dá)的全部蛋白質(zhì)或一個(gè)復(fù)雜的混合體系中所有的蛋白質(zhì)進(jìn)行精確的定量和鑒定。
蛋白質(zhì)組學(xué)在農(nóng)業(yè)生物科研領(lǐng)域的應(yīng)用:蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)在農(nóng)業(yè)生物科研領(lǐng)域的應(yīng)用為作物生長發(fā)育、病蟲害防治、遺傳育種、畜牧獸醫(yī)學(xué)疾病診斷等方面發(fā)揮重要的作用,為現(xiàn)代農(nóng)業(yè)發(fā)展開辟新途徑。蛋白質(zhì)組學(xué)在農(nóng)作物研究中的應(yīng)用:農(nóng)業(yè)是我國人口賴以生存的基礎(chǔ),而提高糧食產(chǎn)量和品質(zhì)則是農(nóng)業(yè)發(fā)展的關(guān)鍵。蛋白質(zhì)組學(xué)關(guān)鍵技術(shù)在作物遺傳育種、品系鑒定、品質(zhì)改良、逆境脅迫應(yīng)答等關(guān)鍵環(huán)節(jié)的應(yīng)用,為農(nóng)業(yè)作物的進(jìn)一步開發(fā)利用提供巨大的參考價(jià)值。蛋白質(zhì)組學(xué)可系統(tǒng)研究農(nóng)作物在特定環(huán)境或某個(gè)發(fā)育階段的組織中蛋白質(zhì)的表達(dá)變化,有助于作物發(fā)育過程機(jī)制的理解。蛋白質(zhì)組學(xué)在生物學(xué)領(lǐng)域的研究中的應(yīng)用是怎樣的?
蛋白質(zhì)組學(xué)在醫(yī)學(xué)的研究應(yīng)用:蛋白質(zhì)組學(xué)(Proteomics)是研究細(xì)胞、組織或生物體中蛋白質(zhì)組成、定位、變化及其相互作用規(guī)律的科學(xué),包括對蛋白質(zhì)表達(dá)模式和蛋白質(zhì)組功能模式的研究。蛋白質(zhì)組學(xué)的發(fā)展對尋找疾病的診斷標(biāo)志、篩選藥物靶點(diǎn)、毒理學(xué)研究等有重要意義,也因此被普遍應(yīng)用于醫(yī)學(xué)研究。蛋白質(zhì)組學(xué)研究,總體可分為一下幾個(gè)步驟:(1)差異篩選(Discovery)(2)初步驗(yàn)證(Verification)(3)然后確診(Validation)。基于質(zhì)譜的蛋白質(zhì)組學(xué)是目前比較主流的高通量蛋白質(zhì)研究手段,當(dāng)前在醫(yī)療健康方面的應(yīng)用主要集中于基礎(chǔ)研究和轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)。蛋白質(zhì)組(Proteome)一詞,源于蛋白質(zhì)(protein)與基因組(genome)兩個(gè)詞的組合。湖北PRM定量蛋白質(zhì)組學(xué)方法
蛋白質(zhì)組學(xué)將成為尋找疾病分子標(biāo)記和藥物靶標(biāo)比較有效的方法之一。深圳PRM靶向定量蛋白質(zhì)組學(xué)一般流程
蛋白組學(xué)常見研究模式主要有兩種:1.通過蛋白質(zhì)組學(xué)尋找疾病發(fā)生的發(fā)展的新型標(biāo)志物;2.結(jié)合其它組學(xué)建立疾病或者研究主題的表達(dá)譜和分子機(jī)制。蛋白質(zhì)組學(xué)( proteomics) 是指系統(tǒng)研究某一基因組所表達(dá)的所有蛋白質(zhì),包括組成蛋白質(zhì)一級結(jié)構(gòu)的氨基酸序列,蛋白質(zhì)的豐度,蛋白質(zhì)的修飾以及蛋白質(zhì)之間的相互作用。蛋白質(zhì)組和基因組( genome)在概念上有相關(guān)性,表示某一個(gè)蛋白質(zhì)組的蛋白質(zhì)是由基因組所編碼的,然而蛋白質(zhì)組學(xué)和基因組學(xué)在研究對象和研究方法上有很大的區(qū)別。深圳PRM靶向定量蛋白質(zhì)組學(xué)一般流程