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TMT/iTRAQ標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組學(xué)價格

來源: 發(fā)布時間:2022-04-13

定量蛋白質(zhì)組學(xué)方法學(xué)介紹:Label-free:Label-free定量,即非標(biāo)記的定量蛋白質(zhì)組學(xué),不需要對比較樣本做特定標(biāo)記處理,只需要比較特定肽段/蛋白在不同樣品間的色譜質(zhì)譜響應(yīng)信號便可得到樣品間蛋白表達(dá)量的變化,通常用于分析大規(guī)模蛋白鑒定和定量時所產(chǎn)生的質(zhì)譜數(shù)據(jù)。Label-free定量不需要標(biāo)記處理,操作簡單,可以做任意樣本的總蛋白質(zhì)差異定量,但對實驗操作的穩(wěn)定性、重復(fù)性要求較高,準(zhǔn)確性也較標(biāo)記定量差。因此,Label-free技術(shù)適合于大樣本量的定量比較,以及對無法用標(biāo)記定量實現(xiàn)的實驗設(shè)計。對人類而言,蛋白質(zhì)組學(xué)的研究終究要服務(wù)于人類的健康。TMT/iTRAQ標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組學(xué)價格

非標(biāo)定量法(Label-free)是通過比較質(zhì)譜分析次數(shù)或質(zhì)譜峰強(qiáng)度,分析不同來源樣品蛋白的數(shù)量變化,認(rèn)為肽段在質(zhì)譜中被捕獲檢測的頻率與其在混合物中的豐度成正相關(guān),因此蛋白質(zhì)被質(zhì)譜檢測的計數(shù)反映了蛋白質(zhì)的豐度,通過適當(dāng)?shù)臄?shù)學(xué)公式可以將質(zhì)譜檢測計數(shù)與蛋白質(zhì)的量聯(lián)系起來,從而對蛋白質(zhì)進(jìn)行定量。按照其原理主要分為兩種,第1種spectrumcounts類的非標(biāo)記方法,發(fā)展比較早,已經(jīng)形成多種定量算法,但是主要的原理都是以MS2的鑒定結(jié)果為定量基礎(chǔ),各種方法的差別在于后期算法在大規(guī)模數(shù)據(jù)上的修正。第二種非標(biāo)記定量的原理是以MS1為基礎(chǔ),計算每個肽段的信號強(qiáng)度在LC-MS上的積分。TMT/iTRAQ標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組學(xué)價格蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)并帶領(lǐng)生物技術(shù)取得關(guān)鍵性的突破。

蛋白質(zhì)組學(xué)樣品寄樣要求:動物組織的樣本蛋白量相對較高,送樣量的要求也相對比較寬松,一般提供50~100mg的量即可。此外,組織上有血跡、脂肪、結(jié)締組織的還需要用PBS和組織剪將其清理干凈。送樣前將樣品用液氮速凍5min,放置在-80℃保存,送樣時需要置于干冰環(huán)境中運輸。動物的懸浮培養(yǎng)細(xì)胞也是比較熱門的蛋白組學(xué)研究對象,如果想做細(xì)胞的蛋白組學(xué),起碼需要1×107個細(xì)胞,離心后收集,置于-80攝氏度環(huán)境中。蛋白質(zhì)組學(xué),指對某一基因組所表達(dá)的所有蛋白質(zhì)及其特征進(jìn)行大規(guī)模、系統(tǒng)化地研究,以期望在蛋白質(zhì)水平上解釋控制復(fù)雜的生命活動的分子網(wǎng)絡(luò)。

LabelFree(非標(biāo)記蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)):應(yīng)用:1.需要快速在大量樣本中找到差異表達(dá)的蛋白組合。2.需要在較短時間以較低成本得到具有提示意義的蛋白表達(dá)數(shù)據(jù)。3.需要檢測的樣品蛋白含量低。4.需要檢測相互作用蛋白。技術(shù)特點:1.對質(zhì)譜儀器設(shè)備要求較高,色譜和質(zhì)譜需要同時有較好的穩(wěn)定性和重復(fù)性。2.需要有特殊的定量分析軟件。3.對樣品中蛋白質(zhì)總量要求較低,實驗周期短,實驗費用低。4.不需要額外并且昂貴的標(biāo)記試劑,排除了標(biāo)記過程帶入實驗誤差的風(fēng)險,同時也不必考慮標(biāo)記效率的問題。DIA 定量蛋白質(zhì)組學(xué)的循環(huán)時間固定,掃描點數(shù)均勻,定量準(zhǔn)確度高。

蛋白質(zhì)組學(xué)我的介紹:蛋白質(zhì)組學(xué)(proteomics)采用高通量和大規(guī)模的研究手段,從整體的角度分析細(xì)胞內(nèi)動態(tài)變化的蛋白質(zhì)組成成份、表達(dá)水平與修飾狀態(tài),了解蛋白質(zhì)之間的相互作用與聯(lián)系,揭示蛋白質(zhì)功能與細(xì)胞生命活動規(guī)律,之后達(dá)到構(gòu)建出細(xì)胞的“功能圖”的目的。蛋白質(zhì)作為生命活動的物質(zhì)承擔(dān)者、生理功能的執(zhí)行者和生命現(xiàn)象的直接體現(xiàn)者,研究蛋白質(zhì)對闡明生命體的變化機(jī)制具有重要作用。蛋白質(zhì)組研究不只可以實現(xiàn)與基因組的關(guān)聯(lián),揭示生命活動的發(fā)生規(guī)律。同樣對人類重大疾病的發(fā)生與發(fā)展的病理機(jī)制研究也具有重要作用。生命體的生理、病理過程,藥物和環(huán)境因子的作用都依賴于蛋白質(zhì),并引起蛋白質(zhì)的變化。蛋白質(zhì)組學(xué)研究對提高我國生物醫(yī)學(xué)原始創(chuàng)新能力、重大疾病防診治能力和國民健康水平以及新藥研發(fā)能力、生物醫(yī)藥產(chǎn)業(yè)的發(fā)展具有重大的戰(zhàn)略意義。蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)有電噴霧質(zhì)譜。北京外泌體蛋白質(zhì)組學(xué)主要技術(shù)

DIA 定量蛋白質(zhì)組學(xué)可以采集所有離子及碎片圖譜,重現(xiàn)性好。TMT/iTRAQ標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組學(xué)價格

定量蛋白質(zhì)組學(xué)分析(QuantitativeProteomics)是對一個基因組表達(dá)的全部蛋白質(zhì)或一個復(fù)雜混合體系內(nèi)所有蛋白質(zhì)進(jìn)行精確鑒定和定量??捎糜诤Y選和尋找任何因素引起的樣本之間的差異表達(dá)蛋白,結(jié)合生物信息學(xué)揭示細(xì)胞生理病理等功能,同時也可對某些關(guān)鍵蛋白進(jìn)行定性和定量分析。目前定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)常見標(biāo)記(Label)和非標(biāo)記的(LabelFree)定量策略。定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)常見的幾類主要包括:LabelFree定量蛋白組分析、SILAC與免疫共沉淀蛋白互作分析、MRM/PRM定量蛋白組學(xué)分析、SILAC/Dimethyl標(biāo)記定量蛋白組分析、SWATH定量蛋白組學(xué)、TMT/iTRAQ/multinotch定量蛋白組學(xué)分析。TMT/iTRAQ標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組學(xué)價格