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泛素化修飾蛋白質(zhì)組學(xué):泛素是一種由76個氨基酸組成的多肽,在真核生物中高度保守,可通過異肽鍵與目標(biāo)蛋白賴氨酸殘基的氨基進行共價連接。泛素化蛋白的富集主要基于標(biāo)記,泛素用親和標(biāo)簽(通常為6xHis)進行標(biāo)記,并通過鎳螯合色譜親和提取泛素化蛋白。由于泛素的C端為Arg-Gly-Gly結(jié)構(gòu),經(jīng)胰蛋白酶水解后,Gly-Gly保留在修飾蛋白的肽鏈上,使肽的質(zhì)量增加114,因此可作為泛素定位位點的質(zhì)量標(biāo)記。用HPLC對樣品進行預(yù)分離,使用針對特定殘留結(jié)構(gòu)的抗體富集泛素化肽,可很大程度上提高泛素化蛋白的濃度。串聯(lián)質(zhì)譜可以鑒定泛素化位點。在早期的研究中,乙?;揎椧恢北徽J為是真核細胞所特有的一種翻譯后修飾。上海糖基化修飾蛋白質(zhì)組學(xué)質(zhì)譜鑒定
泛素化修飾蛋白質(zhì)組學(xué)的作用:泛素化、心血管等疾病的發(fā)病密切相關(guān)。因此,作為近年來生物化學(xué)研究的一個重大成果,它已然成為研究、開發(fā)新藥物的新靶點。技術(shù)原理是首先將蛋白樣本酶解成肽段混合物,然后使用液相色譜對酶解后的肽段混合物進行組分分離以降低樣本復(fù)雜程度,然后通過高質(zhì)量的泛素化修飾抗體和生物材料對修飾肽段進行富集,之后上樣至液相色譜-串聯(lián)質(zhì)譜中進行分析定量。技術(shù)優(yōu)勢:高特異性的修飾抗體;高分辨率、高靈敏度質(zhì)譜儀;鑒定通量高;可與代謝組學(xué)等進行多組學(xué)聯(lián)合分析。南京蛋白質(zhì)琥珀?;揎椊M學(xué)質(zhì)譜分析蛋白質(zhì)的磷酸化修飾是生物體內(nèi)重要的共價修飾方式之一。
蛋白質(zhì)翻譯后修飾在蛋白質(zhì)中磷酸化位點分析時應(yīng)該注意些什么問題?覆蓋率:覆蓋率越高,檢測和鑒定含有修飾基團的肽幾率就越大。修飾位點的占有率:被修飾的蛋白質(zhì)的百分比低,則檢測到修飾肽的機會會隨之減少。如果百分比較高(> 30%),則有助于識別修飾位點。棕櫚酰化蛋白修飾質(zhì)譜鑒定方法:S-棕櫚?;闹饕δ苁谴龠M蛋白質(zhì)與細胞膜的結(jié)合。蛋白質(zhì)可以由一個棕櫚酰基組成,也可以與更多棕櫚基或與其他脂質(zhì),如豆蔻?;?。由于對S-棕櫚?;鞍追治鋈匀痪哂刑魬?zhàn)性,由于S-棕櫚?;揎椀鞍讈喫揭约笆杷院蜐撛诓环€(wěn)定的硫代質(zhì)鏈的S-脂?;摹?/p>
乙?;揎椀鞍捉M學(xué)應(yīng)用方向有什么?1、基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)、臨床診斷:生物標(biāo)志物,疾病機理機制,疾病分型,個性化治理等;2、生物醫(yī)藥:藥物作用機理,藥效評價,藥物開發(fā)等;3、微生物領(lǐng)域:致病機理,耐藥機制,病原體-宿主相互作用研究等;4、海洋水產(chǎn):漁業(yè)資源,海水養(yǎng)殖,漁業(yè)環(huán)境與水產(chǎn)品安全等;5、生物能源、環(huán)境科學(xué)領(lǐng)域:發(fā)酵過程優(yōu)化,生物燃料生產(chǎn),環(huán)境危定風(fēng)險評估研究等;6、食品營養(yǎng):食品儲藏及加工條件優(yōu)化,食品組分及品質(zhì)鑒定,功能性食品開發(fā),食品安全監(jiān)檢測等。糖基化蛋白質(zhì)翻譯修飾組學(xué)主要在復(fù)雜的多細胞或組織形成過程中起關(guān)鍵作用。
蛋白質(zhì)乙?;揎椊M學(xué):乙?;揎検侵冈诿富蚍敲缸饔孟?,將乙酰CoA的乙?;鶊F轉(zhuǎn)移至蛋白質(zhì)氨基酸的殘基上。蛋白質(zhì)乙?;彩且环N可逆的酶促反應(yīng)過程。乙酰基轉(zhuǎn)移酶可以將乙?;鶊F(CH3C=O)從乙酰輔酶A轉(zhuǎn)移至蛋白質(zhì)。同理,去乙酰化酶則可以逆轉(zhuǎn)這種反應(yīng)。蛋白質(zhì)上的賴氨酸乙酰化是細胞內(nèi)一種重要的PTMs過程。不僅發(fā)生在細胞核內(nèi)組蛋白、轉(zhuǎn)錄因子等上,在細胞質(zhì)和線粒體中也存在著諸多蛋白的乙?;揎?。在植物研究領(lǐng)域內(nèi),乙?;揎椫饕獏⑴c植物光合作用、生長發(fā)育、脅迫響應(yīng)等過程。在醫(yī)學(xué)領(lǐng)域,乙酰化修飾可調(diào)節(jié)人體內(nèi)某種代謝酶,控制糖尿病,這一發(fā)現(xiàn)為糖尿病干預(yù)與療理帶來新的希望。泛素化修飾蛋白質(zhì)組學(xué)有些什么?南京蛋白質(zhì)琥珀酰化修飾組學(xué)質(zhì)譜分析
蛋白質(zhì)翻譯后修飾幾乎參與了細胞所有正常生命活動的過程。上海糖基化修飾蛋白質(zhì)組學(xué)質(zhì)譜鑒定
泛素化修飾蛋白組學(xué)研究:泛素化修飾蛋白組學(xué)是一種重要的翻譯后修飾。泛素-蛋白酶體系統(tǒng)介導(dǎo)了真核生物體內(nèi)80%~85%的蛋白質(zhì)降解。此外,泛素化修飾還可以直接影響蛋白質(zhì)的活性和定位,調(diào)控包括細胞周期、細胞凋亡、轉(zhuǎn)錄調(diào)控、DNA 損傷修復(fù)以及免疫應(yīng)答等在內(nèi)的多種細胞活動。由于翻譯后修飾的蛋白質(zhì)在生物樣本中含量低、動態(tài)范圍廣,質(zhì)譜分析前需要對修飾進行富集以提高其豐度,然后利用傳統(tǒng)的定量蛋白組分析手段對富集得到的泛素化肽段樣品進行定量分析。上海糖基化修飾蛋白質(zhì)組學(xué)質(zhì)譜鑒定