蛋白質(zhì)組的研究不但能為生命活動(dòng)規(guī)律提供物質(zhì)基礎(chǔ)，也能為眾多種疾病機(jī)理的闡明及攻克提供理論根據(jù)和解決途徑。通過對(duì)正常個(gè)體及病理個(gè)體間的蛋白質(zhì)組比較分析，我們可以找到某些“疾病特異性的蛋白質(zhì)分子”，它們可成為新藥物設(shè)計(jì)的分子靶點(diǎn)，或者也會(huì)為疾病的早期診斷提供分子標(biāo)志。確實(shí)，那些世界范圍內(nèi)銷路比較好的藥物本身是蛋白質(zhì)或其作用靶點(diǎn)為某種蛋白質(zhì)分子。因此，蛋白質(zhì)組學(xué)研究不只是探索生命奧秘的必須工作，也能為人類健康事業(yè)帶來(lái)巨大的利益。蛋白質(zhì)組學(xué)的研究是生命科學(xué)進(jìn)入后基因時(shí)代的特征。蛋白質(zhì)組研究是對(duì)基因組研究的重要補(bǔ)充。貴州修飾蛋白組學(xué)項(xiàng)目

蛋白質(zhì)組學(xué)有什么用，能給我實(shí)驗(yàn)帶來(lái)什么？可以大規(guī)模鑒定特定組織、細(xì)胞等各種樣本的蛋白質(zhì)種類、修飾狀態(tài)以及蛋白質(zhì)之間的相互作用，以及對(duì)這些蛋白質(zhì)功能分析、分類；可以對(duì)不同條件下某一特定樣本進(jìn)行大規(guī)模的蛋白質(zhì)(包括翻譯后修飾蛋白)表達(dá)量變化分析，篩選潛在biomarker，篩選重要信號(hào)通路；依托大樣本量，可以實(shí)現(xiàn)疾病的分子分型分析、重要潛在靶標(biāo)鑒定。質(zhì)譜的蛋白質(zhì)組學(xué)和芯片哪個(gè)更好出結(jié)果？若有對(duì)應(yīng)物種的全基因組并有預(yù)測(cè)的全蛋白序列庫(kù)，可優(yōu)先選擇全蛋白序列庫(kù)；若無(wú)全蛋白序列庫(kù)，有對(duì)應(yīng)物種對(duì)應(yīng)組織的轉(zhuǎn)錄組測(cè)序結(jié)果并，可以使用轉(zhuǎn)錄組的測(cè)序結(jié)果（mRNA三框翻譯或者預(yù)測(cè)CDS，并翻譯成氨基酸序列）；若基因組、轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫(kù)都沒有，優(yōu)先選擇同源性比較接近的物種的全蛋白數(shù)據(jù)庫(kù)，若近源物種沒有合適的全蛋白庫(kù)，則選擇更大的蛋白全庫(kù)（如動(dòng)物全庫(kù)、綠色植物全庫(kù)、微生物庫(kù)等）。南京蛋白質(zhì)定量組學(xué)質(zhì)譜分析蛋白質(zhì)組研究技術(shù)涉及到各種重要的生物學(xué)現(xiàn)象，如信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)、細(xì)胞分化、蛋白質(zhì)折疊等等。

蛋白質(zhì)組學(xué)在生物學(xué)領(lǐng)域的研究中的應(yīng)用是怎樣的？研究對(duì)象涉及到生物體且生物體內(nèi)表達(dá)蛋白，理論上都可以應(yīng)用蛋白質(zhì)組學(xué)。蛋白質(zhì)組學(xué)是以研究生物體蛋白組成及其變化規(guī)律為目的的應(yīng)用科學(xué)。主要使用的儀器為液質(zhì)聯(lián)用高分辨率質(zhì)譜儀。詳細(xì)來(lái)說，蛋白質(zhì)組學(xué)包含許多分支：非標(biāo)定量蛋白質(zhì)組學(xué)（定性研究生物體的蛋白組成），定量蛋白質(zhì)組學(xué)（對(duì)生物體蛋白表達(dá)含量進(jìn)行測(cè)定），修飾蛋白質(zhì)組學(xué)（對(duì)蛋白質(zhì)翻譯后修飾進(jìn)行檢測(cè)）及相互作用蛋白質(zhì)組研究（蛋白質(zhì)直接相互作用機(jī)制解析）等。蛋白質(zhì)組學(xué)屬于后基因組時(shí)代的科學(xué)研究，針對(duì)基因表達(dá)產(chǎn)物進(jìn)行檢測(cè)與定量。因此更能反應(yīng)出生物體生理?xiàng)l件下的水平與狀態(tài)。

PRM靶向蛋白組學(xué)：PRM技術(shù)是一種根據(jù)已知實(shí)測(cè)信息或質(zhì)譜檢測(cè)規(guī)律的假定信息對(duì)樣品中的蛋白質(zhì)進(jìn)行靶向定量的技術(shù)。該技術(shù)主要應(yīng)用儀器為QExactive系列質(zhì)譜儀，首先以四極桿作為質(zhì)量過濾器，特異性地選擇與預(yù)先設(shè)定質(zhì)荷比相同的肽段離子（母離子）通過，隨后在高能碰撞池中碎裂母離子，之后通過Orbitrap分析碎片離子（子離子）得到肽段的二級(jí)質(zhì)譜信息。四極桿的高選擇性離子過濾與Orbitrap高分辨率測(cè)量技術(shù)的結(jié)合使得PRM技術(shù)有很高的特異性，并且有效的降低了背景噪音，去除了干擾離子，提高了靈敏度。在確保數(shù)據(jù)質(zhì)量的前提下，為了在一次分析中檢測(cè)更多的蛋白質(zhì)，可用預(yù)置PRM（ScheduledPRM,sPRM）的方法，這種方法需要知道每個(gè)肽段的保留時(shí)間信息，使得每個(gè)肽段只在其洗脫時(shí)間窗口內(nèi)執(zhí)行PRM檢測(cè)，很大程度上提高了檢測(cè)效率，可同時(shí)檢測(cè)上百種蛋白質(zhì)。PRM技術(shù)是目前應(yīng)用較普遍的質(zhì)譜蛋白質(zhì)靶向定量技術(shù)。蛋白質(zhì)組學(xué)的研究主要促進(jìn)分子醫(yī)學(xué)的發(fā)展。

蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)發(fā)展方面：蛋白質(zhì)組學(xué)的研究方法將出現(xiàn)多種技術(shù)并存，各有優(yōu)勢(shì)和局限的特點(diǎn)，而難以象基因組研究一樣形成比較一致的方法。除了發(fā)展新方法外，更強(qiáng)調(diào)各種方法間的整合和互補(bǔ)，以適應(yīng)不同蛋白質(zhì)的不同特征。另外，蛋白質(zhì)組學(xué)與其它學(xué)科的交叉也將日益明顯和重要，這種交叉是新技術(shù)新方法的活水之源，特別是，蛋白質(zhì)組學(xué)與其它大規(guī)?？茖W(xué)如基因組學(xué)，生物信息學(xué)等領(lǐng)域的交叉，構(gòu)成組學(xué)（omics）生物技術(shù)研究方法，所呈現(xiàn)出的系統(tǒng)生物學(xué)（System Biology）研究模式，將成為未來(lái)生命科學(xué)比較令人激動(dòng)的新前沿。蛋白質(zhì)組的概念指由一個(gè)基因組，或一個(gè)細(xì)胞、組織表達(dá)的所有蛋白質(zhì)。貴州修飾蛋白組學(xué)項(xiàng)目

蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)有飛行時(shí)間質(zhì)譜。貴州修飾蛋白組學(xué)項(xiàng)目

蛋白質(zhì)組學(xué)與基因組學(xué)的差異：蛋白質(zhì)組和基因組（genome）在概念上有相關(guān)性，某一個(gè)蛋白質(zhì)組的蛋白質(zhì)是由其基因組所編碼的，然而蛋白質(zhì)組學(xué)和基因組學(xué)在研究對(duì)象和研究方法上有很大的區(qū)別?；蚪M在所有的細(xì)胞中幾乎都是完整的，與之不同，蛋白質(zhì)組具有很高的細(xì)胞和組織特異性，不同的細(xì)胞組織表達(dá)不同的蛋白質(zhì)組。蛋白質(zhì)組的復(fù)雜性也遠(yuǎn)遠(yuǎn)高于基因組，這是因?yàn)橐粋€(gè)基因≠一個(gè)轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物≠一個(gè)蛋白質(zhì)。比如據(jù)估計(jì)人的基因組由30000個(gè)基因組成，經(jīng)mRNA剪切和蛋白質(zhì)翻譯后修飾將產(chǎn)生20萬(wàn)~200萬(wàn)個(gè)蛋白質(zhì)。由于不同的轉(zhuǎn)錄起始和mRNA剪切使同一基因產(chǎn)生了不同的轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物。同樣由于不同的翻譯起始，一個(gè)mRNA可以翻譯成不同的蛋白質(zhì)。貴州修飾蛋白組學(xué)項(xiàng)目