轉錄組學 (transcriptomics)是功能基因組學 ( Functional Genomics)研究的重要組成部分，是一門在整體水平上研究細胞中所有基因轉錄及轉錄調控規(guī)律的學科。隨著越來越多的基因組序列相繼被測定,生命科學的研究進入了后基因組時代,各類組學技術得到迅速地發(fā)展與普遍地應用包括以基因為研究對象的基因組學(Genomics)、以轉錄過程為研究對象的轉錄組學(Transcriptomics)。意義：1、轉錄組譜可以提供特定條件下某些基因表達的信息,并據(jù)此推斷相應未知基因的功能,揭示特定調節(jié)基因的作用機制。2、通過基于基因表達譜的分子標簽,不只可以辨別細胞的表型歸屬,還可以用于疾病的診斷。轉錄組學分析轉錄本的結構和表達水平的同時，還能發(fā)現(xiàn)未知轉錄本和稀有轉錄本。河南宏轉錄學組技術

什么叫轉錄組學？廣義轉錄組是指生命單元(通常是一種細胞)中所有按基因信息單元轉錄和加工的RNA分子(包括編碼和非編碼RNA功能單元),或者是一個特定細胞所有轉錄本的總和.它的研究對象就是這些RNA與蛋白質分子和它們所組成的基因功能網(wǎng)絡以及它們與細胞功能的關系.而狹義轉錄組是指可直接參與翻譯蛋白質的mRNA總和。轉錄組是干什么用的，和表達譜有什么區(qū)別？轉錄組，指細胞某一時期所有基因的轉錄水平。轉錄組學，是一門在整體水平上研究細胞中基因轉錄的情況及轉錄調控規(guī)律的學科。簡而言之，轉錄組學是從RNA水平研究基因表達的情況。南京全轉錄學組質譜鑒定轉錄組學靈敏度高，可以檢測細胞中少至幾個拷貝的稀有轉錄本。

宏轉錄組學也稱為環(huán)境轉錄組學，指從整體水平上研究某一特定環(huán)境、特定時期菌群群體全部基因轉錄情況以及轉錄調控規(guī)律，以揭示微生物在不同環(huán)境壓力下的適應機制，探索環(huán)境與微生物之間的相互作用機理。其適用范圍包括人體微生態(tài)、環(huán)境、工業(yè)、農(nóng)業(yè)等領域。宏轉錄組學以生態(tài)環(huán)境中的全部RNA為研究對象，避開了微生物分離培養(yǎng)困難的問題，能有效的擴展微生物資源的利用空間。應用領域：包括腸道微生物、口腔微生物、糞便微生物、人體組織微生物。

轉錄組學測序流程：1、樣品RNA準備。2、測序文庫構建。3、DNA成簇(Cluster)擴增。4、高通量測序(Illumina)。5、數(shù)據(jù)分析。轉錄組的分析大致有以下幾種情況：1、同一物種在發(fā)育過程中的各時間節(jié)點的基因表達特點及存在的差異；2、不同品系之間存在的差異表達基因；3、不同的外界條件處理，如細菌、病毒、光照、紫外、干旱、高溫、高鹽脅迫，對基因表達的影響；轉錄組（transcriptome），是指特定生長階段某組織或細胞內所有轉錄產(chǎn)物的匯合，狹義上指所有mRNA的匯合。circRNA是一種非編碼RNA，可以多種方式參與生物學功能。

RNA-seq轉錄組學技術優(yōu)勢有：1、可以直接測定每個轉錄本片段序列、單核苷酸分辨率的準確度;2、靈敏度高，可以檢測細胞中少至幾個拷貝的稀有轉錄本;3、可以對任意物種進行全基因組分析，能夠檢測未知基因，發(fā)現(xiàn)新的轉錄本，并準確地識別可變剪切位點及cSNP，UTR區(qū)域;4、檢測范圍廣，能夠同時鑒定和定量稀有轉錄本和正常轉錄本。RNA-seq轉錄組學是需要生物學重復的，至少需要兩次生物學重復，3次以上的生物學重復更好。以3個重復為例，加上對照的三個生物學重復，一次RNA-seq需要6個樣本。宏轉錄組學適用范圍包括人體微生態(tài)、環(huán)境、工業(yè)、農(nóng)業(yè)等領域。南京全轉錄學組質譜鑒定

轉錄組學測序的研究對象為特定細胞在某一功能狀態(tài)下所能轉錄出來的所有RNA的總和。河南宏轉錄學組技術

轉錄組學應用領域：農(nóng)林領域：生長發(fā)育機制，抗逆脅迫機制，育種，物種保護研究等；畜牧業(yè)：生長發(fā)育機制，致病機理研究，肉類及乳制品品質研究等；海洋水產(chǎn)：生長發(fā)育機制，漁業(yè)資源，漁業(yè)環(huán)境與水產(chǎn)品安全等；微生物：致病機理，耐藥機制，病原體-宿主相互作用研究等；生物醫(yī)藥：生物標志物，疾病機理機制，疾病分型，藥物開發(fā)，個性化醫(yī)治等；環(huán)境科學：發(fā)酵過程優(yōu)化，生物燃料生產(chǎn)，環(huán)境危害風險評估研究等；食品科學：食品儲藏及加工條件優(yōu)化，食品組分及品質鑒定，功能性食品開發(fā)，食品安全監(jiān)檢測等。河南宏轉錄學組技術