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北京靶向代謝組學(xué)服務(wù)

來源: 發(fā)布時間:2022-04-28

代謝組學(xué)研究方法:代謝組學(xué)的研究方法與蛋白質(zhì)組學(xué)的方法類似,通常有兩種方法。一種方法稱作代謝物指紋分析 (metabolomic fingerprinting),采用液相色譜-質(zhì)譜聯(lián)用(LC-MS)的方法,比較不同血樣中各自的代謝產(chǎn)物以確定其中所有的代謝產(chǎn)物。從本質(zhì)上來說,代謝指紋分析涉及比較不同個體中代謝產(chǎn)物的質(zhì)譜峰,然后了解不同化合物的結(jié)構(gòu),建立一套完備的識別這些不同化合物特征的分析方法。另一種方法是代謝輪廓分析(metabolomic profiling),研究人員假定了一條特定的代謝途徑,并對此進(jìn)行更深入的研究。代謝組學(xué)的研究處于生物信息流的中游。北京靶向代謝組學(xué)服務(wù)

非靶向代謝組學(xué):非靶向代謝組學(xué)可用于檢測生物體內(nèi)大多數(shù)小分子代謝物的動態(tài)變化,通過數(shù)據(jù)處理,多維統(tǒng)計(jì)和數(shù)學(xué)建模來分析生物擾動下的代謝指紋圖譜。尋找兩組間發(fā)生明顯變化的差異代謝物,富集差異代謝通路, 獲得整個生物體的代謝輪廓。 技術(shù)優(yōu)勢: 1、代謝組學(xué)能放大基因組和蛋白組的微小變化,具有較高的靈敏度、分辨率; 2、具有較寬的動態(tài)檢測范圍;3、相比于基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué),檢測費(fèi)用更為低廉;4、代謝組學(xué)比較貼近生物體表型,能更直接、準(zhǔn)確地反映生物體的生理病理狀態(tài),適合于生物樣本中潛在標(biāo)志物的篩選,疾病分期等。武漢植物靶向代謝組學(xué)分析方法代謝組學(xué)技術(shù)可應(yīng)用于疾病早期診斷。

代謝組學(xué)的研究領(lǐng)域有哪些?1、疾病機(jī)制研究。2、疾病診斷與防治。3、新藥篩選和開發(fā)。4、藥物作用機(jī)制的研究。5、藥物毒性評價。6、植物的細(xì)胞代謝組學(xué)研究。7、微生物代謝組學(xué)研究。代謝組能夠檢測到的代謝物含量是多少?不同檢測平臺的靈敏度不一樣,靈敏度比較高,可達(dá)到fM級。另外,相同含量的不同物質(zhì),由于自身化學(xué)性質(zhì)不同,質(zhì)譜的離子化效率、信號響應(yīng)強(qiáng)度會差異很大。物質(zhì)的檢測靈敏度跟自身的化學(xué)性質(zhì)有關(guān),化學(xué)性質(zhì)的影響主要表現(xiàn)在離子化效率和質(zhì)譜碎裂行為兩方面。因此,相同含量的不同物質(zhì),可能一個能檢測出來,另一個檢測不出來。

代謝組學(xué)尿液樣本收集:1)取空腹晨尿、中段尿(臨床)或晨間1 h尿(動物)于50 mL離心管中;2)4 ℃ 下10000 rpm離心10 min取上清,用1.5 mL離心管分裝,保存于-80 ℃。3)動物1 h尿量不夠的情況下,可分多次收集尿液;如需收取24 h尿液,需要使用帶低溫裝置的代謝籠收集,并且及時凍存樣本。4)收集完尿液樣本后,建議使用液氮淬滅15 min后,再分裝多管后于-80 ℃凍存。組織樣本收集:動物組織(包括腦、心、肝、脾、肺、腎、肌肉和皮膚等;軟體動物如血吸蟲):1)取適量組織,用預(yù)冷的PBS緩沖液或生理鹽水清洗干凈;2)迅速剝?nèi)シ潜匦璧闹竞徒Y(jié)締組織,再用PBS緩沖液或生理鹽水沖洗干凈;3)用干凈的無塵吸水紙吸干水分,將組織分成50-100 mg / 管分裝待用;4)管子上做好標(biāo)記后迅速放入液氮中冷凍處理至少15 min,-80 ℃凍存;干冰運(yùn)輸。靶向代謝組學(xué)著重對于設(shè)定好的目標(biāo)代謝物進(jìn)行定性、量檢測分析和研究。

代謝組學(xué)細(xì)胞樣本收集:懸浮細(xì)胞:1)連同培養(yǎng)基轉(zhuǎn)移到1.5 mL的進(jìn)口離心管中。2)低速離心5 min(低于3000 rpm),使細(xì)胞沉淀于離心管的底部(1*107個細(xì)胞為宜)。3)倒掉培養(yǎng)基(盡量倒干凈),用預(yù)冷的PBS反復(fù)沖洗2 ~ 3次,低速離心5 min,棄上清。4)標(biāo)記離心管,將離心管的尖的一端插入液氮中,淬滅細(xì)胞沉淀1 min,-80 ℃凍存,干冰寄送。注意事項(xiàng):1. 培養(yǎng)基傾倒時盡量倒干凈,可使用濾紙將殘留培養(yǎng)液吸凈;2. 甲醇/水請使用色譜純及以上規(guī)格;3. 液氮淬滅細(xì)胞時,請小心避免離心管破碎導(dǎo)致樣本受損;4. 建議細(xì)胞樣本在進(jìn)行培養(yǎng)時多準(zhǔn)備樣本,以備后續(xù)使用。與基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)相比, 代謝組學(xué)的研究側(cè)重于相關(guān)特定組分的共性。武漢植物靶向代謝組學(xué)分析方法

為什么選擇代謝組學(xué)作為科研技術(shù)手段?北京靶向代謝組學(xué)服務(wù)

代謝組學(xué)樣本收集注意事項(xiàng):1.對于動物組織樣本無法滿足50mg/樣,如海馬組織,大腦組織等,可考慮同組混樣以達(dá)到50mg/樣的要求。2.對于含水量高的果實(shí)進(jìn)行取樣很難保持高度均一性(如番茄的果皮、果肉等),建議將整個果實(shí)進(jìn)行液氮研磨后凍干混勻,對混勻后的粉末進(jìn)行稱重分裝,凍存。3.盡量不要使用錫箔紙以及自封袋包裝樣本,建議將樣本液氮研磨后使用離心管/凍存管進(jìn)行分裝。4.在使用PBS緩沖液/超純水進(jìn)行漂洗時,需要盡快處理。5.植物各類組織樣本建議都使用超純水進(jìn)行漂洗完之后,再研磨分裝凍存,防止因種植過程中施加的一些肥料、農(nóng)藥等含有表面活性劑或其他雜質(zhì),對后續(xù)實(shí)驗(yàn)造成影響。北京靶向代謝組學(xué)服務(wù)