代謝組學的研究分為靶向和非靶向。通俗說就是你有沒有目標分子。傳統(tǒng)代謝組學研究利用的是GC-MS，因為代謝物大多數(shù)都不是高沸點的，而且GC-MS有龐大的數(shù)據(jù)庫檢索。然后發(fā)展的LC-MS差不多，就是克服了一些高沸點物質(zhì)難以檢測的弊端。NMR用于代謝組學不是很多，一方面是NMR這個東西入行起點有點高，另一方面是樣品太復雜而且靈敏度不高。但是NMR樣品處理簡單，無損。不需要各種衍生化。而且NMR對于物質(zhì)結(jié)構(gòu)的指認要比MS更精確（比如異構(gòu)體）因此對定性非常有用，成為非靶向代謝組學的重要方法。代謝組學是效仿基因組學和蛋白質(zhì)組學的研究思想。四川常規(guī)靶向代謝組學應用

代謝組學研究方法： 對于代謝產(chǎn)物來說，不只只有質(zhì)譜峰這個特征。更進一步說，質(zhì)譜（MS）并不能檢測出所有的代謝產(chǎn)物，并不是因為質(zhì)譜的靈敏度不夠，而是由于質(zhì)譜只能檢測離子化的物質(zhì)，但有些代謝產(chǎn)物在質(zhì)譜儀中不能被離子化。采用核磁共振（NMR）的方法，可以彌補色譜的不足。過去，只有毒理學方面的研究使用核磁共振，而質(zhì)譜只在植物代謝研究中采用。如今，這兩種方法在代謝組學研究中已經(jīng)普遍使用。為在不同樣品間進行有意義的比較，研究人員必須結(jié)合使用這兩種方法獲得的大量數(shù)據(jù)進行分析。此外，還需要結(jié)合基因組學研究獲得的數(shù)據(jù)。濟南代謝組學研究代謝組學主要技術(shù)手段是色譜（HPLC，GC）。

選擇代謝組學作為科研技術(shù)手段的優(yōu)勢有哪些？代謝組學的研究處于生物信息流的中游，介于基因、蛋白質(zhì)和細胞、組織之間，在生物信息的傳遞中起到承上啟下的作用。小分子的產(chǎn)生和代謝是基因表達的下游產(chǎn)物，生物體液的代謝產(chǎn)物分析能夠更直接，更準確的反映生物體的病理生理狀態(tài)。代謝物的種類少，大約在103個數(shù)量級，要遠小于基因和蛋白質(zhì)的數(shù)據(jù)，物質(zhì)的分子結(jié)構(gòu)要簡單得多，分析起來更簡單明了。代謝組學的代謝物信息庫簡單，它遠沒有全基因組測序及大量表達序列標簽的數(shù)據(jù)庫那么復雜?；蚝偷鞍踪|(zhì)表達的有效微小變化會在代謝物上得到放大，從而使檢測更容易。代謝產(chǎn)物在各個生物體系中都是類似的，所以代謝組學研究中采用的技術(shù)更容易在各個領(lǐng)域中通用，也更容易被人接受。

代謝組學介紹：通過液質(zhì)聯(lián)用（LC-MS）方法檢測生物體受外界刺激前后體內(nèi)大多數(shù)小分子代謝物的動態(tài)變化，重點尋找在實驗組和對照組中有明顯變化的代謝物，進而研究這些代謝物與生理病理變化的相關(guān)關(guān)系，其研究對象大多是分子量1500Da以內(nèi)的小分子物質(zhì)。技術(shù)優(yōu)勢：較高的靈敏度、分辨率；較寬的動態(tài)范圍；適合對標本中未知代謝物的探索研究；適合于生物樣本中復雜代謝產(chǎn)物的檢測和潛在標志物的鑒定。代謝組學應用方向： 土壤代謝組學。研究土壤中有機質(zhì)及土壤微生物代謝含量變化及相互作用，了解土壤微生物多樣性及其碳代謝能力，為探索調(diào)節(jié)、控制和改善土壤環(huán)境質(zhì)量提供重要的參考。代謝組學技術(shù)可應用于病因病機研究。

什么是代謝組學？代謝組學是用來解決什么問題的？代謝組學（Metabonomics/Metabolomics）是發(fā)展起來的一門新興學科，是研究關(guān)于生物體被擾動后（如基因的改變或環(huán)境變化后）其代謝產(chǎn)物（內(nèi)源性代謝物質(zhì)）種類、數(shù)量及其變化規(guī)律的科學。代謝組學著重研究的是生物整體或組織的內(nèi)源性代謝物質(zhì)的代謝途徑及其所受內(nèi)在或者外在因素的影響及隨時間變化的規(guī)律。代謝組學通過揭示內(nèi)在和外在因素影響下代謝整體的變化軌跡來反映某種病理生理過程中所發(fā)生的一系列生物事件。代謝組學主要研究的是作為各種代謝路徑的底物和產(chǎn)物的小分子代謝物（MW<1000）。濟南代謝組學研究

靶向代謝組學（Trgeted metabolomics）則為目標性代謝組學。四川常規(guī)靶向代謝組學應用

靶向代謝組學的一般分析流程為：1. 數(shù)據(jù)采集 第1步是得到標準品。如果無法從市場上買到，就必須定制合成。然后通過優(yōu)化產(chǎn)物離子碰撞能量以得到的信號，再通過測定三重串聯(lián)四極桿測定代謝物的 MRM 躍遷值。2. 定量 接下來用定量分析軟件對 MRM 數(shù)據(jù)進行處理，得到報告。3. 統(tǒng)計分析和解釋 將定量報告輸入統(tǒng)計分析軟件包，用統(tǒng)計工具，如ANOVA，對數(shù)據(jù)進行處理。靶向分析：在基于質(zhì)譜的代謝組學分析中，要意識到離子強度和色譜保留時間都會隨著時間的推移而產(chǎn)生漂移，所以在實驗中，要按隨機順序?qū)颖具M行檢測，且數(shù)據(jù)需要在同天同一批次進行采集，以減少誤差。四川常規(guī)靶向代謝組學應用