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山東植物靶向代謝組學服務

來源: 發(fā)布時間:2022-05-08

代謝組學應用方向:腸道菌群代謝組學,運用代謝組學檢測腸菌代謝物的動態(tài)變化,了解腸道菌群在宿主中的代謝狀態(tài),直觀的研究腸道菌群與疾病發(fā)生的發(fā)展的關系,為疾病的預防,調高宿主的健康水平提供新的思路。經典脂質組學:對生物體、組織或細胞中的脂質以及與其相互作用的分子進行全方面系統(tǒng)的鑒定分析。了解脂質的結構和功能,揭示脂質代謝與細胞乃至機體的生理、病理過程之間的關系,普遍運用于分子生理學、功能基因組學以及環(huán)境與健康等重要領域。代謝組學是效仿基因組學和蛋白質組學的研究思想。山東植物靶向代謝組學服務

如何獲得高質量GC/MS代謝組學數據?實驗設計先不談,在儀器分析階段,若想獲得高質量數據,有以下幾個方面需要注意。1)前處理方法的一致性。不同實驗人員操作方式不盡相同。因此,一個項目應當只由一個人負責前處理。推薦使用自動衍生設備,以減少人為的誤差。2)檢測之前需確保儀器處于比較好工作狀態(tài)。儀器的控制軟件都有系統(tǒng)自檢功能,可以快速便捷地核查質譜儀器的狀態(tài)。但更重要的是氣相色譜狀態(tài),推薦使用一組混標作為儀器質控。在每一個項目開始之前,先進行質控樣檢測,確認氣相色譜的分離度和質譜的整體響應。3)后期數據矯正,特別是對于大樣本項目。我們可以在檢測序列中加入隨行質控樣本(每個樣品取少量后混合),在后期數據處理時,使用質控樣本結合如LOESS之類的算法對整體數據進行矯正。山東個性化定制靶向代謝組學主要技術代謝組學是繼基因組學、蛋白質組學、轉錄組學后出現的新興“組學”。

代謝組學樣本收集植物組織:葉片、莖、花:1)取整片葉片/一段莖/一朵花,放入離心管或錫箔紙中并標記,迅速放入液氮中冷凍處理至少15 min。2)將裝有樣本的離心管迅速放入自封袋中(每組一袋),在自封袋中放入標簽紙注明樣本信息。3)迅速放入-80 ℃冰箱凍存。足量干冰寄送。注意:(1)采集葉片樣本時,在中午光照好的時間收集。(2)采集樣本時保持樣本一致性,尤其是同一組樣本(顏色、衰老程度、葉脈占比、光照、位置等)。根:1)取整株植物的根部,迅速用PBS緩沖液或者超純水漂洗掉根上的泥土、培養(yǎng)基或營養(yǎng)液等;2)吸水紙吸干水分后,分裝為500 mg/管;3)標號后迅速放入液氮中冷凍處理至少15 min,-80 ℃凍存,干冰寄送。

代謝組學疾病診斷應用:與基因組學和蛋白質組學相比,代謝組學的研究側重于相關特定組分的共性,是要涉及研究每一個代謝組分的共性、特性和規(guī)律,目前據此目標相距甚遠。盡管充滿了挑戰(zhàn),研究人員仍然堅信,與基因組學和蛋白質組學相比,代謝組學與生理學的聯系更加緊密。疾病導致機體病理生理過程變化,引起代謝產物發(fā)生相應的改變,通過對某些代謝產物進行分析,并與正常人的代謝產物比較,尋找疾病的生物標記物,將提供一種較好的疾病診斷方法。代謝組學作為系統(tǒng)生物學的一個重要的分支,與其他組學相比有著其特有的優(yōu)勢。

代謝組學發(fā)展至今,代謝組學技術已經遠遠超出了標準臨床化學技術的范圍,能夠精確分析數百至數千種代謝物。代謝組學提供了代謝表型的詳細表征,并可以在許多水平上進行精密醫(yī)學研究,包括表征疾病基礎的代謝紊亂,發(fā)現新的治靶標以及發(fā)現可用于診斷疾病或監(jiān)測藥物的活性。比較常見的代謝組學分析方法是質譜(MS)核磁共振(NMR)光譜。質譜技術又分為LC-MS和GC-MS。其基本原理是使試樣中各組分在離子源中發(fā)生電離,生成不同荷質比的帶電荷的離子,經加速電場的作用,形成離子束,進入質量分析器。在食品安全領域,利用代謝組學工具發(fā)現農獸藥等在動植物體內的相關生物標志物也是一個熱點領域。山東靶向代謝組學費用

代謝組學主要研究的是作為各種代謝路徑的底物和產物的小分子代謝物(MW<1000)。山東植物靶向代謝組學服務

代謝組學樣本收集指南:1.血漿樣本收集:(1)從合適的靜脈采集血液(典型10mL)到標記的肝素鋰血漿收集管中(肝素鋰用作抗凝劑)。(2)立即于4 °C離心(3000g)20min,上清液即為血漿。(3)離心完畢,取出血漿收集管,取上清液(血漿),分等份(0.5mL或0.1mL),轉移到凍存管中(冰上),旋蓋。(4)保存于-80℃冰箱。寄樣需足量干冰。2.血清樣本收集:(1)從合適的靜脈采集血液(典型10mL)到血清收集管中。(2)將血清收集管冰水?。?℃)凝集至少1h(2h以內),記錄凝集時間。(3)將血清收集管放到冷凍離心機中低溫(4℃)離心15min(2500 g)。(4)離心完畢,取出血清收集管,取上清液,分等份(0.5mL或0.1mL),轉移到凍存管中(冰上),旋蓋。(5)保存于-80℃冰箱。寄樣需足量干冰。山東植物靶向代謝組學服務