蛋白質(zhì)組學(xué)植物篇樣品寄樣要求：植物相較于動(dòng)物，蛋白占比不高，所以送樣在量上面的要求會(huì)多一些，推薦送500mg以上的量可以確保實(shí)驗(yàn)?zāi)軌蛱崛〉匠渥愕牡鞍?。如果是種仁、豆類等蛋白含量比較高的，200mg足以完成抽提。處理樣本需要用PBS將樣本表面的泥土等雜質(zhì)沖洗干凈，去除掉多余的組織。盡量能夠保證樣本的形態(tài)和純度，不推薦用錫紙包裹，放在EP管中使其形態(tài)完整為比較好。用液氮急速冷凍5min后置于-80℃環(huán)境中保存，送樣時(shí)需要添加干冰。蛋白質(zhì)組學(xué)包括蛋白與蛋白相互作用等。北京PRM定量蛋白質(zhì)組學(xué)服務(wù)

蛋白質(zhì)組學(xué)在醫(yī)學(xué)的研究應(yīng)用：蛋白質(zhì)組學(xué)(Proteomics)是研究細(xì)胞、組織或生物體中蛋白質(zhì)組成、定位、變化及其相互作用規(guī)律的科學(xué)。labelfree-非標(biāo)定量法分析技術(shù)方法：非標(biāo)定量法[Labelfree]是近年來重要的質(zhì)譜定量方法，通過比較質(zhì)譜分析次數(shù)或質(zhì)譜峰強(qiáng)度，分析不同來源樣品蛋白的數(shù)量變化。蛋白質(zhì)非標(biāo)記定量技術(shù)（LabelFree）是通過液質(zhì)聯(lián)用技術(shù)對(duì)蛋白質(zhì)酶解肽段進(jìn)行質(zhì)譜分析，無(wú)需使用昂貴的穩(wěn)定同位素標(biāo)簽做內(nèi)部標(biāo)準(zhǔn)，只需分析大規(guī)模鑒定蛋白質(zhì)時(shí)所產(chǎn)生的質(zhì)譜數(shù)據(jù)，比較不同樣品中相應(yīng)肽段的信號(hào)強(qiáng)度，從而對(duì)肽段對(duì)應(yīng)的蛋白質(zhì)進(jìn)行相對(duì)定量。河南蛋白質(zhì)組學(xué)研究蛋白質(zhì)組學(xué)與其它學(xué)科的交叉也將推動(dòng)新技術(shù)、新方法的發(fā)展。

Label Free 非標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)優(yōu)點(diǎn)：無(wú)需標(biāo)記，比較大程度的保留樣本的真實(shí)性；可以區(qū)分“有”、“無(wú)”蛋白；不受標(biāo)簽數(shù)量的限制，多個(gè)樣本可以同時(shí)進(jìn)行蛋白定量分析；不同物種和不同的樣本類型可以同時(shí)開展蛋白定量分析；處理步驟簡(jiǎn)單，成本低。 DIA 定量蛋白質(zhì)組學(xué)：數(shù)據(jù)非依賴性采集(DIA)是一種明顯提升蛋白質(zhì)組學(xué)研究通量和可重復(fù)性的技術(shù)。經(jīng)典的 DIA 流程通常依賴于 DDA 譜圖庫(kù)的構(gòu)建，需要消耗大量的樣品，且周期長(zhǎng)，成本高。越來越多的不依賴于 DDA 建庫(kù)的分析方法相繼誕生。

蛋白質(zhì)組學(xué)主要以全蛋白組（組織、細(xì)胞）、線粒體蛋白組、葉綠體蛋白組和外泌體蛋白組為研究對(duì)象，通過對(duì)蛋白組進(jìn)行定性、定量、分子功能分析、通路互作分析和蛋白互作分析，揭示生物學(xué)功能、作用機(jī)制、疾病診斷的標(biāo)志物以及預(yù)測(cè)蛋白的上、下游變化關(guān)系。蛋白質(zhì)組學(xué)可以克服核酸水平預(yù)測(cè)的不確定性、反映核酸翻譯后修飾情況。常用技術(shù)：非靶向蛋白組學(xué)：蛋白質(zhì)定性（膠條鑒定和溶液鑒定），高通量定量蛋白組（Labelfree、iTRAQ/TMT和DIA定量），多肽組學(xué)。蛋白質(zhì)組的復(fù)雜性也遠(yuǎn)遠(yuǎn)高于基因組，這是因?yàn)橐粋€(gè)基因≠一個(gè)轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物≠一個(gè)蛋白質(zhì)。

定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)：定量蛋白質(zhì)組學(xué)是蛋白質(zhì)組研究的重要內(nèi)容，通過對(duì)基因表達(dá)產(chǎn)物——蛋白質(zhì)的定量分析，以了解基因在不同的生理、病理和逆境條件下的表達(dá)情況。近年來，隨著非凝膠技術(shù)的發(fā)展，蛋白質(zhì)組學(xué)（“Shotgun”proteomics）技術(shù)，特別是多維蛋白質(zhì)鑒定（MultidimensionalProteinIdentification，MudPIT）已成為研究復(fù)雜生物樣本中大規(guī)模蛋白質(zhì)表達(dá)和定性和定量分析的強(qiáng)有力工具。蛋白質(zhì)組學(xué)在醫(yī)學(xué)的研究應(yīng)用：蛋白質(zhì)組學(xué)是研究細(xì)胞、組織或生物體中蛋白質(zhì)組成、定位、變化及其相互作用規(guī)律的科學(xué)。蛋白質(zhì)組學(xué)可以通過系統(tǒng)性地研究蛋白質(zhì)表達(dá)和翻譯后修飾變化對(duì)疾病的影響。北京PRM定量蛋白質(zhì)組學(xué)服務(wù)

蛋白質(zhì)組研究不只可以實(shí)現(xiàn)與基因組的關(guān)聯(lián)，揭示生命活動(dòng)的發(fā)生規(guī)律。北京PRM定量蛋白質(zhì)組學(xué)服務(wù)

iTRAQ/TMT標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組介紹：iTRAQ/TMT標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組研究是對(duì)一個(gè)基因組表達(dá)的全部蛋白質(zhì)或一個(gè)復(fù)雜混合體系內(nèi)所有蛋白質(zhì)進(jìn)行標(biāo)記，利用標(biāo)記試劑中的二級(jí)報(bào)告離子來對(duì)蛋白進(jìn)行精確鑒定和定量。技術(shù)優(yōu)勢(shì)：1、適用范圍廣：可檢測(cè)到的蛋白除了胞漿蛋白外，還有線粒體蛋白、膜蛋白。也能對(duì)任何類型的蛋白質(zhì)進(jìn)行鑒定，包括高分子量，酸性，堿性蛋白質(zhì)；2、高通量：一次可以實(shí)現(xiàn)多個(gè)樣品的定性定量分析，特別適用于采用多種處理方式或來自多個(gè)處理時(shí)間的樣本的差異蛋白分析。北京PRM定量蛋白質(zhì)組學(xué)服務(wù)