LC-MS非靶向代謝組學(xué)：LC-MS非靶向代謝組學(xué)通過(guò)液質(zhì)聯(lián)用（LC-MS）方法檢測(cè)生物體受外界刺激前后體內(nèi)大多數(shù)小分子代謝物的動(dòng)態(tài)變化，重點(diǎn)尋找在實(shí)驗(yàn)組和對(duì)照組中有明顯變化的代謝物，進(jìn)而研究這些代謝物與生理病理變化的相關(guān)關(guān)系，其研究對(duì)象大都是分子量1500Da以內(nèi)的小分子物質(zhì)。LC-MS非靶向代謝組學(xué)技術(shù)優(yōu)勢(shì)：1、較高的靈敏度、分辨率；2、較寬的動(dòng)態(tài)范圍；3、適合于生物樣本中復(fù)雜代謝產(chǎn)物的檢測(cè)和潛在標(biāo)志物的鑒定；4、適合對(duì)標(biāo)本中未知代謝物的探索研究。代謝組學(xué)主要技術(shù)手段是質(zhì)譜（MS）。深圳代謝組學(xué)主要技術(shù)
代謝組學(xué)的研究對(duì)象與層次有哪些？一般來(lái)說(shuō)，代謝組學(xué)關(guān)注的對(duì)象是分子量在1000以下的小分子化合物。根據(jù)研究的對(duì)象和目的不同，科學(xué)家將生物體系的代謝產(chǎn)物分析分為4個(gè)層次：代謝物靶標(biāo)分析：某一個(gè)或幾個(gè)特定組分的定性和定量分析，如某一類結(jié)構(gòu)、性質(zhì)相關(guān)的化合物（氨基酸、有機(jī)酸、順二醇類）或者某一代謝途徑的所有中間產(chǎn)物或多條代謝途徑的標(biāo)志性組分。代謝物指紋分析：同時(shí)對(duì)多個(gè)代謝物進(jìn)行分析，不分離鑒定具體單一組分。代謝輪廓分析：限定條件下對(duì)生物體內(nèi)特定組織內(nèi)的代謝產(chǎn)物的快速定性和半定量分析。代謝組分析：對(duì)生物體或體內(nèi)某一特定組織所包含的所有代謝物的定量分析，并研究該代謝物組在外界干預(yù)或病理生理?xiàng)l件下的動(dòng)態(tài)變化規(guī)律。南京代謝組學(xué)技術(shù)分析為什么選擇代謝組學(xué)作為科研技術(shù)手段？
代謝組學(xué)檢測(cè)的手段有哪些？主要技術(shù)手段是核磁共振（NMR ），液-質(zhì)聯(lián)用（LC-MS），氣-質(zhì)聯(lián)用（GC-MS），色譜（HPLC，GC）等。通過(guò)檢測(cè)一系列樣品的譜圖，再結(jié)合化學(xué)模式識(shí)別方法，可以判斷出生物體的病理生理狀態(tài)，基因的功能，藥物的毒性和藥效等，并有可能找出與之相關(guān)的生物標(biāo)志物（biomarker）。代謝組學(xué)可以檢測(cè)哪些樣品？代謝組學(xué)主要研究的是作為各種代謝路徑的底物和產(chǎn)物的小分子代謝物（MW<1000）。其樣品主要是尿液，血漿或血清，唾液，以及細(xì)胞和組織的提取液。我們也做過(guò)植物，微生物提取物，腦脊液昆蟲血淋巴，羊水，卵泡液，膝蓋滑液，眼淚，糞便及腸道內(nèi)容物提取液等。
如何獲得高質(zhì)量GC/MS代謝組學(xué)數(shù)據(jù)？實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)先不談，在儀器分析階段，若想獲得高質(zhì)量數(shù)據(jù)，有以下幾個(gè)方面需要注意。1）前處理方法的一致性。不同實(shí)驗(yàn)人員操作方式不盡相同。因此，一個(gè)項(xiàng)目應(yīng)當(dāng)只由一個(gè)人負(fù)責(zé)前處理。推薦使用自動(dòng)衍生設(shè)備，以減少人為的誤差。2）檢測(cè)之前需確保儀器處于比較好工作狀態(tài)。儀器的控制軟件都有系統(tǒng)自檢功能，可以快速便捷地核查質(zhì)譜儀器的狀態(tài)。但更重要的是氣相色譜狀態(tài)，推薦使用一組混標(biāo)作為儀器質(zhì)控。在每一個(gè)項(xiàng)目開始之前，先進(jìn)行質(zhì)控樣檢測(cè)，確認(rèn)氣相色譜的分離度和質(zhì)譜的整體響應(yīng)。3）后期數(shù)據(jù)矯正，特別是對(duì)于大樣本項(xiàng)目。我們可以在檢測(cè)序列中加入隨行質(zhì)控樣本（每個(gè)樣品取少量后混合），在后期數(shù)據(jù)處理時(shí)，使用質(zhì)控樣本結(jié)合如LOESS之類的算法對(duì)整體數(shù)據(jù)進(jìn)行矯正。非靶向代謝組學(xué)（Untargeted metabolomics）即非目標(biāo)代謝組學(xué)或發(fā)現(xiàn)代謝組學(xué)。
靶向代謝組學(xué)分析成功的關(guān)鍵因素是準(zhǔn)確度、高通量和可靠性。靶向代謝組學(xué)鑒定一般采用 GC/MS 系統(tǒng)的選擇性離子監(jiān)測(cè) (SIM)，或在三重串聯(lián)四極桿 LC/MS 系統(tǒng)上用多反應(yīng)離子監(jiān)測(cè) (MRM) 進(jìn)行靶向 MS/MS。SIM 比全掃描圖譜采集具有更高的靈敏度，在單四極桿質(zhì)譜中,這種靈敏度增強(qiáng)的原因是延長(zhǎng)了所選擇離子的采集時(shí)間。因?yàn)楸O(jiān)測(cè)的是一個(gè)很小的質(zhì)量窗口，所以質(zhì)量色譜圖只表示對(duì)極為特定質(zhì)量的檢測(cè)。在大多數(shù)情況下，靈敏度可以提高 10 倍。MRM 是進(jìn)行質(zhì)譜定量的選擇方法，與 SIM 相比更為靈敏、更加特異。可以產(chǎn)生獨(dú)特的碎片離子，可對(duì)非常復(fù)雜基質(zhì)中的目標(biāo)化合物進(jìn)行監(jiān)測(cè)和定量。代謝組學(xué)的研究介于基因、蛋白質(zhì)和細(xì)胞、組織之間。上海動(dòng)物靶向代謝組學(xué)服務(wù)
非靶向代謝組學(xué)重點(diǎn)在于比較實(shí)驗(yàn)組和對(duì)照組，發(fā)現(xiàn)尋找其種具有明顯的變化的代謝物質(zhì)。深圳代謝組學(xué)主要技術(shù)
代謝組學(xué)可以檢測(cè)的樣品種類有哪些？代謝組學(xué)主要研究的是作為各種代謝路徑的底物和產(chǎn)物的小分子代謝物（分子量<1000）。其樣品主要是血漿或血清，尿液，唾液，以及細(xì)胞和組織的提取液。我們也和一些公司或單位（如茶葉公司、制酒公司、酸奶公司、醫(yī)院等）合作，做過(guò)植物，微生物提取物，腦脊液，昆蟲血淋巴，羊水，卵泡液，膝蓋滑液，眼淚，胎盤，糞便及腸道內(nèi)容物提取液等。一般代謝組學(xué)能檢測(cè)出多少物質(zhì)？同的質(zhì)譜平臺(tái)靈敏度及偏向性都不一樣，而且不同平臺(tái)之間具有互補(bǔ)性。一般來(lái)說(shuō)GC/MS檢測(cè)血清樣品能準(zhǔn)確定性的物質(zhì)約200個(gè)左右，檢測(cè)尿液樣品定性的物質(zhì)約200個(gè)左右，其他樣品（如肝臟，糞便，腸道內(nèi)容物）也在幾百這個(gè)數(shù)量級(jí)。如果采用全二維GC/MS，物質(zhì)的數(shù)量要更多，可達(dá)1千以上。LC/MS檢測(cè)物質(zhì)的數(shù)量要遠(yuǎn)比GC/MS多，但能準(zhǔn)確定性和定量的不多，視不同的平臺(tái)(TQ、QTOF等)能達(dá)到幾十至2-3百個(gè)物質(zhì)。深圳代謝組學(xué)主要技術(shù)