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武漢定量蛋白組學價格

來源: 發(fā)布時間:2022-05-22

蛋白質(zhì)組結(jié)果一般需要做哪些方面的生物信息學分析?目前一般文獻中的分析主要為維恩圖分析、熱圖分析、火山圖分析、層次聚類分析、蛋白質(zhì)功能分析(GO分類為主)、蛋白質(zhì)所屬代謝通路富集分析(基于KEGG的pathway)、差異蛋白互作網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建、轉(zhuǎn)錄因子預(yù)測等方面。其它一些比較特異的高級分析包括多組數(shù)據(jù)關(guān)聯(lián)分析、多pathway延伸分析、磷酸蛋白激酶預(yù)測分析、互作網(wǎng)絡(luò)及生物調(diào)控模型構(gòu)建分析。定量蛋白質(zhì)組學技術(shù)主要分為標記(label)和非標記(labelfree)定量策略,標記策略又分為體內(nèi)標記和體外標記兩種。細胞內(nèi)蛋白質(zhì)組豐度的動態(tài)變化對各種生命過程有重要影響。例如在許多疾病的發(fā)生和發(fā)展進程中,常常伴隨著某些蛋白質(zhì)的表達異常。定量蛋白質(zhì)組學就是把一個基因組表達的全部蛋白質(zhì)或一個復(fù)雜的混合體系中所有的蛋白質(zhì)進行精確的定量和鑒定。對人類而言,蛋白質(zhì)組學的研究要服務(wù)于人類的健康,主要指促進分子醫(yī)學的發(fā)展。如尋找藥物的靶分子。武漢定量蛋白組學價格

蛋白質(zhì)組學研究策略:蛋白質(zhì)組學研究主要分為自底向上(Bottom-Up),自頂向下(Top-Down)和自中向下(Middle-Down)三種策略。“自底向上”策略是指通過分析由蛋白質(zhì)酶解生成的肽段來鑒定蛋白質(zhì)。當應(yīng)用該策略來分析蛋白質(zhì)組混合物時,因其類似于基因組測序的鳥管法,所以又被稱為鳥管法蛋白質(zhì)組學(Shotgun Proteomics),該策略依賴于蛋白酶的酶切?!白灾邢蛳隆辈呗砸惨蕾囉诘鞍酌傅拿盖?,但是由于采用了另外的酶,比如OmpT,只能酶切(Lys/Arg-Lys/Arg),因此酶切之后的分子量較大,更利于后續(xù)的蛋白組裝環(huán)節(jié)。武漢定量蛋白組學價格我們通過研究蛋白質(zhì)組,可以為患者提供有用的疾病診斷、預(yù)后評估信息。

蛋白質(zhì)組學研究內(nèi)容:1.蛋白質(zhì)鑒定:可以利用一維電泳和二維電泳并結(jié)合相關(guān)技術(shù),利用蛋白質(zhì)芯片和抗體芯片及免疫共沉淀等技術(shù)對蛋白質(zhì)進行鑒定研究。2.翻譯后修飾:很多mRNA表達產(chǎn)生的蛋白質(zhì)要經(jīng)歷翻譯后修飾如磷酸化,糖基化,酶原刺激等。翻譯后修飾是蛋白質(zhì)調(diào)節(jié)功能的重要方式,因此對蛋白質(zhì)翻譯后修飾的研究對闡明蛋白質(zhì)的功能具有重要作用。3.蛋白質(zhì)功能確定:如分析酶活性和確定酶底物,細胞因子的生物分析/配基-受體結(jié)合分析??梢岳没蚯贸头戳x技術(shù)分析基因表達產(chǎn)物-蛋白質(zhì)的功能。另外對蛋白質(zhì)表達出來后在細胞內(nèi)的定位研究也在一定程度上有助于蛋白質(zhì)功能的了解。有的熒光蛋白表達系統(tǒng)就是研究蛋白質(zhì)在細胞內(nèi)定位的一個很好的工具。

蛋白質(zhì)組學與基因組學的差異:蛋白質(zhì)組和基因組(genome)在概念上有相關(guān)性,某一個蛋白質(zhì)組的蛋白質(zhì)是由其基因組所編碼的,然而蛋白質(zhì)組學和基因組學在研究對象和研究方法上有很大的區(qū)別?;蚪M在所有的細胞中幾乎都是完整的,與之不同,蛋白質(zhì)組具有很高的細胞和組織特異性,不同的細胞組織表達不同的蛋白質(zhì)組。蛋白質(zhì)組的復(fù)雜性也遠遠高于基因組,這是因為一個基因≠一個轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物≠一個蛋白質(zhì)。比如據(jù)估計人的基因組由30000個基因組成,經(jīng)mRNA剪切和蛋白質(zhì)翻譯后修飾將產(chǎn)生20萬~200萬個蛋白質(zhì)。由于不同的轉(zhuǎn)錄起始和mRNA剪切使同一基因產(chǎn)生了不同的轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物。同樣由于不同的翻譯起始,一個mRNA可以翻譯成不同的蛋白質(zhì)。蛋白質(zhì)組學包括蛋白與蛋白相互作用等。

蛋白質(zhì)組學植物篇樣品寄樣要求:植物相較于動物,蛋白占比不高,所以送樣在量上面的要求會多一些,推薦送500mg以上的量可以確保實驗?zāi)軌蛱崛〉匠渥愕牡鞍?。如果是種仁、豆類等蛋白含量比較高的,200mg足以完成抽提。處理樣本需要用PBS將樣本表面的泥土等雜質(zhì)沖洗干凈,去除掉多余的組織。盡量能夠保證樣本的形態(tài)和純度,不推薦用錫紙包裹,放在EP管中使其形態(tài)完整為比較好。用液氮急速冷凍5min后置于-80℃環(huán)境中保存,送樣時需要添加干冰。蛋白質(zhì)組研究技術(shù)在研究對象上,覆蓋了原核微生物、真核微生物、植物和動物等范圍。山東高通量蛋白質(zhì)組學分析研究

定量蛋白質(zhì)組學技術(shù)主要分為標記(label)和非標記(label free)定量策略。武漢定量蛋白組學價格

蛋白質(zhì)組學基礎(chǔ)研究方面:近兩年來蛋白質(zhì)組研究技術(shù)已被應(yīng)用到各種生命科學領(lǐng)域,如細胞生物學、神經(jīng)生物學等。在研究對象上,覆蓋了原核微生物、真核微生物、植物和動物等范圍,涉及到各種重要的生物學現(xiàn)象,如信號轉(zhuǎn)導(dǎo)、細胞分化、蛋白質(zhì)折疊等等。在未來的發(fā)展中,蛋白質(zhì)組學的研究領(lǐng)域?qū)⒏悠毡?。?yīng)用研究方面:蛋白質(zhì)組學將成為尋找疾病分子標記和藥物靶標比較有效的方法之一。在對早老性癡呆等人類重大疾病的臨床診斷和治理方面蛋白質(zhì)組技術(shù)也有十分誘人的前景,目前國際上許多大型藥物公司正投入大量的人力和物力進行蛋白質(zhì)組學方面的應(yīng)用性研究。武漢定量蛋白組學價格