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什么叫轉(zhuǎn)錄組?廣義轉(zhuǎn)錄組是指生命單元(通常是一種細(xì)胞)中所有按基因信息單元轉(zhuǎn)錄和加工的RNA分子(包括編碼和非編碼RNA功能單元),或者是一個(gè)特定細(xì)胞所有轉(zhuǎn)錄本的總和.它的研究對(duì)象就是這些RNA與蛋白質(zhì)分子和它們所組成的基因功能網(wǎng)絡(luò)以及它們與細(xì)胞功能的關(guān)系.而狹義轉(zhuǎn)錄組是指可直接參與翻譯蛋白質(zhì)的mRNA總和.研究生物細(xì)胞中轉(zhuǎn)錄組的發(fā)生和變化規(guī)律的科學(xué)就稱為轉(zhuǎn)錄組學(xué)(tran—scriptomics).轉(zhuǎn)錄組學(xué)的意義1.轉(zhuǎn)錄組譜可以提供特定條件下某些基因表達(dá)的信息,并據(jù)此推斷相應(yīng)未知基因的功能,揭示特定調(diào)節(jié)基因的作用機(jī)制.2.通過(guò)基于基因表達(dá)譜的分子標(biāo)簽,不僅可以辨別細(xì)胞的表型歸屬,還可以用于疾病的診斷.3.轉(zhuǎn)錄組的研究應(yīng)用于臨床的另一個(gè)例子是可以將表面上看似相同的病癥分為多個(gè)亞型,尤其是對(duì)原發(fā)性惡性瘤子,通過(guò)轉(zhuǎn)錄組差異表達(dá)譜的建立,可以詳細(xì)描繪出患者的生存期以及對(duì)藥物的反應(yīng)等。轉(zhuǎn)錄組學(xué)狹義上指所有mRNA的組合。廣州轉(zhuǎn)錄組學(xué)檢測(cè)多少錢
什么是轉(zhuǎn)錄組測(cè)序?轉(zhuǎn)錄組廣義上指在某一生理?xiàng)l件下,細(xì)胞內(nèi)所有轉(zhuǎn)錄組產(chǎn)物的組合,包括:mRNA、ncRNA、rRNA等;狹義上指所有mRNA的組合。轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的研究對(duì)象為特定細(xì)胞在某一功能狀態(tài)下所能轉(zhuǎn)錄出來(lái)的所有RNA的總和,主要包括mRNA和ncRNA。轉(zhuǎn)錄組具有時(shí)間特異性、組織特異性、空間特異性等特點(diǎn)。普通轉(zhuǎn)錄組測(cè)序適用于哪些情況?普通轉(zhuǎn)錄組測(cè)序主要適用于兩大類:一是不同的生長(zhǎng)階段或者發(fā)育過(guò)程;二是不同的環(huán)境、藥物、病原菌等逆境脅迫處理。哈爾濱IncRNA轉(zhuǎn)錄組學(xué)領(lǐng)域轉(zhuǎn)錄組學(xué)能夠同時(shí)鑒定和定量稀有轉(zhuǎn)錄本和正常轉(zhuǎn)錄本。
轉(zhuǎn)錄組學(xué)應(yīng)用于胃腸瘤轉(zhuǎn)移機(jī)制研究:circRNA是一種非編碼RNA,可以多種方式參與生物學(xué)功能,如細(xì)胞增殖、細(xì)胞周期、侵襲和轉(zhuǎn)移等。近年來(lái)研究發(fā)現(xiàn),環(huán)狀RNA可以通過(guò)海綿吸附微小RNA和RNA結(jié)合蛋白參與轉(zhuǎn)錄后調(diào)控,從而影響瘤耐藥過(guò)程中的DNA修復(fù)、凋亡、增殖、細(xì)胞轉(zhuǎn)運(yùn),以及介導(dǎo)瘤耐藥的細(xì)胞內(nèi)酶,進(jìn)而在瘤耐藥中發(fā)揮重要調(diào)節(jié)作用。轉(zhuǎn)錄組學(xué)應(yīng)用領(lǐng)域:農(nóng)林領(lǐng)域:生長(zhǎng)發(fā)育機(jī)制,抗逆脅迫機(jī)制,育種,物種保護(hù)研究等;畜牧業(yè):生長(zhǎng)發(fā)育機(jī)制,致病機(jī)理研究,肉類及乳制品品質(zhì)研究等。
宏轉(zhuǎn)錄組分析:從以G為單位的高通量測(cè)序數(shù)據(jù)中獲取研究所需的微生物種類、基因、通路等信息是進(jìn)行宏轉(zhuǎn)錄組研究必須經(jīng)歷的一步。現(xiàn)在網(wǎng)絡(luò)上分析組學(xué)數(shù)據(jù)的工具五花八門。能否從眾多組學(xué)工具中選擇出適合分析宏轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的軟件,能否搭建一套完整、快速、高效、靈敏、高精確的宏轉(zhuǎn)錄組分析pipline,直接關(guān)乎到后期數(shù)據(jù)分析的進(jìn)行。這種技術(shù)不只具有宏基因組技術(shù)的全部?jī)?yōu)點(diǎn),可以檢測(cè)環(huán)境中的活性微生物、活性轉(zhuǎn)錄本以及活性功能進(jìn)行研究,還可以比較不同環(huán)境下的差異表達(dá)基因和差異功能途徑,揭示微生物在不同環(huán)境壓力下的適應(yīng)機(jī)制,探索環(huán)境與微生物之間的互作機(jī)理。轉(zhuǎn)錄組學(xué)是一門在整體水平上研究細(xì)胞中基因轉(zhuǎn)錄的情況及轉(zhuǎn)錄調(diào)控規(guī)律的學(xué)科。
circRNA轉(zhuǎn)錄組學(xué)生物學(xué)功能:circRNA主要存在于細(xì)胞質(zhì)或外泌體中,具有組織特異性、疾病特異性、時(shí)序特異性及高穩(wěn)定性等特征。近幾年,大量的研究表明circRNA在生物的生長(zhǎng)發(fā)育、脅迫應(yīng)答、疾病發(fā)生和發(fā)展等方面密切相關(guān),并預(yù)測(cè)其在疾病診斷標(biāo)記物等方面的應(yīng)用前景,但其生物學(xué)功能在很大程度上仍然未知。目前認(rèn)可度比較高的circRNA生物學(xué)功能。circRNA轉(zhuǎn)錄組學(xué)成環(huán)機(jī)制:circRNA環(huán)化方式分為內(nèi)含子環(huán)化和外顯子環(huán)化。目前主流的成環(huán)機(jī)制可歸類為:依賴于剪切體的索尾插接環(huán)化。在mRNA前體上,通過(guò)連續(xù)的組裝小核核糖體蛋白從而催化外顯子下游的5′ 供體的位點(diǎn)連接到上游的3′ 受體的位點(diǎn),索尾插接形成環(huán)化,然后通過(guò)剪切形成circRNA。順式作用元件促進(jìn)circRNA形成。轉(zhuǎn)錄組學(xué)能夠檢測(cè)未知基因,發(fā)現(xiàn)新的轉(zhuǎn)錄本。濟(jì)南靶向轉(zhuǎn)錄組學(xué)應(yīng)用
轉(zhuǎn)錄學(xué)組測(cè)序能夠提供更普遍的檢測(cè)范圍。廣州轉(zhuǎn)錄組學(xué)檢測(cè)多少錢
轉(zhuǎn)錄組學(xué)應(yīng)用領(lǐng)域:農(nóng)林領(lǐng)域:生長(zhǎng)發(fā)育機(jī)制,抗逆脅迫機(jī)制,育種,物種保護(hù)研究等;畜牧業(yè):生長(zhǎng)發(fā)育機(jī)制,致病機(jī)理研究,肉類及乳制品品質(zhì)研究等;海洋水產(chǎn):生長(zhǎng)發(fā)育機(jī)制,漁業(yè)資源,漁業(yè)環(huán)境與水產(chǎn)品安全等;微生物:致病機(jī)理,耐藥機(jī)制,病原體-宿主相互作用研究等;生物醫(yī)藥:生物標(biāo)志物,疾病機(jī)理機(jī)制,疾病分型,藥物開發(fā),個(gè)性化醫(yī)治等;環(huán)境科學(xué):發(fā)酵過(guò)程優(yōu)化,生物燃料生產(chǎn),環(huán)境危害風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估研究等;食品科學(xué):食品儲(chǔ)藏及加工條件優(yōu)化,食品組分及品質(zhì)鑒定,功能性食品開發(fā),食品安全監(jiān)檢測(cè)等。廣州轉(zhuǎn)錄組學(xué)檢測(cè)多少錢