乙?;揎椀鞍捉M學實驗流程:1)組織/細胞破碎,提取蛋白質;2)蛋白酶解成多肽片段;3)對多肽片段進行 iTRAQ 標記;4)高效特異性乙?;贵w富集乙酰化修飾肽段;5)使用 LC-MS/MS 對富集的乙?;亩芜M行序列分析;5)數據分析,比對不同樣本中蛋白乙?;揎椝讲町?,并對產生變化的生物學意義進行解釋。乙?;且粋€普遍而重要的蛋白質翻譯后修飾,不僅集中在對細胞染色體結構的影響以及對核內轉錄調控因子方面,而且還影響參與細胞周期和新陳代謝、肌動蛋白聚合控制及多聚谷氨酰胺疾病等方方面面。乙酰化不僅存在于真核細胞中,而且越來越多的證據也表明乙?;瑯佑绊懺S多原核細胞的生理生化過程。蛋白質糖基化修飾組學技術怎么確定位點?南京糖基化修飾蛋白質組學主要技術
泛素化修飾蛋白質組學介紹: 蛋白質泛素化修飾(Ubiquitylation)是一種常見的蛋白質翻譯后修飾,是指一個或多個泛素分子(Ubiquitin,由76個氨基酸組成的多肽)在一系列特殊的酶作用下,將細胞內的蛋白質分類,從中選出靶蛋白分子,并對靶蛋白進行特異性修飾的過程。泛素化修飾是一種重要的翻譯后修飾,泛素-蛋白酶體系統介導了真核生物80%~85%的蛋白質降解。除參與蛋白質降解之外,泛素化修飾還參與了細胞周期、增殖、細胞凋亡、分化、轉錄調控、基因表達、轉錄調節(jié)、信號傳遞、損傷修復、炎癥免疫等幾乎一切生命活動的調控。廣州棕櫚酰化修飾蛋白質組學研究蛋白質翻譯后修飾PTMs通常包括磷酸化,糖基化,泛素化,亞硝基化,甲基化,乙?;|化和蛋白水解。
蛋白質翻譯后修飾的重要性:翻譯后修飾可以發(fā)生在蛋白質生命周期的任何階段。例如,許多蛋白質在翻譯完成后不久就被修飾,以介導適當的蛋白質折疊或穩(wěn)定,或將新生蛋白質引導到不同的細胞區(qū)室(例如,細胞核、膜)。折疊和定位完成后發(fā)生其他修飾,以刺激或滅活催化活性或以其他方式影響蛋白質的生物活性。蛋白質也與靶向降解蛋白質的標簽共價連接。除了單一的修飾外,蛋白質通常還通過翻譯后切割和通過蛋白質成熟的分步機制增加功能基團的組合進行修飾。分析蛋白質及其翻譯后修飾對于心臟病、神經退行性疾病和糖尿病的研究尤為重要。PTMs 的特征,雖然具有挑戰(zhàn)性,但提供了對病因學過程下的細胞功能的無價的洞察。在技術上,研究翻譯后修飾蛋白的主要挑戰(zhàn)是開發(fā)特異性的檢測和純化方法。幸運的是,這些技術障礙正在用各種新的和精煉的蛋白質組學技術來克服。
蛋白質翻譯后修飾組學技術原理:首先將蛋白樣本酶解成肽段混合物,然后使用液相色譜對酶解后的肽段混合物進行組分分離以降低樣本復雜程度,然后通過高質量的修飾類抗體和生物材料對修飾肽段進行富集,之后上樣至液相色譜 - 串聯質譜中進行分析,通過相應的數據庫檢索匹配,一次可鑒定成百上千個修飾位點。蛋白質磷酸化位點分析樣品經酶解后,用 TiO2 微球對磷酸化肽段進行富集,富集后的產物由質譜分析,并通過軟件完成數據檢索。琥珀?;揎椀鞍踪|組技術特點:采用主流抗體親和富集方法,特異性高,富集效率好。蛋白質的翻譯后修飾是一個復雜的過程。
蛋白質翻譯后修飾加入的官能團反應有:1、乙?;ǔS诘鞍踪|的N末端加入乙酰。2、烷基化——加入如甲基或乙基等烷基。3、甲基化——烷基化中常見的一種,在賴氨酸、精氨酸等的側鏈氨基上加入甲基。4、生物素化——用生物素附加物令保存的賴氨酸?;?、谷氨酸化——在谷氨酸與導管素及其他蛋白質之間建立共價鍵。6、甘氨酸化——在一個至超過40種甘氨酸與導管素的C末端建立共價鍵。7、糖化——將糖基加入天冬酰胺、羥離氨酸、絲氨酸或蘇氨酸,形成糖蛋白。8、異戊二烯化——加入如法呢醇及四異戊二烯等異戊二烯。9、硫辛酸化——附著硫辛酸的功能性。大多數翻譯后修飾蛋白以低化學計量和豐度存在,這限制了在分析全細胞裂解液時對其的檢測。廣州棕櫚?;揎椀鞍踪|組學研究
泛素化修飾蛋白組學是一種重要的翻譯后修飾。南京糖基化修飾蛋白質組學主要技術
翻譯后修飾蛋白組分析:蛋白質翻譯后修飾是影響蛋白質功能并調節(jié)整個細胞過程的重要方式,幾乎在每個細胞過程中都是不可或缺的。分析和鑒定翻譯后修飾蛋白質對揭示蛋白質的功能和深入了解各種生理現象具有重要意義。大多數翻譯后修飾蛋白以低化學計量和豐度存在,這限制了在分析全細胞裂解液時對其的檢測。蛋白質是各種細胞功能比較重要的執(zhí)行者,其功能正常與否決定著生命活動能否有序、高效的進行,而其中翻譯后修飾起著至關重要的作用。翻譯后修飾改變了蛋白質中不同氨基酸殘基上的生物化學官能團,進而改變其化學性質或結構,使得蛋白質具有更為復雜的結構和更為完善的功能,實現更為精細的調節(jié)。蛋白質的翻譯后修飾過程極其復雜,已知的翻譯后修飾種類有20多種。但其中較為常見的主要是磷酸化、泛素化、SUMO化、酰(含乙酰)化、甲基化以及糖基化。南京糖基化修飾蛋白質組學主要技術