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廣州醫(yī)學蛋白質組學技術

來源: 發(fā)布時間:2022-05-27

蛋白質組結果一般需要做哪些方面的生物信息學分析?目前一般文獻中的分析主要為維恩圖分析、熱圖分析、火山圖分析、層次聚類分析、蛋白質功能分析(GO分類為主)、蛋白質所屬代謝通路富集分析(基于KEGG的pathway)、差異蛋白互作網(wǎng)絡構建、轉錄因子預測等方面。其它一些比較特異的高級分析包括多組數(shù)據(jù)關聯(lián)分析、多pathway延伸分析、磷酸蛋白激酶預測分析、互作網(wǎng)絡及生物調控模型構建分析。定量蛋白質組學技術主要分為標記(label)和非標記(labelfree)定量策略,標記策略又分為體內標記和體外標記兩種。細胞內蛋白質組豐度的動態(tài)變化對各種生命過程有重要影響。例如在許多疾病的發(fā)生和發(fā)展進程中,常常伴隨著某些蛋白質的表達異常。定量蛋白質組學就是把一個基因組表達的全部蛋白質或一個復雜的混合體系中所有的蛋白質進行精確的定量和鑒定。蛋白質組學與其它學科的交叉也將推動新技術、新方法的發(fā)展。廣州醫(yī)學蛋白質組學技術

蛋白質組學(英語:proteomics,又譯作蛋白質體學),是以蛋白質組為研究對象,研究細胞、組織或生物體蛋白質組成及其變化規(guī)律的科學。蛋白質組學研究不只是探索生命奧秘的必須工作,也能為人類健康事業(yè)帶來巨大的利益,是生命科學進入后基因時代的特征。蛋白質是生命存在和運動的物質基礎,是細胞增殖、分化、衰老和凋亡等重大生命活動的執(zhí)行者,亦是基因功能活動的之后的執(zhí)行者,是生命現(xiàn)象復雜性和多變性的直接體現(xiàn)者。蛋白質組研究是為了識別及鑒定一個細胞或組織所表達的全部蛋白質以及它們的表達模式,是對基因組研究的重要補充,是對生物體在蛋白質水平上定量、動態(tài)、整體性的研究。這類研究有助于了解蛋白的結構、細胞的功能、生命的本質及活動規(guī)律,為疾病的診斷、疫苗及新藥開發(fā)提供科學依據(jù)。廣州醫(yī)學蛋白質組學技術蛋白質組研究技術在研究對象上,覆蓋了原核微生物、真核微生物、植物和動物等范圍。

蛋白質組學(Proteomics)處于早期“發(fā)育”狀態(tài),這個領域的**否認它是單純的方法學,就像基因組學一樣,不是一個封閉的、概念化的穩(wěn)定的知識體系,而是一個領域.蛋白質組學集中于動態(tài)描述基因調節(jié),對基因表達的蛋白質水平進行定量的測定,鑒定疾病、藥物對生命過程的影響,以及解釋基因表達調控的機制.作為一門科學。蛋白質組學在醫(yī)療和健康方面有什么應用?基于質譜的蛋白質組學是目前比較主流的高通量蛋白質研究手段,當前在醫(yī)療健康方面的應用主要集中于基礎研究和轉化醫(yī)學。

定量蛋白質組學的方法學背景意義:從生命活動的直接執(zhí)行者——蛋白質的角度研究生命現(xiàn)象和規(guī)律(特別是疾病防治和病理研究)已成為研究生命科學的主要手段。而這些研究往往離不開對細胞、組織中含有蛋白質種類和表達量的研究。對處不同時期、不同條件下蛋白質表達水平變化的研究,識別功能模塊和路徑,監(jiān)控疾病的生物標志物,這些研究都需要對蛋白質進行鑒定和定量。生物質譜技術的出現(xiàn)和不斷成熟為蛋白質差異表達分析提供了更可靠、動態(tài)范圍更廣的研究手段。蛋白質組學將成為尋找疾病分子標記和藥物靶標有效的方法之一。

蛋白質組學在醫(yī)療和健康方面有什么應用?作為主要研究策略的蛋白質組學:這與題目中的描述更相關些,蛋白質組學是研究中的關鍵方法(甚至是唯1方法)。具體而言,蛋白質組學在此類應用中,更多地用于提供高通量蛋白質定性定量信息。作為檢測手段的蛋白質組學:事實上,在當前的生物醫(yī)學Q研究和臨床診斷中,蛋白質組學相關技術有非常多的應用。因為蛋白質組學技術的本質(從分析化學角度來看),就是對蛋白質的定性定量分析。生物醫(yī)學和臨床診斷中,需要大量表征一種或多種蛋白質的含量、氨基酸序列、翻譯后修飾等信息。蛋白質組學相關技術目前在一小部分應用中具有獨特優(yōu)勢。有很多蛋白質組學的研究者在工業(yè)界和醫(yī)院進行相關研究和日常工作。蛋白質組意指“一種基因組所表達的全套蛋白質”,即包括一種細胞乃至一種生物所表達的全部蛋白質。深圳Label free多肽組學一般流程

蛋白質組和基因組在概念上有相關性。廣州醫(yī)學蛋白質組學技術

iTRAQ定量蛋白組學技術:iTRAQ(Isobaric Tag for Relative Absolute Quantitation)定量蛋白質組學技術多肽體外標記定量技術。這種技術同TMT定量蛋白組學技術相似,可研究不同病理條件下或者不同發(fā)育階段的組織樣品中蛋白質表達水平的差異。Label-free:Label-free定量,即非標記的定量蛋白質組學,不需要對比較樣本做特定標記處理,只需要比較特定肽段/蛋白在不同樣品間的色譜質譜響應信號便可得到樣品間蛋白表達量的變化,通常用于分析大規(guī)模蛋白鑒定和定量時所產(chǎn)生的質譜數(shù)據(jù)。廣州醫(yī)學蛋白質組學技術