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代謝組學疾病診斷應用:與基因組學和蛋白質組學相比,代謝組學的研究側重于相關特定組分的共性,是要涉及研究每一個代謝組分的共性、特性和規(guī)律,目前據(jù)此目標相距甚遠。盡管充滿了挑戰(zhàn),研究人員仍然堅信,與基因組學和蛋白質組學相比,代謝組學與生理學的聯(lián)系更加緊密。疾病導致機體病理生理過程變化,引起代謝產物發(fā)生相應的改變,通過對某些代謝產物進行分析,并與正常人的代謝產物比較,尋找疾病的生物標記物,將提供一種較好的疾病診斷方法。代謝組學與臨床化學較為相似。武漢LC-MS/MS非靶向代謝組學費用
代謝組學細胞樣本收集:懸浮細胞:1)連同培養(yǎng)基轉移到1.5 mL的進口離心管中。2)低速離心5 min(低于3000 rpm),使細胞沉淀于離心管的底部(1*107個細胞為宜)。3)倒掉培養(yǎng)基(盡量倒干凈),用預冷的PBS反復沖洗2 ~ 3次,低速離心5 min,棄上清。4)標記離心管,將離心管的尖的一端插入液氮中,淬滅細胞沉淀1 min,-80 ℃凍存,干冰寄送。注意事項:1. 培養(yǎng)基傾倒時盡量倒干凈,可使用濾紙將殘留培養(yǎng)液吸凈;2. 甲醇/水請使用色譜純及以上規(guī)格;3. 液氮淬滅細胞時,請小心避免離心管破碎導致樣本受損;4. 建議細胞樣本在進行培養(yǎng)時多準備樣本,以備后續(xù)使用。武漢LC-MS/MS非靶向代謝組學費用代謝組學是用來解決什么問題的呢?
代謝組學有哪些應用?近年來,代謝組學技術得到了迅速發(fā)展,主要可應用于:功能基因組學、疾病早期診斷、病因病機研究、藥物毒理學、中醫(yī)藥現(xiàn)代化、植物代謝組學、微生物代謝組學、營養(yǎng)學、環(huán)境科學等生命科學的各個領域。為什么要選擇代謝組學?首先需要明確的是代謝組學的目標分析物主要為生物小分子及其代謝產物,如糖、有機酸、脂質、維生素、氨基酸、芳香烴之類等化合物。所以,如果關注的是小分子物質,那么采用代謝組學的方法,可以對樣品內檢測到的小分子物質進行定性、定量分析。同于基因組學和蛋白組學,代謝組學的研究反映某一時刻下正在發(fā)生的生命活動情況,研究代謝物的表達量、代謝物與生理病理變化的關系,能夠幫助尋找新的生物標記物,發(fā)現(xiàn)新的代謝途徑,以及更進一步深入了解目前已知的這些途徑,應用于疾病的早期診斷、藥物靶點的發(fā)現(xiàn)、疾病的病理生理研究。
選擇代謝組學作為科研技術手段的優(yōu)勢有哪些?1、代謝組學的研究處于生物信息流的中游,介于基因、蛋白質和細胞、組織之間,在生物信息的傳遞中起到承上啟下的作用。2、小分子的產生和代謝是基因表達的下游產物,生物體液的代謝產物分析能夠更直接,更準確的反映生物體的病理生理狀態(tài)。3、代謝物的種類少,大約在103個數(shù)量級,要遠小于基因和蛋白質的數(shù)據(jù),物質的分子結構要簡單得多,分析起來更簡單明了。4、代謝組學的代謝物信息庫簡單,它遠沒有全基因組測序及大量表達序列標簽的數(shù)據(jù)庫那么復雜。5、基因和蛋白質表達的有效微小變化會在代謝物上得到放大,從而使檢測更容易。6、代謝產物在各個生物體系中都是類似的,所以代謝組學研究中采用的技術更容易在各個領域中通用,也更容易被人接受。代謝組學在食品安全領域,利用代謝組學工具發(fā)現(xiàn)農獸藥等在動植物體內的相關生物標志物也是一個熱點領域。
代謝組學概念:基因與蛋白質的表達緊密相連,而代謝物則更多地反映了細胞所處的環(huán)境,這又與細胞的營養(yǎng)狀態(tài),藥物和環(huán)境污染物的作用,以及其它外界因素的影響密切相關。因此有人認為,“基因組學和蛋白質組學告訴你什么可能會發(fā)生,而代謝組學則告訴你什么確實發(fā)生了?!贝x組學的概念來源于代謝組,代謝組是指某一生物或細胞在一特定生理時期內所有的低分子量代謝產物,代謝組學則是對某一生物或細胞在一特定生理時期內所有低分子量代謝產物同時進行定性和定量分析的一門新學科。它是以組群指標分析為基礎,以高通量檢測和數(shù)據(jù)處理為手段,以信息建模與系統(tǒng)整合為目標的系統(tǒng)生物學的一個分支。代謝組學的研究方法與蛋白質組學的方法類似。貴州代謝組學
代謝組學是研究關于生物體被擾動后其代謝產物種類、數(shù)量及其變化規(guī)律的科學。武漢LC-MS/MS非靶向代謝組學費用
代謝組學的功能:代謝組學的功能,就有點類似GPS。代謝組學不做任何假設,針對樣本和參照物分別進行代謝物全譜檢測,幫你尋找出與差異代謝物,可能會有好幾十個甚至更多,從它們所在的被上調或下調的代謝通路上去找到關鍵的代謝酶,再找到它們上游的調控基因,再進行后續(xù)的深入研究,是不是可以避免走一些彎路?可以說代謝組學是一個相當有效率的研究工具。代謝組學在生物標志物的發(fā)現(xiàn),疾病早期診斷和預測,藥物或營養(yǎng)干預的評價,藥物毒性評價,代謝工程研究中均有應用,但代謝組學只是一個“檢測平臺”,它無法單獨開展機制性研究,但是如果合理的將代謝組學與分子生物學等學科協(xié)同使用,就可以起到事半功倍的作用。武漢LC-MS/MS非靶向代謝組學費用