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上海動物靶向代謝組學分析研究

來源: 發(fā)布時間:2021-12-22

代謝組學發(fā)展至今,代謝組學技術(shù)已經(jīng)遠遠超出了標準臨床化學技術(shù)的范圍,能夠精確分析數(shù)百至數(shù)千種代謝物。代謝組學提供了代謝表型的詳細表征,并可以在許多水平上進行精密醫(yī)學研究,包括表征疾病基礎(chǔ)的代謝紊亂,發(fā)現(xiàn)新的治靶標以及發(fā)現(xiàn)可用于診斷疾病或監(jiān)測藥物的活性。比較常見的代謝組學分析方法是質(zhì)譜(MS)核磁共振(NMR)光譜。質(zhì)譜技術(shù)又分為LC-MS和GC-MS。其基本原理是使試樣中各組分在離子源中發(fā)生電離,生成不同荷質(zhì)比的帶電荷的離子,經(jīng)加速電場的作用,形成離子束,進入質(zhì)量分析器。代謝組學的發(fā)展很迅速。上海動物靶向代謝組學分析研究

代謝組學發(fā)展前景:較低的費用,是促使代謝組學在臨床上易于接受的另一個原因。與其他“組學”研究相比,代謝組學的費用更低,研究人員可以通過代謝組學研究篩檢出代謝產(chǎn)物,然后采用更昂貴的基因組學和蛋白質(zhì)組學的方法對有意義的代謝產(chǎn)物進一步加以研究。首先,必須識別出代謝產(chǎn)物,這并不是簡單的工作。代謝組學研究比較大的挑戰(zhàn)就在于對代謝產(chǎn)物的識別,這也是比較有趣的方面,而更具挑戰(zhàn)性的工作,是進一步確認所有代謝物的功能。此外,質(zhì)譜分析發(fā)現(xiàn),代謝產(chǎn)物的同質(zhì)性不高,由于缺乏均勻性,使色譜分析變得更加困難,無法識別出樣品中的未知物質(zhì)。廣東動物靶向代謝組學質(zhì)譜鑒定與基因組學和蛋白質(zhì)組學相比,代謝組學與生理學的聯(lián)系更加緊密。

代謝組學比較常用到的數(shù)據(jù)分析方法:多變量分析:多變量分析方法能同時處理數(shù)百或數(shù)千個變量,并且能處理變量之間的相互關(guān)系。利用變量之間的協(xié)方差或相關(guān)性,使原始數(shù)據(jù)在較低維空間上的投影能盡可能地捕獲數(shù)據(jù)中的信息。但是如果存在大量無信息變量可能會妨礙多變量分析的能力,無信息變量的數(shù)量越多,減少真陽性數(shù)量的效果就越明顯。多變量分析分為無監(jiān)督分析方法和有監(jiān)督分析方法。在代謝組學分析中無監(jiān)督學習有主成分分析只需要數(shù)據(jù)集X,而有監(jiān)督分析方法主要是偏比較小二乘判別分析和正交偏比較小二乘判別分析,這類方法在分析時除了需要數(shù)據(jù)集X,還需對樣品進行指定并分組, 這樣分組后模型將自動加上另外一個隱含的數(shù)據(jù)集Y,通常Y的賦值用-1/1或者0/1表示類別信息。

代謝組學概念:基因與蛋白質(zhì)的表達緊密相連,而代謝物則更多地反映了細胞所處的環(huán)境,這又與細胞的營養(yǎng)狀態(tài),藥物和環(huán)境污染物的作用,以及其它外界因素的影響密切相關(guān)。因此有人認為,“基因組學和蛋白質(zhì)組學告訴你什么可能會發(fā)生,而代謝組學則告訴你什么確實發(fā)生了?!贝x組學的概念來源于代謝組,代謝組是指某一生物或細胞在一特定生理時期內(nèi)所有的低分子量代謝產(chǎn)物,代謝組學則是對某一生物或細胞在一特定生理時期內(nèi)所有低分子量代謝產(chǎn)物同時進行定性和定量分析的一門新學科。它是以組群指標分析為基礎(chǔ),以高通量檢測和數(shù)據(jù)處理為手段,以信息建模與系統(tǒng)整合為目標的系統(tǒng)生物學的一個分支。代謝組學著重研究的是生物整體、組織代謝途徑及其所受內(nèi)在或者外在因素的影響及隨時間變化的規(guī)律。

什么是代謝組學?代謝組學是用來解決什么問題的?代謝組學(Metabonomics/Metabolomics)是發(fā)展起來的一門新興學科,是研究關(guān)于生物體被擾動后(如基因的改變或環(huán)境變化后)其代謝產(chǎn)物(內(nèi)源性代謝物質(zhì))種類、數(shù)量及其變化規(guī)律的科學。代謝組學著重研究的是生物整體、組織的內(nèi)源性代謝物質(zhì)的代謝途徑及其所受內(nèi)在或者外在因素的影響及隨時間變化的規(guī)律。代謝組學通過揭示內(nèi)在和外在因素影響下代謝整體的變化軌跡來反映某種病理生理過程中所發(fā)生的一系列生物事件。代謝組學技術(shù)可應(yīng)用于疾病早期診斷。山東動物靶向代謝組學研究內(nèi)容

代謝組學主要技術(shù)手段是質(zhì)譜(MS)。上海動物靶向代謝組學分析研究

代謝組學是研究關(guān)于生物體被擾動后(如基因的改變或環(huán)境變化后)其代謝產(chǎn)物(內(nèi)源性代謝物質(zhì))種類、數(shù)量及其變化規(guī)律的科學。代謝組學著重研究的是生物整體、組織的內(nèi)源性代謝物質(zhì)的代謝途徑及其所受內(nèi)在或者外在因素的影響及隨時間變化的規(guī)律。代謝組學通過揭示內(nèi)在和外在因素影響下代謝整體的變化軌跡來反映某種病理生理過程中所發(fā)生的一系列生物事件。代謝組學在系統(tǒng)生物學的末端。以人體為例,對基因序列信息研究是基因組學的范疇。轉(zhuǎn)錄組學研究基因在外在或內(nèi)在環(huán)境刺激下不同的表達?;蛐畔⒎g成蛋白質(zhì)后,各種蛋白的形狀、功能、相互關(guān)系是蛋白組學的研究范疇。各種營養(yǎng)物質(zhì)經(jīng)過人體的消化、代謝后的代謝物,就是代謝組學的研究范圍。上海動物靶向代謝組學分析研究

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