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蛋白質(zhì)翻譯后修飾在蛋白質(zhì)中磷酸化位點(diǎn)分析時(shí)應(yīng)該注意些什么問(wèn)題?覆蓋率:覆蓋率越高,檢測(cè)和鑒定含有修飾基團(tuán)的肽幾率就越大。修飾位點(diǎn)的占有率:被修飾的蛋白質(zhì)的百分比低,則檢測(cè)到修飾肽的機(jī)會(huì)會(huì)隨之減少。如果百分比較高(> 30%),則有助于識(shí)別修飾位點(diǎn)。棕櫚?;鞍仔揎椯|(zhì)譜鑒定方法:S-棕櫚?;闹饕δ苁谴龠M(jìn)蛋白質(zhì)與細(xì)胞膜的結(jié)合。蛋白質(zhì)可以由一個(gè)棕櫚?;M成,也可以與更多棕櫚基或與其他脂質(zhì),如豆蔻?;?。由于對(duì)S-棕櫚酰化蛋白分析仍然具有挑戰(zhàn)性,由于S-棕櫚?;揎椀鞍讈喫揭约笆杷院蜐撛诓环€(wěn)定的硫代質(zhì)鏈的S-脂?;摹,F(xiàn)在常用的幾種方法可以捕獲S-脂?;鞍滓约皩?duì)目標(biāo)修飾蛋白進(jìn)行捕獲。目前對(duì)乙酰化修飾的功能研究主要集中在對(duì)細(xì)胞轉(zhuǎn)錄調(diào)控,以及對(duì)代謝通路的調(diào)控這兩個(gè)方面。貴陽(yáng)蛋白質(zhì)琥珀?;揎椊M學(xué)領(lǐng)域
翻譯后修飾蛋白的檢測(cè)方法:翻譯后修飾蛋白的檢測(cè)技術(shù)包括有免疫沉淀、western blot、質(zhì)譜技術(shù)、體外生化分析等。其中,免疫沉淀是大多數(shù)翻譯后修飾檢測(cè)中的關(guān)鍵步驟,它利用蛋白特異性抗體或某種翻譯后修飾的特異性抗體來(lái)富集目標(biāo)蛋白,之后再用western blot或質(zhì)譜技術(shù)分析目標(biāo)蛋白。Western blot和質(zhì)譜技術(shù)均可用于蛋白質(zhì)翻譯后修飾的下游檢測(cè),其中Western blot相對(duì)簡(jiǎn)單但依賴(lài)于特異性抗體且無(wú)法識(shí)別單個(gè)蛋白質(zhì)變化,質(zhì)譜則可以檢測(cè)包括未知PTM在內(nèi)的幾乎所有的PTMs但成本更高需要專(zhuān)業(yè)知識(shí)來(lái)分析產(chǎn)生的大量數(shù)據(jù)。研究人員可以根據(jù)成本、有無(wú)可用抗體,以及有沒(méi)有目標(biāo)等選擇合適的方法進(jìn)行檢測(cè)。四川蛋白質(zhì)翻譯后修飾組學(xué)費(fèi)用蛋白質(zhì)糖基化是一種常見(jiàn)的蛋白質(zhì)翻譯后修飾。
蛋白質(zhì)磷酸化修飾組學(xué):磷酸化蛋白質(zhì)是由蛋白激酶將ATP或GTP分子上的磷酸基團(tuán)轉(zhuǎn)移到底物蛋白特定的氨基酸側(cè)鏈上形成的。蛋白質(zhì)磷酸化是一種可逆的蛋白質(zhì)翻譯后修飾。在哺乳動(dòng)物的細(xì)胞生命周期中,至少有三分之一的蛋白質(zhì)發(fā)生磷酸化修飾。磷酸化修飾參與許多信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑和細(xì)胞代謝過(guò)程,且許多已知的疾病也與蛋白質(zhì)的異常磷酸化有關(guān)。因此,對(duì)磷酸化蛋白質(zhì)組進(jìn)行定量研究,尋找差異表達(dá)的磷酸化蛋白質(zhì),有助于發(fā)現(xiàn)疾病的生物標(biāo)志物和尋找新的具有診療潛力的藥物靶標(biāo)。
蛋白質(zhì)翻譯后修飾有什么生物學(xué)意義?可以使蛋白質(zhì)具有生物活性,可以發(fā)揮相應(yīng)的功能。翻譯是蛋白質(zhì)生物合成(基因表達(dá)中的一部分,基因表達(dá)還包括轉(zhuǎn)錄)過(guò)程中的第二步(轉(zhuǎn)錄為第1步),翻譯是根據(jù)遺傳密碼的中心法則,將成熟的信使RNA分子(由DNA通過(guò)轉(zhuǎn)錄而生成)中“堿基的排列順序”(核苷酸序列)解碼,并生成對(duì)應(yīng)的特定氨基酸序列的過(guò)程。但也有許多轉(zhuǎn)錄生成的RNA,如轉(zhuǎn)運(yùn)RNA(tRNA)、核糖體RNA(rRNA)和小核RNA(snRNA)等并不被翻譯為氨基酸序列。質(zhì)譜是蛋白質(zhì)翻譯后修飾檢測(cè)的常用技術(shù)之一。
蛋白質(zhì)學(xué)組翻譯后修飾自下而上分析策略:常用的糖蛋白分離和富集技術(shù)有:a. 凝集素親和技術(shù);b. 肼化學(xué)富集;c. 親水性相互作用色譜法;d. β-消除/邁克爾加成反應(yīng)?;谫|(zhì)譜的糖蛋白鑒定和糖基化位點(diǎn)測(cè)定方法有:a. PNGase F酶法;b. Endo H酶法;c. 三氟甲烷磺酸(TFMS)法。泛素化:泛素是一種由76個(gè)氨基酸組成的多肽,在真核生物中高度保守,可通過(guò)異肽鍵與目標(biāo)蛋白賴(lài)氨酸殘基的氨基進(jìn)行共價(jià)連接。泛素化蛋白的富集主要基于標(biāo)記,泛素用親和標(biāo)簽(通常為6xHis)進(jìn)行標(biāo)記,并通過(guò)鎳螯合色譜親和提取泛素化蛋白。由于泛素的C端為Arg-Gly-Gly結(jié)構(gòu),經(jīng)胰蛋白酶水解后,Gly-Gly保留在修飾蛋白的肽鏈上,使肽的質(zhì)量增加114,因此可作為泛素定位位點(diǎn)的質(zhì)量標(biāo)記。用HPLC對(duì)樣品進(jìn)行預(yù)分離,使用針對(duì)特定殘留結(jié)構(gòu)的抗體富集泛素化肽,可很大程度上提高泛素化蛋白的濃度。串聯(lián)質(zhì)譜可以鑒定泛素化位點(diǎn)。蛋白質(zhì)的翻譯后修飾調(diào)控著底物的酶活性、功能以及三級(jí)結(jié)構(gòu)的變化。南京蛋白質(zhì)丙?;揎椊M學(xué)價(jià)錢(qián)
乙酰化修飾對(duì)細(xì)胞核內(nèi)轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子的刺激有著非常重要的作用。貴陽(yáng)蛋白質(zhì)琥珀?;揎椊M學(xué)領(lǐng)域
翻譯后修飾蛋白組學(xué)分析:蛋白質(zhì)組學(xué)的研究的工作不只聚焦于細(xì)胞不同生長(zhǎng)時(shí)期或是疾病條件下的蛋白質(zhì)表達(dá)水平變化,許多至關(guān)重要的生命進(jìn)程不只由蛋白質(zhì)相對(duì)豐度控制,更重要的是被時(shí)空特異分布的、可逆的翻譯后修飾所調(diào)控,因而揭示翻譯后修飾發(fā)生規(guī)律是解析蛋白質(zhì)復(fù)雜多樣的生物功能的一個(gè)重要前提。蛋白質(zhì)發(fā)生翻譯后修飾時(shí)其分子質(zhì)量會(huì)發(fā)生響應(yīng)的改變,通過(guò)質(zhì)譜能夠精確測(cè)定蛋白質(zhì)或多肽的分子質(zhì)量。同時(shí),發(fā)生翻譯后修飾的蛋白質(zhì)再樣本中含量低且動(dòng)態(tài)范圍廣,所以在質(zhì)譜檢測(cè)前需要對(duì)發(fā)生修飾的蛋白質(zhì)或肽段進(jìn)行富集。貴陽(yáng)蛋白質(zhì)琥珀?;揎椊M學(xué)領(lǐng)域
上海拜譜生物科技有限公司屬于商務(wù)服務(wù)的高新企業(yè),技術(shù)力量雄厚。公司致力于為客戶(hù)提供安全、質(zhì)量有保證的良好產(chǎn)品及服務(wù),是一家有限責(zé)任公司(自然)企業(yè)。公司擁有專(zhuān)業(yè)的技術(shù)團(tuán)隊(duì),具有多組學(xué)服務(wù),質(zhì)譜檢測(cè),蛋白質(zhì)組學(xué),代謝組學(xué)等多項(xiàng)業(yè)務(wù)。拜譜生物將以真誠(chéng)的服務(wù)、創(chuàng)新的理念、***的產(chǎn)品,為彼此贏得全新的未來(lái)!