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武漢亞硝基化修飾蛋白質(zhì)組學分析

來源: 發(fā)布時間:2022-01-03

蛋白翻譯后修飾組學技術在準確醫(yī)學中的應用:盡管目前大數(shù)據(jù)的獲得會采用基因組學和轉(zhuǎn)錄組學,但是關鍵的發(fā)現(xiàn)還是依賴蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)而得到的。近來越來越多的研究表明蛋白組學驅(qū)動的準確的醫(yī)學具有極大的實用性和普適性,蛋白組學的研究更加速了臨床轉(zhuǎn)化的進程。蛋白翻譯后修飾(post-ranslational modification, PTM)賦予了蛋白種類的豐富性及蛋白功能的多樣化,研究蛋白翻譯后修飾不只可以確定蛋白修飾(磷酸化、泛素化、?;?、甲基化、SUMO化等)或蛋白酶裂解的新位點,還可以發(fā)現(xiàn)生物標記物及探索藥物/化學調(diào)節(jié)物的作用機制。各種蛋白質(zhì)翻譯后修飾在信號通路和網(wǎng)絡中發(fā)揮著重要的作用。武漢亞硝基化修飾蛋白質(zhì)組學分析

蛋白質(zhì)乙?;揎椂x:蛋白質(zhì)在細胞中經(jīng)過翻譯后,到被運輸?shù)较鄳募毎鞑⑶野l(fā)生特定的生物學作用前會經(jīng)過很重要的一步加工,那就是蛋白質(zhì)翻譯后修飾加工。蛋白質(zhì)翻譯后修飾的作用主要是改變蛋白質(zhì)的活性、定位或功能。通過蛋白質(zhì)翻譯后修飾也進一步增加了細胞通路機制和生命活動的多樣性和復雜性。常見的蛋白質(zhì)翻譯后修飾包括磷酸化,乙?;?,糖基化,泛素化等。蛋白質(zhì)乙?;揎?,顧名思義指的就是在蛋白質(zhì)原有基礎上面嫁接上乙?;鶊F。在細胞中,乙?;揎椀姆磻梢阴;D(zhuǎn)移酶所催化,將乙酰輔酶A的乙?;D(zhuǎn)移并添加在蛋白質(zhì)賴氨酸殘基上。在早期的研究中,乙?;揎椧恢北徽J為是真核細胞所特有的一種翻譯后修飾,直到后來研究發(fā)現(xiàn)原核細胞中年也存在著蛋白質(zhì)乙酰化修飾。所以,乙?;揎検窃撕驼婧松锼灿械囊环N翻譯后修飾類型。山東丙二酰化修飾蛋白質(zhì)組學分析方法蛋白質(zhì)磷酸化修飾的免疫印跡技術優(yōu)點:能夠特異鑒定單個磷酸化位點。

蛋白質(zhì)乙?;揎椊M學技術:乙酰化修飾是體內(nèi)高度保守的可逆轉(zhuǎn)的蛋白修飾,對細胞核內(nèi)轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子的刺激有著非常重要的作用。此外,還存在大量的非組蛋白乙?;揎梾⑴c了代謝通路及代謝酶活性的調(diào)節(jié)。乙?;揎椊M學技術服務采用肽段預分離降低高豐度組蛋白對蛋白乙?;b定的影響,再結(jié)合免疫共沉淀通過高效的抗體富集乙酰化的肽段,從而實現(xiàn)大規(guī)模乙酰化的鑒定及定量。蛋白質(zhì)泛素化修飾組學技術:泛素化修飾是一種重要的翻譯后修飾。泛素-蛋白酶體系統(tǒng)介導了真核生物體內(nèi)80%~85%的蛋白質(zhì)降解。此外,泛素化修飾還可以直接影響蛋白質(zhì)的活性和定位,調(diào)控包括細胞周期、細胞凋亡、轉(zhuǎn)錄調(diào)控、DNA 損傷修復以及免疫應答等在內(nèi)的多種細胞活動。

蛋白質(zhì)磷酸化修飾定義?在哺乳動物細胞生命周期中,大約有1/3的蛋白質(zhì)發(fā)生過磷酸化修飾,在脊椎動物基因中,約有5%的基因編碼的蛋白質(zhì)是參與磷酸化和去磷酸化過程的蛋白激酶和磷酸酶。它可以通過激發(fā)、調(diào)節(jié)諸多信號通路進而參與調(diào)控生物體的生長、發(fā)育、逆境應激、疾病發(fā)生等多種生命過程,一直是生物學研究的重點與熱點。蛋白磷酸化是指在激酶催化作用下把ATP或者GTP的磷酸基團(P04)轉(zhuǎn)移到不同種類的氨基酸上(主要包括絲氨酸S、蘇氨酸T、酪氨酸Y),從而使蛋白質(zhì)發(fā)生翻譯后修飾的過程。蛋白質(zhì)翻譯后修飾組學磷酸化修飾具有靈活的特性。

蛋白質(zhì)學組翻譯后修飾分析:組蛋白是一類高度保守的蛋白質(zhì),是染色質(zhì)的關鍵成分,是DNA包裝的結(jié)構(gòu)單位。組蛋白的功能受其翻譯后修飾介導。組蛋白翻譯后修飾包括通過絲氨酸或蘇氨酸殘基的磷酸化,賴氨酸或精氨酸的甲基化,賴氨酸的乙?;兔撘阴;嚢彼岬姆核鼗突酋;葘M蛋白進行的共價修飾。組蛋白這些修飾對于核完整性至關重要,因為它們可以調(diào)節(jié)染色質(zhì)結(jié)構(gòu)并募集參與基因調(diào)節(jié)、DNA修復和染色體濃縮的酶。組蛋白的翻譯后修飾大多位于N末端的尾巴上,因為N末端是蛋白質(zhì)中比較暴露和比較靈活的區(qū)域。分析組蛋白翻譯后修飾有助于探索組蛋白修飾與染色體濃縮、DNA轉(zhuǎn)錄等生物功能之間的關系。蛋白質(zhì)翻譯后修飾組學磷酸化修飾具有簡單的特性。武漢亞硝基化修飾蛋白質(zhì)組學分析

蛋白質(zhì)磷酸化修飾怎么定義?武漢亞硝基化修飾蛋白質(zhì)組學分析

蛋白質(zhì)學組翻譯后修飾的類型:翻譯后修飾的類型包括N端fMet或Met的去除、二硫鍵的形成、化學修飾和肽鍵的裂解,其中磷酸化是比較常見的。蛋白質(zhì)的化學修飾反應是在維持蛋白質(zhì)的完整性和功能性的基礎上,通過基于其氨基酸殘基的化學反應獲得新的生物結(jié)合物。翻譯后修飾在哪里發(fā)生?翻譯后修飾主要發(fā)生在氨基酸側(cè)鏈或蛋白質(zhì)的C端或N端?,F(xiàn)有的官能團或新官能團的引入可被用于修飾蛋白質(zhì),以擴展20個標準氨基酸的化學組成。翻譯后修飾的位點通常帶有可以在化學反應中充當親核試劑的官能團,如絲氨酸、蘇氨酸和酪氨酸的羥基;賴氨酸、精氨酸和組氨酸胺形式;同時,在蛋白質(zhì)的N端和C端,天冬酰胺也可作為翻譯后修飾中的一種聚糖連接點。翻譯后修飾也發(fā)生在氧化的蛋氨酸和側(cè)鏈位點的一些亞甲基上。武漢亞硝基化修飾蛋白質(zhì)組學分析

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