靶向代謝組學(xué)的一般分析流程為:1. 數(shù)據(jù)采集 第1步是得到標(biāo)準(zhǔn)品。如果無(wú)法從市場(chǎng)上買(mǎi)到,就必須定制合成。然后通過(guò)優(yōu)化產(chǎn)物離子碰撞能量以得到的信號(hào),再通過(guò)測(cè)定三重串聯(lián)四極桿測(cè)定代謝物的 MRM 躍遷值。2. 定量 接下來(lái)用定量分析軟件對(duì) MRM 數(shù)據(jù)進(jìn)行處理,得到報(bào)告。3. 統(tǒng)計(jì)分析和解釋 將定量報(bào)告輸入統(tǒng)計(jì)分析軟件包,用統(tǒng)計(jì)工具,如ANOVA,對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行處理。靶向分析:在基于質(zhì)譜的代謝組學(xué)分析中,要意識(shí)到離子強(qiáng)度和色譜保留時(shí)間都會(huì)隨著時(shí)間的推移而產(chǎn)生漂移,所以在實(shí)驗(yàn)中,要按隨機(jī)順序?qū)颖具M(jìn)行檢測(cè),且數(shù)據(jù)需要在同天同一批次進(jìn)行采集,以減少誤差。代謝組學(xué)的研究方法與蛋白質(zhì)組學(xué)的方法類似。廣州非靶向代謝組學(xué)分析價(jià)格
代謝組學(xué)細(xì)胞樣本收集:懸浮細(xì)胞:1)連同培養(yǎng)基轉(zhuǎn)移到1.5 mL的進(jìn)口離心管中。2)低速離心5 min(低于3000 rpm),使細(xì)胞沉淀于離心管的底部(1*107個(gè)細(xì)胞為宜)。3)倒掉培養(yǎng)基(盡量倒干凈),用預(yù)冷的PBS反復(fù)沖洗2 ~ 3次,低速離心5 min,棄上清。4)標(biāo)記離心管,將離心管的尖的一端插入液氮中,淬滅細(xì)胞沉淀1 min,-80 ℃凍存,干冰寄送。注意事項(xiàng):1. 培養(yǎng)基傾倒時(shí)盡量倒干凈,可使用濾紙將殘留培養(yǎng)液吸凈;2. 甲醇/水請(qǐng)使用色譜純及以上規(guī)格;3. 液氮淬滅細(xì)胞時(shí),請(qǐng)小心避免離心管破碎導(dǎo)致樣本受損;4. 建議細(xì)胞樣本在進(jìn)行培養(yǎng)時(shí)多準(zhǔn)備樣本,以備后續(xù)使用。貴陽(yáng)個(gè)性化定制靶向代謝組學(xué)檢測(cè)價(jià)格代謝組學(xué)先進(jìn)分析檢測(cè)技術(shù)結(jié)合模式識(shí)別和**系統(tǒng)等計(jì)算分析方法是代謝組學(xué)研究的基本方法。
代謝組學(xué)在系統(tǒng)生物學(xué)中有什么作用?它的地位如何?代謝物作為生物體表型的基礎(chǔ)能夠幫助我們更直觀有效地了解生命現(xiàn)象揭示生命本質(zhì)。代謝組學(xué)本質(zhì)上是指從整體上研究生物體的代謝物,是對(duì)某一生物、組織或細(xì)胞中的所有低分子量代謝產(chǎn)物進(jìn)行定性與定量分析的一門(mén)科學(xué)。代謝組學(xué)以指標(biāo)分析為基礎(chǔ),高通量檢測(cè)為手段,通過(guò)研究生物體內(nèi)代謝物的種類與數(shù)量及其變化規(guī)律來(lái)闡述機(jī)體在正常生命狀態(tài)及環(huán)境變化后的代謝過(guò)程。代謝組是系統(tǒng)生物學(xué)的分支學(xué)科之一。其研究?jī)?nèi)容主要包括對(duì)代謝物進(jìn)行定性或定量分析,不同基因型的生物體進(jìn)行代謝組學(xué)表型研究,不同生長(zhǎng)環(huán)境及加物理、化學(xué)或生物性刺激后個(gè)體代謝產(chǎn)物的應(yīng)答,進(jìn)行代謝途徑或代謝網(wǎng)絡(luò)解析與轉(zhuǎn)基因評(píng)價(jià)。
代謝組學(xué)樣品收集方法及所需樣本量是什么?根據(jù)不同的檢測(cè)要求,需要配合不同的樣本量和樣本采集方法,常規(guī)的方法和單個(gè)樣本量如下:(1) 微生物和細(xì)胞樣本:細(xì)胞迅速猝滅細(xì)胞并冷凍保存;單個(gè)樣本細(xì)胞數(shù)量要求10^6。(2) 動(dòng)物體液(如尿、血、組織、唾液):采樣后要迅速預(yù)處理,如加入抗凝血?jiǎng)?、防腐劑,并立即冷凍處理?80 ℃);單個(gè)樣本要求體積為10μL。(3) 植物樣本:采集后迅速冷凍(液氮),然后轉(zhuǎn)入-80℃保存,單個(gè)樣本要求質(zhì)量為50mg。代謝組學(xué)作為系統(tǒng)生物學(xué)的重要組成部分,在臨床醫(yī)學(xué)領(lǐng)域具有普遍的應(yīng)用前景。
代謝組學(xué)有哪些應(yīng)用?近年來(lái),代謝組學(xué)技術(shù)得到了迅速發(fā)展,主要可應(yīng)用于:功能基因組學(xué)、疾病早期診斷、病因病機(jī)研究、藥物毒理學(xué)、中醫(yī)藥現(xiàn)代化、植物代謝組學(xué)、微生物代謝組學(xué)、營(yíng)養(yǎng)學(xué)、環(huán)境科學(xué)等生命科學(xué)的各個(gè)領(lǐng)域。為什么要選擇代謝組學(xué)?首先需要明確的是代謝組學(xué)的目標(biāo)分析物主要為生物小分子及其代謝產(chǎn)物,如糖、有機(jī)酸、脂質(zhì)、維生素、氨基酸、芳香烴之類等化合物。所以,如果關(guān)注的是小分子物質(zhì),那么采用代謝組學(xué)的方法,可以對(duì)樣品內(nèi)檢測(cè)到的小分子物質(zhì)進(jìn)行定性、定量分析。同于基因組學(xué)和蛋白組學(xué),代謝組學(xué)的研究反映某一時(shí)刻下正在發(fā)生的生命活動(dòng)情況,研究代謝物的表達(dá)量、代謝物與生理病理變化的關(guān)系,能夠幫助尋找新的生物標(biāo)記物,發(fā)現(xiàn)新的代謝途徑,以及更進(jìn)一步深入了解目前已知的這些途徑,應(yīng)用于疾病的早期診斷、藥物靶點(diǎn)的發(fā)現(xiàn)、疾病的病理生理研究。靶向代謝組學(xué)(Trgeted metabolomics)則為目標(biāo)性代謝組學(xué)。上海個(gè)性化定制靶向代謝組學(xué)領(lǐng)域
代謝組學(xué)技術(shù)可應(yīng)用于疾病早期診斷。廣州非靶向代謝組學(xué)分析價(jià)格
代謝組學(xué)尿液樣本收集:1)取空腹晨尿、中段尿(臨床)或晨間1 h尿(動(dòng)物)于50 mL離心管中;2)4 ℃ 下10000 rpm離心10 min取上清,用1.5 mL離心管分裝,保存于-80 ℃。3)動(dòng)物1 h尿量不夠的情況下,可分多次收集尿液;如需收取24 h尿液,需要使用帶低溫裝置的代謝籠收集,并且及時(shí)凍存樣本。4)收集完尿液樣本后,建議使用液氮淬滅15 min后,再分裝多管后于-80 ℃凍存。組織樣本收集:動(dòng)物組織(包括腦、心、肝、脾、肺、腎、肌肉和皮膚等;軟體動(dòng)物如血吸蟲(chóng)):1)取適量組織,用預(yù)冷的PBS緩沖液或生理鹽水清洗干凈;2)迅速剝?nèi)シ潜匦璧闹竞徒Y(jié)締組織,再用PBS緩沖液或生理鹽水沖洗干凈;3)用干凈的無(wú)塵吸水紙吸干水分,將組織分成50-100 mg / 管分裝待用;4)管子上做好標(biāo)記后迅速放入液氮中冷凍處理至少15 min,-80 ℃凍存;干冰運(yùn)輸。廣州非靶向代謝組學(xué)分析價(jià)格
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