定量蛋白質組學方法學介紹:iTRAQ:iTRAQ定量是目前定量蛋白質組學應用比較普遍的技術,該技術的關鍵原理是多肽標記和定量,將多肽的含量轉化為114、115、116和117同位素的含量(或113、114、115、116、117、118、119和121的8標記),從而簡化了定量的復雜性,然后通過多肽定量值回歸到蛋白的定量值,從而測定出不同樣本之間蛋白質的差異。iTRAQ定量不依賴樣本,可檢測出較低豐度蛋白,胞漿蛋白、膜蛋白、胞外蛋白等,且定量準確,可同時對8個樣本進行分析,并可同時得出鑒定和定量的結果,特別適用于采用多種處理方式或來自多個處理時間的樣本的差異蛋白分析。蛋白質組研究技術涉及到各種重要的生物學現(xiàn)象,如信號轉導、細胞分化、蛋白質折疊等等。四川DIA定量蛋白質組學鑒定
定量蛋白質組學方法學介紹:Label-free:Label-free定量,即非標記的定量蛋白質組學,不需要對比較樣本做特定標記處理,只需要比較特定肽段/蛋白在不同樣品間的色譜質譜響應信號便可得到樣品間蛋白表達量的變化,通常用于分析大規(guī)模蛋白鑒定和定量時所產生的質譜數(shù)據(jù)。Label-free定量不需要標記處理,操作簡單,可以做任意樣本的總蛋白質差異定量,但對實驗操作的穩(wěn)定性、重復性要求較高,準確性也較標記定量差。因此,Label-free技術適合于大樣本量的定量比較,以及對無法用標記定量實現(xiàn)的實驗設計。南京修飾蛋白組學技術服務蛋白質組與基因組相對應,也是一個整體的概念。
蛋白組學技術:蛋白質組學研究的首要任務是建立獲取和分析蛋白質的常規(guī)、可靠、有效的技術。為達到這一要求,就需要樣品準備、數(shù)據(jù)獲取標準化及自動化,也就是要有可重復的高通量的技術。蛋白質組學技術手段在不斷完善,其工作流程,包括蛋白質樣本的制備、分離、定量及鑒定。由雙向凝膠電泳、質譜技術、酵母雙雜交系統(tǒng)、蛋白質微陣列技術、能進行大規(guī)模數(shù)據(jù)處理的計算機系統(tǒng)和軟件、軟電離技術及生物信息學技術構成了蛋白質組學研究的主要技術體系。其中蛋白質組學技術中的質譜技術是現(xiàn)在比較常用的一種蛋白質鑒定技術。
蛋白質組學在生物學領域的研究中的應用是怎樣的?研究對象涉及到生物體且生物體內表達蛋白,理論上都可以應用蛋白質組學。蛋白質組學是以研究生物體蛋白組成及其變化規(guī)律為目的的應用科學。主要使用的儀器為液質聯(lián)用高分辨率質譜儀。詳細來說,蛋白質組學包含許多分支:非標定量蛋白質組學(定性研究生物體的蛋白組成),定量蛋白質組學(對生物體蛋白表達含量進行測定),修飾蛋白質組學(對蛋白質翻譯后修飾進行檢測)及相互作用蛋白質組研究(蛋白質直接相互作用機制解析)等。蛋白質組學屬于后基因組時代的科學研究,針對基因表達產物進行檢測與定量。因此更能反應出生物體生理條件下的水平與狀態(tài)。蛋白質組學在應用中,更多地用于提供高通量蛋白質定性定量信息。
定量蛋白質組學技術:定量蛋白質組學是蛋白質組研究的重要內容,通過對基因表達產物——蛋白質的定量分析,以了解基因在不同的生理、病理和逆境條件下的表達情況。近年來,隨著非凝膠技術的發(fā)展,蛋白質組學(“Shotgun”proteomics)技術,特別是多維蛋白質鑒定(MultidimensionalProteinIdentification,MudPIT)已成為研究復雜生物樣本中大規(guī)模蛋白質表達和定性和定量分析的強有力工具。蛋白質組學在醫(yī)學的研究應用:蛋白質組學是研究細胞、組織或生物體中蛋白質組成、定位、變化及其相互作用規(guī)律的科學。蛋白質組的研究能為生命活動規(guī)律提供物質基礎。深圳蛋白質定量組學方法
蛋白質組學技術有生物質譜。四川DIA定量蛋白質組學鑒定
蛋白質組學概念:蛋白質組學(英語:proteomics,又譯作蛋白質體學),是以蛋白質組為研究對象,研究細胞、組織或生物體蛋白質組成及其變化規(guī)律的科學。蛋白質組(Proteome)一詞,源于蛋白質(protein)與基因組(genome)兩個詞的組合,意指“一種基因組所表達的全套蛋白質”,即包括一種細胞乃至一種生物所表達的全部蛋白質。蛋白質組學本質上指的是在大規(guī)模水平上研究蛋白質的特征,包括蛋白質的表達水平,翻譯后的修飾,蛋白與蛋白相互作用等,由此獲得蛋白質水平上的關于疾病發(fā)生,細胞代謝等過程的整體而全方面的認識。四川DIA定量蛋白質組學鑒定
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