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上海SmalIRNA轉(zhuǎn)錄組學(xué)技術(shù)服務(wù)

來源: 發(fā)布時(shí)間:2022-01-23

轉(zhuǎn)錄組學(xué)應(yīng)用于胃腸瘤轉(zhuǎn)移機(jī)制研究:circRNA是一種非編碼RNA,可以多種方式參與生物學(xué)功能,如細(xì)胞增殖、細(xì)胞周期、侵襲和轉(zhuǎn)移等。近年來研究發(fā)現(xiàn),環(huán)狀RNA可以通過海綿吸附微小RNA和RNA結(jié)合蛋白參與轉(zhuǎn)錄后調(diào)控,從而影響瘤耐藥過程中的DNA修復(fù)、凋亡、增殖、細(xì)胞轉(zhuǎn)運(yùn),以及介導(dǎo)瘤耐藥的細(xì)胞內(nèi)酶,進(jìn)而在瘤耐藥中發(fā)揮重要調(diào)節(jié)作用。有研究證實(shí)通過干擾環(huán)狀RNA的表達(dá),可以提高瘤對藥物的敏感性,提示環(huán)狀RNA可能為抗瘤藥物耐藥性的研究提供新的靶點(diǎn)。轉(zhuǎn)錄組學(xué)可應(yīng)用于植物生長機(jī)制的發(fā)現(xiàn)及干預(yù)。上海SmalIRNA轉(zhuǎn)錄組學(xué)技術(shù)服務(wù)

全轉(zhuǎn)錄組測序:狹義的轉(zhuǎn)錄組默認(rèn)只包含mRNA,但是廣義的轉(zhuǎn)錄組指的是細(xì)胞或組織中所有轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物的匯合,其中包含mRNA和非編碼RNA(non-codingRNA,ncRNA)。非編碼RNA目前的研究多集中在具有調(diào)控功能的smallRNA(以miRNA為表示),長鏈非編碼RNA(longnon-codingRNA,lncRNA)和環(huán)狀RNA(circularRNA,circRNA)上,而這幾類ncRNA的調(diào)控對象都和mRNA有關(guān)。因此,全轉(zhuǎn)錄組即包含了ncRNAs和mRNA。全轉(zhuǎn)錄組測序即對以上四種ncRNA進(jìn)行測序,并分析這四者之間復(fù)雜的相互作用關(guān)系。上海SmalIRNA轉(zhuǎn)錄組學(xué)技術(shù)服務(wù)轉(zhuǎn)錄學(xué)組測序是目前深入研究轉(zhuǎn)錄組復(fù)雜性的強(qiáng)大工具。

單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組學(xué)測試步驟:第1步就是把單個(gè)細(xì)胞分選出來。分選的方式也比較多,物理切割,酶消化,F(xiàn)ACS分選等。假如已經(jīng)分到了一個(gè)單細(xì)胞,跟常規(guī)的轉(zhuǎn)錄組步驟上是一樣的。下一步就是把單細(xì)胞里的RNA提取出來去建庫測序。但是一個(gè)細(xì)胞里的RNA含量是比較少的,難建庫成功。這個(gè)里面“量”的概念很有意思。比如說單細(xì)胞量少,需要特殊處理。因?yàn)閱渭?xì)胞里面RNA的量少,所以說整個(gè)富集的過程中會(huì)出現(xiàn)一部分基因在一個(gè)細(xì)胞里能檢測到,在另外一個(gè)細(xì)胞里面檢測不到,而每個(gè)細(xì)胞里面的檢測存在一個(gè)隨機(jī)性,同時(shí)單細(xì)胞測序深度比較低,所以說分析時(shí)相比于普通轉(zhuǎn)錄組有一些是需要特別注意,但整體的分析思路是類似的。

circRNA轉(zhuǎn)錄組學(xué):是一類具有閉合環(huán)狀結(jié)構(gòu)的非編碼RNA分子,沒有5′帽子結(jié)構(gòu)和3′poly(A)結(jié)構(gòu),主要位于細(xì)胞質(zhì)或儲(chǔ)存于外泌體中,不受RNA外切酶影響,表達(dá)更穩(wěn)定且不易降解,已被證明普遍存在于多種真核生物體內(nèi)[1]。大多數(shù)circRNA是由外顯子環(huán)化而成,也有部分circRNA是由內(nèi)含子環(huán)化而成的套索結(jié)構(gòu)。同時(shí)由于circRNA含有大量的miRNA應(yīng)答原件(MREs),能與AGO蛋白形成RNA誘導(dǎo)沉默復(fù)合體(RISC)的催化關(guān)鍵,然后導(dǎo)致circRNA降解。根據(jù)來源,circRNA可大致分為四類:全外顯子型的circRNA,內(nèi)含子和外顯子組合的EIcircRNA,內(nèi)含子組成的套索型ciRNA,由病毒RNA基因組、tRNA、rRNA、snRNA等環(huán)化產(chǎn)生的circRNA。轉(zhuǎn)錄組具有組織特異性的特點(diǎn)。

轉(zhuǎn)錄組學(xué)為什么原核物種只能做有參轉(zhuǎn)錄組分析?由于原核生物的基因組中存在大量基因重疊區(qū)域、操縱子及多順反子,如果按照無參轉(zhuǎn)錄組分析策略進(jìn)行組裝的話,難度較大,組裝結(jié)果存在較大風(fēng)險(xiǎn)。轉(zhuǎn)錄組學(xué)差異基因數(shù)目多少比較合理?不同的處理,不同的研究目標(biāo),差異基因的數(shù)目是不同的,從幾十個(gè)到幾千個(gè)都有可能。但是如果差異基因數(shù)目是個(gè)位數(shù)或者上萬,那么就需要和分析人員溝通一下,查一查是否有問題。轉(zhuǎn)錄組學(xué)差異基因太多,注釋信息太雜亂,怎么挑選目標(biāo)基因?對不同的差異組合進(jìn)行維恩圖分析,挑選共有或者特有的差異基因作為后續(xù)的研究對象;根據(jù)前人的文獻(xiàn)報(bào)道,挑選相關(guān)差異基因,不要局限在自己研究的物種上。RNA-Seq轉(zhuǎn)錄組學(xué)有著巨大的應(yīng)用前景。RNA轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析研究

轉(zhuǎn)錄組學(xué)可應(yīng)用于炎癥發(fā)生機(jī)制的發(fā)現(xiàn)及干預(yù)。上海SmalIRNA轉(zhuǎn)錄組學(xué)技術(shù)服務(wù)

以會(huì)展平臺(tái)聚合行業(yè)優(yōu)異人才,實(shí)現(xiàn)服務(wù)資源的對接融合,規(guī)范商務(wù)服務(wù)市場,統(tǒng)一社會(huì)對商務(wù)服務(wù)行業(yè)的認(rèn)知,沖破現(xiàn)有行業(yè)邊界,重新定義商務(wù)服務(wù)行業(yè)格局。文化賦予了銷售獨(dú)特的生命力和吸引力,從精神層面讓用戶產(chǎn)生深度的關(guān)聯(lián)。中華文明傳承五千年,很多文化自古有之,備受文人墨客的青睞。千百年后的人群依舊能因?yàn)橐皇自?,穿越到彼時(shí),這就是文化的力量催生了人類“共情”的能力。服務(wù)型結(jié)合當(dāng)?shù)匚幕瘍?nèi)涵,設(shè)計(jì)出別致的用戶體驗(yàn)。如此一來,既能支持非文化事業(yè)的可持續(xù)發(fā)展及傳承,又能讓每一位購買文創(chuàng)禮物的用戶都擁有一份不可替代的專屬回憶。經(jīng)濟(jì)文化不僅在商業(yè)形式和場景上下功夫,隨著不斷的完善還要注重對本土文化資源IP的“夜態(tài)”融合開發(fā),這無疑有提高了有限責(zé)任公司(自然)轉(zhuǎn)型效率。上海SmalIRNA轉(zhuǎn)錄組學(xué)技術(shù)服務(wù)

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