使用CRISPR/Cas9、ZFNs和TALENs等設(shè)計(jì)核酸酶進(jìn)行基因組編輯,可以將遺傳物質(zhì)定向?qū)氩溉閯?dòng)物基因組的特定位點(diǎn)。然而,可能會(huì)出現(xiàn)非預(yù)期的靶上和靶外基因組修飾,這可能導(dǎo)致基因組不穩(wěn)定,并破壞正常基因的功能,從而可能導(dǎo)致臨床前和臨床研究中的安全問(wèn)題?;蚓庉嬆壳暗拿摪蟹治黾夹g(shù)主要依賴于生物信息學(xué)預(yù)測(cè)和全基因組脫靶檢測(cè)技術(shù)。這些預(yù)測(cè)缺乏可靠性,因?yàn)樗鼈冎缓w了潛在基因組改變的一小部分。而頻率低于0.5%的脫靶突變大多無(wú)法被全基因組脫靶檢測(cè)技術(shù)檢測(cè)到。我們是開(kāi)發(fā)用于全基因組靶向/非靶向分析的無(wú)偏分析的先驅(qū)。靶向基因組編輯唯可生物為基因編輯安全性評(píng)估提供多方面的PCR和基于NGS的分析。我們的多功能且經(jīng)濟(jì)高效的檢測(cè)方法可檢測(cè)靶向和非靶向基因組改變。我們先進(jìn)的分析技術(shù)與強(qiáng)大的內(nèi)部生物信息學(xué)體系相結(jié)合,可靠地量化了預(yù)期的靶向整合與非預(yù)期結(jié)果(如易位和INDEL)之間的比率?;蚓庉嫾夹g(shù)脫靶檢測(cè),推薦唯可生物,實(shí)驗(yàn)實(shí)力強(qiáng),專業(yè)性高,檢測(cè)效率高,結(jié)果準(zhǔn)確率高。上海脫靶檢測(cè)
GUIDE-Seq脫靶評(píng)估技術(shù)的優(yōu)勢(shì)分析鼓潤(rùn)致力于基因組編輯工具脫靶的分析檢測(cè)工作,為篩選、優(yōu)化基因組編輯工具的保真性提供標(biāo)準(zhǔn)化的分析。我們脫靶分析具有如下優(yōu)勢(shì):實(shí)用性強(qiáng):能反映CRISPR在真核細(xì)胞中進(jìn)行基因編輯的在靶與脫靶情況,以進(jìn)行安全性和有效性評(píng)價(jià);檢測(cè)通量高:一次能檢測(cè)多個(gè)樣本的在靶與脫靶情況,并通過(guò)優(yōu)化的標(biāo)簽設(shè)計(jì),降低實(shí)際的測(cè)序reads數(shù)量;準(zhǔn)確性高:絕大部分檢測(cè)結(jié)果可被驗(yàn)證;靈敏度高:能夠高效檢測(cè)出低頻脫靶位點(diǎn),檢測(cè)低至0.1%的脫靶突變;實(shí)驗(yàn)難度低:操作過(guò)程簡(jiǎn)單易行細(xì)胞適應(yīng)性強(qiáng)。南京基因療法脫靶檢測(cè)評(píng)估標(biāo)準(zhǔn)種子基因脫靶檢測(cè),推薦唯可生物,實(shí)驗(yàn)實(shí)力強(qiáng),專業(yè)性高,檢測(cè)效率高,結(jié)果準(zhǔn)確率高。
通常不需要進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)的遺傳毒性組合試驗(yàn),但應(yīng)根據(jù)基因zhiliao產(chǎn)品的特點(diǎn)、產(chǎn)品的具體適應(yīng)癥、載體的已有信息、導(dǎo)入基因序列結(jié)構(gòu)等,評(píng)估基因zhiliao產(chǎn)品整合進(jìn)基因組的可能性,判斷是否需要開(kāi)展另外的遺傳毒性研究,如研究基因組修飾的發(fā)生情況,并檢測(cè)隨后可能發(fā)生的異常細(xì)胞行為;評(píng)估插入突變(插入位點(diǎn)、插入拷貝數(shù)等)引起的遺傳毒性風(fēng)險(xiǎn)。當(dāng)基因zhiliao產(chǎn)品采用基因編輯或轉(zhuǎn)座子技術(shù)時(shí),需要關(guān)注脫靶編輯、轉(zhuǎn)座子轉(zhuǎn)座印跡引起的遺傳毒性問(wèn)題;鑒定/表征基因組整合位點(diǎn)。
自基因zhiliao出現(xiàn)之日起,安全性問(wèn)題就隨之產(chǎn)生了,并成為阻礙基因zhiliao研發(fā)的一大障礙,吳寧博士認(rèn)為:“基因zhiliao產(chǎn)品的研發(fā)和上市,安全性會(huì)將是一個(gè)非常重要考量。如果一款產(chǎn)品它安全性有問(wèn)題的話,在市場(chǎng)化道路上就會(huì)受到很大影響。尤其是基因zhiliao,目前處于起始階段,一旦出現(xiàn)不良事件,很有可能對(duì)整個(gè)行業(yè)都會(huì)產(chǎn)生致命打擊。具體說(shuō)來(lái),基因zhiliao的安全性問(wèn)題主要涉及基因插入突變、脫靶、生物分布和持久性、潛伏再jihuo以及潛在免疫原性等?!备呔让摪袡z測(cè),推薦唯可生物,實(shí)驗(yàn)實(shí)力強(qiáng),專業(yè)性高,檢測(cè)效率高,結(jié)果準(zhǔn)確率高。
目前鼓潤(rùn)已掌握了該項(xiàng)技術(shù),簡(jiǎn)述如下:1、CRISPR與dsODNtag整合的實(shí)驗(yàn)技術(shù)及高通量測(cè)序建庫(kù)流程將靶向于目標(biāo)基因組位點(diǎn)的CRISPR質(zhì)粒與dsODNtag以核電轉(zhuǎn)的方式同時(shí)轉(zhuǎn)染入真核細(xì)胞,CRISPR造成基因組雙鏈斷裂后,dsODNtag將整合入斷點(diǎn)處,作為后續(xù)分析在靶與脫靶情況的標(biāo)記。轉(zhuǎn)染后3天收集細(xì)胞的DNA進(jìn)行高通量建庫(kù)。2、GUIDE-seq生信分析方法1)搭建了高通量測(cè)序的數(shù)據(jù)分析流程。2)利用該技術(shù)分析了CRISPR靶向編輯某細(xì)胞系基因的在靶與脫靶情況。其中一例樣品的分析結(jié)果如圖4所示:Sequencesofoff-targetsitesidentifiedbyGUIDE-seq.Theintendedtargetsequenceisshowninthetoplinewithcleavedsitesshownunderneathandwithmismatchestotheon-targetsiteshownandhighlightedincolor.GUIDE-seqsequencingreadcountsareshowntotherightofeachsite.3)利用PCR擴(kuò)增技術(shù)聯(lián)合Sanger測(cè)序鑒定了分析出的脫靶位點(diǎn)。定量脫靶檢測(cè),推薦唯可生物,實(shí)驗(yàn)實(shí)力強(qiáng),專業(yè)性高,檢測(cè)效率高,結(jié)果準(zhǔn)確率高。crispr/cas9脫靶檢測(cè)服務(wù)
基因編輯治療過(guò)程中安全性評(píng)價(jià),即脫靶效應(yīng)的檢測(cè)。上海脫靶檢測(cè)
gRNA的長(zhǎng)度和錯(cuò)配: 17個(gè)核苷酸長(zhǎng)度的gRNA顯示出更高的基因組編輯效率。相比之下,18-20 bp的長(zhǎng)度顯示出較低的基因組編輯效率。在人類細(xì)胞中減少潛在脫靶效應(yīng)的指導(dǎo)方針:1) 應(yīng)避免在PAM的7-10 bp范圍內(nèi)靶序列有超過(guò)3個(gè)錯(cuò)配;2) 在PAM的12 bp內(nèi),應(yīng)避免sgRNA 凸起以減少脫靶效應(yīng)。gRNA的化學(xué)修飾:在gRNA核糖磷酸骨架中加入2?-O-甲基-3?-膦酰基乙酸酯會(huì)導(dǎo)致位點(diǎn)特異性修飾,使脫靶切割減少40-120倍,同時(shí)保持靶向性能。gRNA上游5'發(fā)夾結(jié)構(gòu)的修飾可以提高Cas9和Cas12的特異性,降低脫靶效應(yīng)。上海脫靶檢測(cè)
上海唯可生物科技有限公司是一家有著先進(jìn)的發(fā)展理念,先進(jìn)的管理經(jīng)驗(yàn),在發(fā)展過(guò)程中不斷完善自己,要求自己,不斷創(chuàng)新,時(shí)刻準(zhǔn)備著迎接更多挑戰(zhàn)的活力公司,在上海市等地區(qū)的醫(yī)藥健康中匯聚了大量的人脈以及**,在業(yè)界也收獲了很多良好的評(píng)價(jià),這些都源自于自身的努力和大家共同進(jìn)步的結(jié)果,這些評(píng)價(jià)對(duì)我們而言是比較好的前進(jìn)動(dòng)力,也促使我們?cè)谝院蟮牡缆飞媳3謯^發(fā)圖強(qiáng)、一往無(wú)前的進(jìn)取創(chuàng)新精神,努力把公司發(fā)展戰(zhàn)略推向一個(gè)新高度,在全體員工共同努力之下,全力拼搏將共同上海唯可生物科技供應(yīng)和您一起攜手走向更好的未來(lái),創(chuàng)造更有價(jià)值的產(chǎn)品,我們將以更好的狀態(tài),更認(rèn)真的態(tài)度,更飽滿的精力去創(chuàng)造,去拼搏,去努力,讓我們一起更好更快的成長(zhǎng)!