不論在科研還是臨床中,CRISPR技術(shù)的使用都帶來了非常高的回報,也同時伴隨著各種風(fēng)險,這其中脫靶現(xiàn)象就研究者們較為擔(dān)心的一類風(fēng)險。本文中我們盤點了多種主流的CRISPR脫靶位點檢測方法,但沒有一種方法是適用于所有CRISPR技術(shù)的脫靶檢測,一個項目中只使用一種脫靶檢測方法也是不足夠的。如何在實驗中,特別是臨床試驗中多方面評估CRISPR的脫靶風(fēng)險,需要將多種脫靶檢測方法有效組合。同時,每一條sgRNA都不可避免地存在脫靶位點,如何評估這種風(fēng)險,如何降低這種風(fēng)險,具體的解決方案我們用臨床實例來為大家介紹。選擇潛在的脫靶位點,例如選擇gRNA預(yù)測網(wǎng)站上Top 5潛在脫靶位點,進(jìn)行Sanger測序單克隆;江蘇高精度脫靶檢測企業(yè)
GUIDE-Seq脫靶評估技術(shù)的優(yōu)勢分析鼓潤致力于基因組編輯工具脫靶的分析檢測工作,為篩選、優(yōu)化基因組編輯工具的保真性提供標(biāo)準(zhǔn)化的分析。我們脫靶分析具有如下優(yōu)勢:實用性強(qiáng):能反映CRISPR在真核細(xì)胞中進(jìn)行基因編輯的在靶與脫靶情況,以進(jìn)行安全性和有效性評價;檢測通量高:一次能檢測多個樣本的在靶與脫靶情況,并通過優(yōu)化的標(biāo)簽設(shè)計,降低實際的測序reads數(shù)量;準(zhǔn)確性高:絕大部分檢測結(jié)果可被驗證;靈敏度高:能夠高效檢測出低頻脫靶位點,檢測低至0.1%的脫靶突變;實驗難度低:操作過程簡單易行細(xì)胞適應(yīng)性強(qiáng)。浙江基因療法脫靶檢測服務(wù)根據(jù)選擇的sgRNA,通過生物信息學(xué)方法,對sgRNA進(jìn)行脫靶分析。
CRISPR基因編輯zhiliao發(fā)展如火如荼,但也有不少人對基因zhiliao的安全性提出擔(dān)憂,由于CRISPR技術(shù)是直接改變基因組DNA,其中任何的改變都會被長久保留下來,所以CRISPR對于DNA序列的任何改變都需要嚴(yán)謹(jǐn)?shù)陌踩u估。根據(jù)目前已經(jīng)公開的FDA關(guān)于基因zhiliao的指導(dǎo)文件,對于基因zhiliao安全性的評估可以簡單總結(jié)為兩個方面:由于目前大部分CRISPR基因編輯zhiliao方案是基于CRISPR引起的DNA雙鏈斷裂和隨機(jī)突變進(jìn)行基因敲除,所以一類風(fēng)險主要是指靶位點的隨機(jī)突變引發(fā)的安全風(fēng)險,如果出現(xiàn)大片段丟失、染色體重排等異常變化,都存在巨大的安全隱患。
對于基因修飾細(xì)胞zhiliao產(chǎn)品,充分的非臨床研究是為了:(1)闡明基因修飾的目的、功能以及產(chǎn)品的作用機(jī)制,明確其在擬定患者人群中使用的生物學(xué)合理性;(2)為臨床試驗的給藥途徑、給藥程序、給藥劑量的選擇提供支持性依據(jù);(3)根據(jù)潛在風(fēng)險因素,闡明毒性反應(yīng)特征,預(yù)測人體可能出現(xiàn)的不良反應(yīng),確定不良反應(yīng)的臨床監(jiān)測指標(biāo),為制定臨床風(fēng)險控制措施提供參考依據(jù)。因此,應(yīng)充分開展非臨床研究,收集用于風(fēng)險獲益評估的信息,以確立擬開發(fā)產(chǎn)品在目標(biāo)患者人群中預(yù)期具有合理的、可接受的獲益風(fēng)險比,同時為臨床試驗的設(shè)計和風(fēng)險控制策略的制定提供支持性依據(jù)。如何檢測是否發(fā)生脫靶?
使用CRISPR/Cas9、ZFNs和TALENs等設(shè)計核酸酶進(jìn)行基因組編輯,可以將遺傳物質(zhì)定向?qū)氩溉閯游锘蚪M的特定位點。然而,可能會出現(xiàn)非預(yù)期的靶上和靶外基因組修飾,這可能導(dǎo)致基因組不穩(wěn)定,并破壞正?;虻墓δ?,從而可能導(dǎo)致臨床前和臨床研究中的安全問題?;蚓庉嬆壳暗拿摪蟹治黾夹g(shù)主要依賴于生物信息學(xué)預(yù)測和全基因組脫靶檢測技術(shù)。這些預(yù)測缺乏可靠性,因為它們只涵蓋了潛在基因組改變的一小部分。而頻率低于0.5%的脫靶突變大多無法被全基因組脫靶檢測技術(shù)檢測到。我們是開發(fā)用于全基因組靶向/非靶向分析的無偏分析的先驅(qū)。靶向基因組編輯唯可生物為基因編輯安全性評估提供多方面的PCR和基于NGS的分析。我們的多功能且經(jīng)濟(jì)高效的檢測方法可檢測靶向和非靶向基因組改變。我們先進(jìn)的分析技術(shù)與強(qiáng)大的內(nèi)部生物信息學(xué)體系相結(jié)合,可靠地量化了預(yù)期的靶向整合與非預(yù)期結(jié)果(如易位和INDEL)之間的比率。高深度全基因組重測序服務(wù),該方法能多方位精細(xì)地對基因編輯的細(xì)胞或個體進(jìn)行off-target檢測。南通高精度脫靶檢測技術(shù)
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基因zhiliao產(chǎn)品特有的可能會引起遲發(fā)性不良反應(yīng)的風(fēng)險因素包括:基因組整合活性基因zhiliao產(chǎn)品可能會采用修飾宿主基因組的技術(shù),并有可能在宿主細(xì)胞或組織中持續(xù)存在。很多基因zhiliao載體的基因整合不會指向基因組的特定位點,可能在整合位點處產(chǎn)生插入突變、或jihuo整合位點附近的原基因等,進(jìn)而破壞重要基因功能或增加惡性liu的風(fēng)險,例如,國外已有多項研究報告在接受了使用γ-逆轉(zhuǎn)錄病毒載體轉(zhuǎn)導(dǎo)的基因修飾細(xì)胞zhiliao的受試者中發(fā)生白血病。因此,對于存在此類風(fēng)險的產(chǎn)品,有必要進(jìn)行長期隨訪臨床研究以評估出現(xiàn)遲發(fā)不良反應(yīng)的風(fēng)險。江蘇高精度脫靶檢測企業(yè)
上海唯可生物科技有限公司是一家有著先進(jìn)的發(fā)展理念,先進(jìn)的管理經(jīng)驗,在發(fā)展過程中不斷完善自己,要求自己,不斷創(chuàng)新,時刻準(zhǔn)備著迎接更多挑戰(zhàn)的活力公司,在上海市等地區(qū)的醫(yī)藥健康中匯聚了大量的人脈以及**,在業(yè)界也收獲了很多良好的評價,這些都源自于自身的努力和大家共同進(jìn)步的結(jié)果,這些評價對我們而言是比較好的前進(jìn)動力,也促使我們在以后的道路上保持奮發(fā)圖強(qiáng)、一往無前的進(jìn)取創(chuàng)新精神,努力把公司發(fā)展戰(zhàn)略推向一個新高度,在全體員工共同努力之下,全力拼搏將共同上海唯可生物科技供應(yīng)和您一起攜手走向更好的未來,創(chuàng)造更有價值的產(chǎn)品,我們將以更好的狀態(tài),更認(rèn)真的態(tài)度,更飽滿的精力去創(chuàng)造,去拼搏,去努力,讓我們一起更好更快的成長!