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目前鼓潤已掌握了該項(xiàng)技術(shù),簡述如下:1、CRISPR與dsODNtag整合的實(shí)驗(yàn)技術(shù)及高通量測序建庫流程將靶向于目標(biāo)基因組位點(diǎn)的CRISPR質(zhì)粒與dsODNtag以核電轉(zhuǎn)的方式同時轉(zhuǎn)染入真核細(xì)胞,CRISPR造成基因組雙鏈斷裂后,dsODNtag將整合入斷點(diǎn)處,作為后續(xù)分析在靶與脫靶情況的標(biāo)記。轉(zhuǎn)染后3天收集細(xì)胞的DNA進(jìn)行高通量建庫。2、GUIDE-seq生信分析方法1)搭建了高通量測序的數(shù)據(jù)分析流程。2)利用該技術(shù)分析了CRISPR靶向編輯某細(xì)胞系基因的在靶與脫靶情況。其中一例樣品的分析結(jié)果如圖4所示:Sequencesofoff-targetsitesidentifiedbyGUIDE-seq.Theintendedtargetsequenceisshowninthetoplinewithcleavedsitesshownunderneathandwithmismatchestotheon-targetsiteshownandhighlightedincolor.GUIDE-seqsequencingreadcountsareshowntotherightofeachsite.3)利用PCR擴(kuò)增技術(shù)聯(lián)合Sanger測序鑒定了分析出的脫靶位點(diǎn)。高精度脫靶檢測,推薦唯可生物,實(shí)驗(yàn)實(shí)力強(qiáng),專業(yè)性高,檢測效率高,結(jié)果準(zhǔn)確率高。武漢off-target脫靶檢測評估標(biāo)準(zhǔn)
近幾年,細(xì)胞和基因zhiliao(cell & gene therapy,CGT)領(lǐng)域發(fā)展迅猛,在多個方向取得了重大突破,以anti-CD19和BCMA為代的多種CAR-T免疫細(xì)胞療法攻克了一部分血液瘤,多種AAV療法也給一些難以成藥的罕見病提供了有效的zhiliao方案。另一方面,基于CRISPR基因編輯技術(shù)的眾多基因療法也進(jìn)展迅速,較早體外基因編輯療法較快今年年底能夠上市(CRISPR Therapeutics CTX001),體內(nèi)基因編輯療法取得了不錯的臨床數(shù)據(jù)(Intellia Therapeutics NTLA-2001),使用CRISPR技術(shù)制造的通用型CAR-T療法也是免疫細(xì)胞療法發(fā)展的一大趨勢(Caribou Biosciences CB-010)。溫州種子脫靶檢測服務(wù)基因編輯技術(shù)脫靶檢測,推薦唯可生物,實(shí)驗(yàn)實(shí)力強(qiáng),專業(yè)性高,檢測效率高,結(jié)果準(zhǔn)確率高。
CRISPR基于sgRNA與基因組序列互補(bǔ)定位到靶位點(diǎn),不論哪種CRISPR系統(tǒng),都存在sgRNA序列不完全匹配但能夠結(jié)合基因組的脫靶現(xiàn)象,CRISPR定位到脫靶位點(diǎn)引發(fā)序列改變就屬于第二類風(fēng)險(xiǎn)。CRISPR技術(shù)誕生剛過10年,期間迅速取代TALEN和ZFN,成為學(xué)術(shù)界通用的基因編輯技術(shù),也徹底改變了我們的生物學(xué)研究方法。為提高CRISPR技術(shù)的安全性,特別是往臨床應(yīng)用發(fā)展時的安全性問題,研究者們一直以提高靶位點(diǎn)的編輯效率和準(zhǔn)確性,同時降低脫靶位點(diǎn)編輯發(fā)生概率為目標(biāo),來優(yōu)化CRISPR技術(shù)。另一方面,研究者們也開發(fā)了大量檢測方法,用于檢測CRISPR的靶向風(fēng)險(xiǎn)和脫靶風(fēng)險(xiǎn),用于早期sgRNA序列的篩選,以期望獲得一個較為安全的sgRNA。
使用CRISPR/Cas9、ZFNs和TALENs等設(shè)計(jì)核酸酶進(jìn)行基因組編輯,可以將遺傳物質(zhì)定向?qū)氩溉閯游锘蚪M的特定位點(diǎn)。然而,可能會出現(xiàn)非預(yù)期的靶上和靶外基因組修飾,這可能導(dǎo)致基因組不穩(wěn)定,并破壞正?;虻墓δ?,從而可能導(dǎo)致臨床前和臨床研究中的安全問題?;蚓庉嬆壳暗拿摪蟹治黾夹g(shù)主要依賴于生物信息學(xué)預(yù)測和全基因組脫靶檢測技術(shù)。這些預(yù)測缺乏可靠性,因?yàn)樗鼈冎缓w了潛在基因組改變的一小部分。而頻率低于0.5%的脫靶突變大多無法被全基因組脫靶檢測技術(shù)檢測到。我們是開發(fā)用于全基因組靶向/非靶向分析的無偏分析的先驅(qū)。靶向基因組編輯唯可生物為基因編輯安全性評估提供多方面的PCR和基于NGS的分析。我們的多功能且經(jīng)濟(jì)高效的檢測方法可檢測靶向和非靶向基因組改變。我們先進(jìn)的分析技術(shù)與強(qiáng)大的內(nèi)部生物信息學(xué)體系相結(jié)合,可靠地量化了預(yù)期的靶向整合與非預(yù)期結(jié)果(如易位和INDEL)之間的比率。脫靶檢測評估,推薦唯可生物,實(shí)驗(yàn)實(shí)力強(qiáng),專業(yè)性高,檢測效率高,結(jié)果準(zhǔn)確率高。
由于設(shè)計(jì)的sgRNA會與非靶點(diǎn)DNA序列錯配,引入非預(yù)期的基因突變,即脫靶效應(yīng)(Off-targeteffects)。脫靶效應(yīng)造成了研究中的許多不確定性,這無疑限制了該技術(shù)的應(yīng)用。因此,研究者希望能開發(fā)有效的方法來檢測脫靶效應(yīng)。在目前主流的脫靶效應(yīng)評估方法中,有一種方法為GUIDE-seq,其原理是利用一種短的雙鏈寡聚核苷酸(dsODN)標(biāo)記CRISPR/Cas誘導(dǎo)的脫靶斷裂,然后對標(biāo)簽所在的基因組區(qū)域進(jìn)行高通量測序,通過生物信息學(xué)分析從而確定脫靶位點(diǎn)。利用該技術(shù)可以在基因組范圍內(nèi)檢測CRISPR脫靶效應(yīng),從而改變了以往先預(yù)測假定脫靶位點(diǎn)再檢測的思路;與其他的評估方法相比,GUIDE-seq更精確、更靈敏。定量脫靶檢測,推薦唯可生物,實(shí)驗(yàn)實(shí)力強(qiáng),專業(yè)性高,檢測效率高,結(jié)果準(zhǔn)確率高。臺州crispr/cas9脫靶檢測CRO
基因療法脫靶檢測,推薦唯可生物,實(shí)驗(yàn)實(shí)力強(qiáng),專業(yè)性高,檢測效率高,結(jié)果準(zhǔn)確率高。武漢off-target脫靶檢測評估標(biāo)準(zhǔn)
先導(dǎo)編輯器:CBE和ABE組合使用可以有效地進(jìn)行4種堿基轉(zhuǎn)換(C→T, G→A, A→G, T→C),而無需產(chǎn)生DSB,然而除了這4種堿基轉(zhuǎn)換,對另外8種堿基轉(zhuǎn)換(C→A, C→G, G→C, G→T, A→C, A→T, T→A, T→G)以及堿基的插入和缺失,依然缺乏有效的研究工具。先導(dǎo)編輯器(Prime Editor, PE),PE在不依賴DSB和供體DNA的條件下便可有效實(shí)現(xiàn)所有12種堿基轉(zhuǎn)換,此外還能有效實(shí)現(xiàn)多堿基的精細(xì)插入(較多可插入44bp)和刪除(較多刪除80bp)。> 抗CRISPR蛋白??笴RISPR(Acr)蛋白是天然的CRISPR/Cas系統(tǒng)抑制劑,由各種可移動遺傳元件(MGEs)編碼,在不同階段抑制CRISPR-Cas的免疫功能。已經(jīng)發(fā)現(xiàn)了多達(dá)45個Acr蛋白,其中 "AcrIIA4 "有可能保護(hù)細(xì)胞免受編輯。Shin和他的同事發(fā)現(xiàn),通過調(diào)整AcrIIA4或Cas9加入實(shí)驗(yàn)的時間,AcrIIA4將脫靶修飾減少了4倍,而沒有減少靶向效應(yīng)。武漢off-target脫靶檢測評估標(biāo)準(zhǔn)