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DIA蛋白組學(xué):SAPHO綜合征是一種侵犯皮膚和骨骼的炎癥性疾病,其發(fā)病率低,表現(xiàn)形式多樣,診斷困難。2022年1月,由北京中醫(yī)藥大學(xué)課題組在J Proteomics.期刊發(fā)表的題為“Complement system deregulation in SAPHO syndrome revealed by proteomic profiling”的研究成果,通過DIA蛋白組學(xué)研究方法,***揭示了SAPHO患者的血清蛋白質(zhì)組譜,為疾病診斷提供了潛在的生物標(biāo)志物。同時(shí)作者發(fā)現(xiàn)補(bǔ)體系統(tǒng)抑制劑如CFH和C4BP在SAPHO綜合征中表達(dá)上調(diào),這可能在SAPHO綜合征的發(fā)病機(jī)制中發(fā)揮重要作用。蛋白質(zhì)組與代謝組聯(lián)合分析。上海蛋白組學(xué)質(zhì)譜
蛋白質(zhì)組學(xué)研究方法研究案例:2021年10月,中國(guó)科學(xué)院上海營(yíng)養(yǎng)與健康研究所武愛波研究員課題組在Ecotoxicology and Environmental Safety發(fā)表了題為“Mycotoxin deoxynivalenol affects myoblast differentiation via downregulating cytoskeleton and ECM-integrin-FAK-RAC-PAK signaling pathway"的研究成果,通過轉(zhuǎn)錄組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)研究方法,探究了脫氧雪腐鐮刀菌烯醇(DON)對(duì)成肌細(xì)胞分化的影響,發(fā)現(xiàn)了DON處理使得細(xì)胞骨架蛋白和細(xì)胞外基質(zhì)蛋白表達(dá)下調(diào),并抑制ECM-integrin-FAK-RAC-PAK信號(hào)通路的機(jī)理,為食品和飼料污染的防治提供了理論依據(jù)。天津蛋白組學(xué)研究藥物作用靶點(diǎn)蛋白質(zhì)組學(xué),修飾蛋白質(zhì)組,蛋白·修飾·代謝。
通過蛋白質(zhì)組學(xué)+轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究方法,發(fā)現(xiàn)大黃素引發(fā)外泌體通過抑制代謝通路來減少肺泡巨噬細(xì)胞的活化和改善肺部炎癥的特征,探究了外泌體在參與炎癥相關(guān)***損傷中的重要作用,為大黃素可以通過減少胰腺外泌體介導(dǎo)的肺泡巨噬細(xì)胞活化來減輕嚴(yán)重急性胰腺炎相關(guān)的急性肺損傷提供依據(jù)。中文標(biāo)題:大黃素通過抑制胰腺外泌體介導(dǎo)的肺泡巨噬細(xì)胞活化減輕嚴(yán)重急性胰腺炎相關(guān)的急性肺損傷研究對(duì)象:大鼠血漿外泌體發(fā)表期刊:ActaPharmaceuticaSinicaB影響因子:11.413發(fā)表時(shí)間:2021年10月合作單位:四川大學(xué)華西醫(yī)院運(yùn)用生物技術(shù):TMT標(biāo)記定量蛋白組學(xué)(由歐易/鹿明生物提供技術(shù)支持)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)
為了更好地了解DON對(duì)C2C12細(xì)胞分化的影響,作者進(jìn)行了轉(zhuǎn)錄組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)的整合分析。共鑒定了149個(gè)共同的***差異基因(co-DEG),其中91%被共下調(diào)(圖3A)。15%的co-DEG屬于真核細(xì)胞骨架,其中大部分屬于肌動(dòng)蛋白絲,少數(shù)是中間絲和微管的成分。對(duì)co-DEG進(jìn)行GO分析,生物學(xué)過程富集了“骨骼肌肌球蛋白粗絲組裝”和“快肌纖維收縮的正向調(diào)節(jié)”條目。細(xì)胞組分中富集的**個(gè)條目是“纖維蛋白原復(fù)合物”、“細(xì)胞外空間”、“細(xì)胞外基質(zhì)”、“細(xì)胞外區(qū)域”和“蛋白質(zhì)細(xì)胞外基質(zhì)”,這些都是細(xì)胞外成分(圖3B)。結(jié)果表明,DON主要影響肌肉成分的組成和功能以及多種細(xì)胞外成分的表達(dá)。通路富集分析富集到了“ECM-受體相互作用”、“蛋白質(zhì)消化和吸收”、“人**瘤病毒***”和“粘著斑”等通路。走近蛋白組學(xué)之蛋白組學(xué)常見問題答疑解惑。
TMT蛋白質(zhì)組學(xué)探究案例:2021年9月,安徽農(nóng)業(yè)大學(xué)張照亮教授課題組在Journal of Agricultural and Food Chemistry期刊發(fā)表了題為“Nitrogen-Regulated Theanine and Flavonoid Biosynthesis in Tea Plant Roots: Protein-Level Regulation Revealed by Multiomics Analyses”的研究成果,通過TMT蛋白質(zhì)組學(xué)和泛素化蛋白質(zhì)組學(xué)研究方法,發(fā)現(xiàn)了氮缺乏條件下茶樹根部響應(yīng)的差異表達(dá)蛋白和泛素化蛋白質(zhì),為茶氨酸和黃酮類生物合成的調(diào)控提供了新的見解,為茶樹翻譯后修飾調(diào)控次生代謝的研究提供了理論依據(jù)。一文了解DIA、TMT/iTRAQ、傳統(tǒng)Label free蛋白組學(xué)區(qū)別在哪。江西蛋白組學(xué)prm
蛋白質(zhì)組學(xué),蛋白質(zhì)組分析,專業(yè)的多組學(xué)聯(lián)合分析。上海蛋白組學(xué)質(zhì)譜
為了驗(yàn)證iTRAQ標(biāo)記蛋白組學(xué)分析測(cè)定的蛋白積累變化,選擇兩種蛋白進(jìn)行westernblot分析。如圖4A所示,iTRAQ分析中兩種蛋白(RPD3和VMA3)的積累每次均與westernblot數(shù)據(jù)一致。RPD3、TOR1、VMA3和VAC8在基因水平上的相對(duì)表達(dá)量與蛋白水平相似,在BF的菌絲中也表達(dá)上調(diào)(圖4B-D)。VAC8在2-1、3-1、4-1組的基因水平上高度上調(diào)。這些結(jié)果表明,這些上調(diào)的表達(dá)蛋白可能是香菇BF形成的重要蛋白。本研究利用標(biāo)記定量(iTRAQ)蛋白質(zhì)組學(xué)、基于氣相色譜-質(zhì)譜的代謝組學(xué)GC-MS非靶向代謝組學(xué)和透射電鏡分析細(xì)胞結(jié)構(gòu),研究了香菇菌絲后熟轉(zhuǎn)色形成的機(jī)制,并且***證明氧化應(yīng)激和自噬過程是至關(guān)重要,為后續(xù)進(jìn)一步的研究提供了新的見解。上海蛋白組學(xué)質(zhì)譜
上海歐易生物醫(yī)學(xué)科技有限公司總部位于聯(lián)航路1188號(hào)25幢,是一家檢驗(yàn)檢測(cè)服務(wù)。(依法須經(jīng)批準(zhǔn)的項(xiàng)目,經(jīng)相關(guān)部門批準(zhǔn)后方可開展經(jīng)營(yíng)活動(dòng),具體經(jīng)營(yíng)項(xiàng)目以相關(guān)部門批準(zhǔn)文件或許可證件為準(zhǔn))一般項(xiàng)目:生物醫(yī)藥產(chǎn)品、生化產(chǎn)品的研發(fā),醫(yī)藥中間體、化工原料及產(chǎn)品(除危險(xiǎn)品化學(xué)品、監(jiān)控化學(xué)品、易制毒化學(xué)品)的研發(fā)、銷售,儀器儀表的銷售,并提供相關(guān)技術(shù)咨詢、技術(shù)服務(wù),會(huì)務(wù)服務(wù),企業(yè)管理咨詢。的公司。歐易生物擁有一支經(jīng)驗(yàn)豐富、技術(shù)創(chuàng)新的專業(yè)研發(fā)團(tuán)隊(duì),以高度的專注和執(zhí)著為客戶提供科研服務(wù),科研檢測(cè),學(xué)術(shù)研究,技術(shù)咨詢。歐易生物始終以本分踏實(shí)的精神和必勝的信念,影響并帶動(dòng)團(tuán)隊(duì)取得成功。歐易生物始終關(guān)注醫(yī)藥健康市場(chǎng),以敏銳的市場(chǎng)洞察力,實(shí)現(xiàn)與客戶的成長(zhǎng)共贏。