TMT標記定量蛋白質組學研究案例：2021年12月威爾康奈爾醫(yī)學中心和紀念斯隆凱特琳**中心的Linda T. Vahdat 和 Vivek Mittal教授課題組在Nature Communications期刊發(fā)表的題為 “Copper depletion modulates mitochondrial oxidative phosphorylation to impair triple negative breast cancer metastasis”的研究成果，通過蛋白質組學和代謝組學研究方法，發(fā)現了高度轉移性 SOX2/OCT4+ 細胞的離散亞群表現出細胞內銅水平升高特征，探究了TM 介導的復合物 IV 失活確定為 SOX2/OCT4+ 細胞群中的主要代謝缺陷，AMPK/mTORC1 能量傳感器為重要的下游途徑。描繪了銅-代謝-轉移軸，為高風險三陰性乳腺*患者的下一代治療方法提供了理論依據。中文標題：銅耗竭調節(jié)線粒體氧化磷酸化以損害三陰性乳腺*轉移研究對象：高風險三陰性乳腺*(TNBC)發(fā)表期刊：NatureCommunications影響因子：14.919發(fā)表時間：2021年12月合作單位：紀念斯隆凱特琳**中心，Sandra和EdwardMeyer**中心運用關鍵生物技術：TMT標記定量蛋白質組學和靶向代謝組學蛋白驗證新技術-PRM,平行反應監(jiān)視蛋白組學。安徽蛋白組學 中藥
蛋白組學技術是以蛋白質組為研究對象，研究細胞、組織或生物體蛋白質組成及其變化規(guī)律的科學。DIA作為一種新的質譜數據采集方式穩(wěn)定性高，覆蓋度廣的優(yōu)點。DIA蛋白組學技術已經越來越多的疾病研究中發(fā)揮重大作用。本研究通過DIA蛋白組學技術分析了8個SAPHO病人和8個健康人的蛋白表達譜。蛋白表達的相關性圖顯示組內相關性良好，差異蛋白的PCA圖顯示兩組得到明顯的區(qū)分。蛋白質組學通過研究生物樣本中蛋白質組成和變化，從而推動疾病的病理機制研究，為臨床診斷和預后提供潛在生物標志物。安徽tmt標記定量蛋白組學定量蛋白質組學 蛋白質進行質譜檢測未知蛋白進行全檢測。
為了更好地了解DON對C2C12細胞分化的影響，作者進行了轉錄組學和蛋白質組學的整合分析。共鑒定了149個共同的***差異基因（co-DEG），其中91%被共下調（圖3A）。15%的co-DEG屬于真核細胞骨架，其中大部分屬于肌動蛋白絲，少數是中間絲和微管的成分。對co-DEG進行GO分析，生物學過程富集了“骨骼肌肌球蛋白粗絲組裝”和“快肌纖維收縮的正向調節(jié)”條目。細胞組分中富集的**個條目是“纖維蛋白原復合物”、“細胞外空間”、“細胞外基質”、“細胞外區(qū)域”和“蛋白質細胞外基質”，這些都是細胞外成分（圖3B）。結果表明，DON主要影響肌肉成分的組成和功能以及多種細胞外成分的表達。通路富集分析富集到了“ECM-受體相互作用”、“蛋白質消化和吸收”、“人**瘤病毒***”和“粘著斑”等通路。
蛋白質組學研究方法研究案例：2021年10月，中國科學院上海營養(yǎng)與健康研究所武愛波研究員課題組在Ecotoxicology and Environmental Safety發(fā)表了題為“Mycotoxin deoxynivalenol affects myoblast differentiation via downregulating cytoskeleton and ECM-integrin-FAK-RAC-PAK signaling pathway"的研究成果，通過轉錄組學和蛋白質組學研究方法，探究了脫氧雪腐鐮刀菌烯醇（DON）對成肌細胞分化的影響，發(fā)現了DON處理使得細胞骨架蛋白和細胞外基質蛋白表達下調，并抑制ECM-integrin-FAK-RAC-PAK信號通路的機理，為食品和飼料污染的防治提供了理論依據。蛋白質組學 找歐易生物-生物標志物、機制研究一站式服務。
iTRAQ標記定量蛋白組學研究方法：2021年4月，南京林業(yè)大學喻方圓教授（一作：吳岐奎）課題組在JournaloftheScienceofFoodandAgriculture期刊發(fā)表了題為“ProteomicanalysisofmetabolicmechanismsassociatedwithfattyacidbiosynthesisduringStyraxtonkinensiskerneldevelopment”的研究成果，通過轉錄組學+iTRAQ標記定量蛋白組學研究方法，分析東京野茉莉種子發(fā)育過程中脂肪酸生物合成相關基因的表達趨勢，確定油脂積累的主要影響因子并構建其調控網絡。為野茉莉屬植物種子油用研究和后續(xù)功能分析研究提供了一定的研究基礎。蛋白質組與代謝組聯合分析。福建swath定量蛋白組學
蛋白組學近期研究進展的盤點。安徽蛋白組學 中藥
TMT標記定量蛋白組學研究案例：2021年11月，南京中醫(yī)藥大學附屬醫(yī)院江蘇省中醫(yī)院單位（一作劉史佳研究員）及其課題組在MolecularMetabolism期刊發(fā)表的題為“Serumintegrativeomicsrevealsthelandscapeofhumandiabetickidneydisease”的研究成果，通過TMT標記定量蛋白組學和GC-MS非靶代謝組學研究方法，發(fā)現了糖尿病腎病（DKD）特征，篩選了蛋白和代謝容組合生物標志物。為優(yōu)化糖尿病腎?。―KD）管理提供了豐富且開放訪問的數據資源。中文標題：血清綜合組學揭示人類糖尿病腎病情況研究對象：人血清發(fā)表期刊：MolecularMetabolism影響因子：7.422發(fā)表時間：2021年11月1日合作單位：江蘇省中醫(yī)院運用生物技術：TMT標記定量蛋白質組學、GC-MS非靶向代謝組學(其中部分工作由歐易/鹿明生物提供技術支持)、ELISA安徽蛋白組學 中藥
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