單細胞轉(zhuǎn)錄組測序(Single-cell RNA-sequencing, scRNA-seq) 是在單個細胞水平對mRNA 進行高通量測序的一項新技術(shù)，其原理是將多細胞生物分離的單個細胞中微量的轉(zhuǎn)錄組mRNA 通過高效擴增后再進行高通量測序。單細胞轉(zhuǎn)錄組測序能夠有效解決組織樣本無法**的細胞異質(zhì)性難題以及常規(guī)RNA-seq 被掩蓋的細胞群內(nèi)的轉(zhuǎn)錄組異質(zhì)性難題，有助于發(fā)現(xiàn)新的稀有細胞類型，并深入了解發(fā)育過程中的表達調(diào)控機制。近年來，已有多種單細胞測序技術(shù)及平臺應(yīng)用而生。其中，基于微流控技術(shù)的平臺通量有限，基于板型技術(shù)的平臺有耗時的熒光***細胞分選過程，近來基于液滴技術(shù)的平臺的10xGenomics 憑借其單次成千上萬的細胞通量、周期短及成本低成為目前主流的單細胞轉(zhuǎn)錄組測序平臺。研究對象的“基本屬性”決定了單細胞高通量技術(shù)是目前我們解析各種生命現(xiàn)象、揭示生物學(xué)機制的技術(shù)手段。專注單細胞測序
2021年12月，南京農(nóng)業(yè)大學(xué)動物醫(yī)學(xué)學(xué)院楊倩教授及生命科學(xué)學(xué)院林建副教授，于Cell＆Bioscience(IF:7.133) 在線發(fā)表了IBDV ***雞法氏囊的單細胞測序的***研究成果。研究工作內(nèi)容的主要承擔者為Abid Ullah Shah博士。歐易生物提供高通量單細胞轉(zhuǎn)錄組測序（10x Genoimics單細胞轉(zhuǎn)錄組測序）技術(shù)支持。該研究從雞傳染性法氏囊病毒的鼻腔***入手，一方面***闡述了IBDV 通過雞鼻腔傳播至法氏囊的傳播途徑及病毒***主要靶細胞；另一方面，研究初步闡明家禽細胞應(yīng)用RNAi抵抗IBDV的分子機制，為高效防控家禽RNA病毒奠定理論基礎(chǔ)。天津介紹單細胞測序銷售價格單細胞測序業(yè)務(wù)已成為這些公司業(yè)務(wù)的重要組成部分，單細胞業(yè)務(wù)占比也逐年提升。
歐易單細胞測序繼續(xù)發(fā)力！近日，歐易生物合作客戶復(fù)旦大學(xué)附屬中山醫(yī)院王群教授團隊在EBioMedicine（IF8.143）期刊發(fā)表的關(guān)于食管鱗狀細胞*（ESCC）分子圖譜的相關(guān)成果，對食管鱗狀細胞*的異質(zhì)性和**微環(huán)境進行深入的分析并提出了食管鱗狀細胞****的潛在靶點。歐易生物提供了該項目單細胞轉(zhuǎn)錄組測序相關(guān)。歡迎有意向開展單細胞測序研究的老師們向我們咨詢溝通單細胞相關(guān)問題。
工作材料：5個**組織和5個配對正常組織
期刊：EBioMedicine
發(fā)表時間：2021年6月27日
方法：歐易生物10xGenomicsscRNA-seq
單細胞全基因組測序技術(shù)是在單細胞水平對全基因組進行擴增與測序的一項新技術(shù)。其原理是將分離的單個細胞的微量全基因組DNA進行擴增，獲得高覆蓋率的完整的基因組之后通過外顯子捕獲進而高通量測序用于揭示細胞群體差異和細胞進化關(guān)系。全基因組擴增技術(shù)主要分為兩種類型：一是基于熱循環(huán)以PCR為基礎(chǔ)的擴增技術(shù)，如簡并寡核苷酸引物PCR (DOP-PCR)、連接反應(yīng)介導(dǎo)的PCR (LM-PCR)、擴增前引物延伸反應(yīng) (PEP)等；一是基于等溫反應(yīng)不以PCR為基礎(chǔ)的擴增技術(shù)，如多重置換擴增 (MDA) 和基于引物酶的全基因組擴增 (pWGA)。單細胞蛋白組和代謝組受制于質(zhì)譜儀器的靈敏度，目前還存在一定的難度。
單細胞懸液制備難于標準化。
基于酶學(xué)的樣本處理方法，大都會存在一定程度的解離偏好性，即不同的酶處理不同的組織往往會有不太一樣的「效果」，而這種效果不僅*反應(yīng)在細胞得率，細胞活性和細胞碎片等參數(shù)上，往往也會在**終細胞類型有所反映，比如可能會導(dǎo)致部分稀有細胞的丟失，細胞比例的失真等，從而偏離組織的真實狀態(tài)。另外，細胞懸液的制備過程較長，通常需要3-5小時，這個過程會導(dǎo)致細胞處于「應(yīng)激狀態(tài)」中，轉(zhuǎn)錄的過程可能已經(jīng)發(fā)生變化，偏離臨床實驗的終點設(shè)計，會對結(jié)果的判斷造成一定的影響。針對如上問題，歐易團隊從已發(fā)表的高影響力的文獻中，匯總出針對不同類型組織的處理方法，確保實驗結(jié)果與文獻并軌（同頻）。對于應(yīng)激問題，我們也開發(fā)出了低溫解離方法，使樣本始終處于「休眠」狀態(tài)，從而保證了樣本符合臨床取樣終點，還原其生物學(xué)的真實狀態(tài)。另外細胞核測序也是一個替代的選擇，對樣本的要求較低，可以解鎖大量臨床信息明確、低溫冷凍的標本。細胞核制備也不依賴于酶學(xué)，全程在低溫環(huán)境，也能真實還原樣本的臨床狀態(tài)。歐易在細胞核測序的核懸液準備上積累了很多經(jīng)驗。 我們將持續(xù)加大單細胞測序相關(guān)的研發(fā)投入，從樣本的處理優(yōu)化到多組合標簽技術(shù)的開發(fā)應(yīng)用等。推薦單細胞測序活動
利用單細胞測序技術(shù)全球的科研人員從“異質(zhì)性”的角度在不同研究領(lǐng)域進行深入挖掘，獲得眾多新發(fā)現(xiàn)。專注單細胞測序
h5Seurat 文件格式是專門為存儲和分析多模態(tài)單細胞和空間表達數(shù)據(jù)而設(shè)計的，比如 CITE-seq 或 10X Visium 技術(shù)。它能夠保存所有分子信息和相關(guān)描述的數(shù)據(jù)，包括降維信息、空間坐標以及細胞群標簽等。HDF 是用于存儲和分發(fā)科學(xué)數(shù)據(jù)的一種自我描述、多對象文件格式。HDF 由美國國家超級計算應(yīng)用中心（NCSA）創(chuàng)建，以滿足不同群體的科學(xué)家在不同工程項目領(lǐng)域之需要。后來由一個非盈利組織 HDF Group 支持，其版本包括了 HDF4 和現(xiàn)在大量使用的 HDF5。專注單細胞測序
上海歐易生物醫(yī)學(xué)科技有限公司致力于醫(yī)藥健康，是一家服務(wù)型公司。歐易生物致力于為客戶提供良好的科研服務(wù)，科研檢測，學(xué)術(shù)研究，技術(shù)咨詢，一切以用戶需求為中心，深受廣大客戶的歡迎。公司將不斷增強企業(yè)重點競爭力，努力學(xué)習(xí)行業(yè)知識，遵守行業(yè)規(guī)范，植根于醫(yī)藥健康行業(yè)的發(fā)展。在社會各界的鼎力支持下，持續(xù)創(chuàng)新，不斷鑄造高質(zhì)量服務(wù)體驗，為客戶成功提供堅實有力的支持。