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甘肅空間代謝組學是三維還是二維

來源: 發(fā)布時間:2022-07-28

鹿明生物引入Thermo ScientificTM Q Exactive HFTM將會在2022年對空間代謝組學研究帶來更高效的產(chǎn)能及更多的探索。截止2022年1月10日,鹿明生物已擁有2臺空間代謝組學**研究設備(見下方圖片)。相信鹿明生物的2022將幫助各位科研學者提供更加快速、質(zhì)量的研究。請期待鹿明生物2022給您帶來的"極速"體驗~基于AFADESI-MSI平臺代謝物廣覆蓋度的優(yōu)點,在臨床樣本以及動物樣本中同時檢測到膽堿類、多胺類、氨基酸類、肉堿類、核苷類、核苷酸類、有機酸類、碳水化合物類、膽固醇類、膽酸類、脂質(zhì)類等多種類代謝物,真正意義上滿足了“空間代謝組學”的研究需求??臻g代謝組學是廣大客戶的選擇,認準鹿明生物。甘肅空間代謝組學是三維還是二維

空間代謝組學:中文標題:MYC*基因與固醇調(diào)節(jié)元件結(jié)合蛋白協(xié)同調(diào)節(jié)**生長所必需的脂肪生成研究對象:小鼠發(fā)表期刊:CellMetabolism影響因子:27.287合作單位:斯坦福大學運用生物技術(shù):空間代謝組學、CHIP、RNA-seq、NMR和IHC等MYC是一種原*基因,在細胞增殖、凋亡、分化等多種細胞生物學過程中發(fā)揮作用,其易位、擴增或表達異常常與多種**的發(fā)***展有關(guān)。近年來關(guān)于MYC在脂質(zhì)代謝中的研究很多,據(jù)了解MYC與脂肪酸合成相關(guān)酶密切相關(guān);致*基因MYC刺激細胞生長需要脂質(zhì)來組裝新的細胞膜,但是否*由MYC調(diào)節(jié)還是與其他因素協(xié)同調(diào)節(jié)尚不清楚。因此本文主要是揭示MYC誘導的**中脂質(zhì)生成的機制。遼寧空間代謝組學曾經(jīng)錯過熱潮—空間轉(zhuǎn)錄組,別再錯過新秀—空間代謝組。

如空間代謝組。研究中開發(fā)了一種新的基于拉曼光譜和空間代謝組學分析的脂質(zhì)組學(HSL)成像策略,用于分子表征和定量再髓鞘形成,并通過特定髓鞘蛋白的免疫標記進行了驗證。利用拉曼和空間代謝組學數(shù)據(jù)生成了分子成像圖譜,用于體外組織的生物分子結(jié)構(gòu)和組成的關(guān)聯(lián)。將相關(guān)脂質(zhì)組成像方法應用于局灶性脫髓鞘小鼠模型和多發(fā)性硬化癥死后腦標本的髓鞘再分化研究。發(fā)現(xiàn)不僅在脫髓鞘腦組織和正常腦組織之間,在有髓鞘組織和正常有髓組織之間,脂質(zhì)成分皆存在差異。

空間代謝組學:前列腺*組織的分子表征對于尋找新的生物標志物、驗證臨床生物標志物和確定潛在的***靶點非常重要。然而,前列腺*組織樣本包含正常上皮、增生、基質(zhì)和**區(qū)域,具有高度異質(zhì)性,組織間固有的功能和分子差異導致常規(guī)的批量檢測方法有不同程度的信息丟失。質(zhì)譜成像(MSI)可以對組織切片不同區(qū)域中的潛在**標志物進行空間檢測,有利于分析和比較不同組織類型的代謝組和脂質(zhì)組學特征。鹿明生物已形成心、肝、腦等多個組織的空間代謝組專屬數(shù)據(jù)庫。空間代謝組學又有什么用呢?。

空間代謝組學研究作者對P493-6B細胞淋巴瘤系(BCL)進行了全基因組表達譜、核突變和ChIP分析,發(fā)現(xiàn)MYC誘導增加了包括ACLY、ACACA、FASN和SCD1及其相關(guān)蛋白在內(nèi)的脂肪酸(FA)合成基因的mRNA表達,在MYC誘導的肝細胞*(HCC)、急性白血?。═-ALL)和腎細胞*(RCC)的三種體內(nèi)轉(zhuǎn)基因小鼠模型中也有類似表達。還發(fā)現(xiàn)MYC與這些FA合成基因的啟動子結(jié)合并啟動mRNA轉(zhuǎn)錄,如甲羥戊酸和膽固醇途徑基因的啟動子。為了了解MYC和SREBP1之間的相互作用,作者首先,對這兩種蛋白進行ChIP和re-ChIP分析,證明MYC和SREBP1都可以發(fā)現(xiàn)與FA合成基因啟動子中的相同DNA分子結(jié)合(圖1)。SREBP1的敲低也降低了FA合成基因的表達,但不降低MYC基因的表達。其次,ChIP的MYC與啟動子結(jié)合,不僅調(diào)節(jié)FA合成基因的表達,還調(diào)節(jié)糖酵解和谷氨酰胺分解基因的表達。因此,MYC似乎會依次調(diào)節(jié)參與脂質(zhì)合成的基因:首先誘導葡萄糖和谷氨酰胺,然后誘導FA合成相關(guān)基因。通過RNA測序(RNA-seq)發(fā)現(xiàn),增加MYC水平會引起糖酵解、谷氨酰胺分解和FA合成??臻g代謝組技術(shù)原理 。遼寧空間代謝組學

空間代謝組學二維乃至三維的水平,極大拓展了對組學樣品信息的認知。甘肅空間代謝組學是三維還是二維

作者使用NMR對C原子進行示蹤實驗,發(fā)現(xiàn)MYC驅(qū)動葡萄糖和谷氨酰胺的C參與脂肪生成(圖3)。采用空間代謝組學檢測小鼠模型以及人BCL細胞中的FA,發(fā)現(xiàn)MYC**中不飽和脂肪酸(FA(18:1))的豐度增加。進一步發(fā)現(xiàn)13C-油酸酯在MYC誘導的BCL細胞未發(fā)生代謝,而13C-葡萄糖增加了不飽和FA中的標記碳。當MYC失活時,細胞中3H標記的棕櫚酸酯氧化速率明顯變高。MYC-ON和MYC-OFF的BCL細胞中的油酸酯均未被氧化。因此,MYC可能在抑制FA氧化的同時上調(diào)FA的合成。甘肅空間代謝組學是三維還是二維

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