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上海放心單細(xì)胞測序

來源: 發(fā)布時間:2022-08-18

單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組分析主要用于在全基因組范圍內(nèi)挖掘基因調(diào)節(jié)網(wǎng)絡(luò),尤其適用于存在高度異質(zhì)性的干細(xì)胞及胚胎發(fā)育早期的細(xì)胞群體。與活細(xì)胞成像系統(tǒng)相結(jié)合,單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組分析更有助于深入理解細(xì)胞分化、細(xì)胞重編程及轉(zhuǎn)分化等過程及相關(guān)的基因調(diào)節(jié)網(wǎng)絡(luò)。將此技術(shù)應(yīng)用于臨床,理論上可以在生理 或病理情況下連續(xù)追蹤基因表達(dá)的動力學(xué)變化,從而監(jiān)測疾病的進(jìn)展。單細(xì)胞在許多領(lǐng)域都占有一席之地,對于**早期的診斷、追蹤以及個體化***具有重要意義。3.更高效地滿足客戶的不同科研需求,在更大規(guī)模、更高分辨率上開展單細(xì)胞研究和單細(xì)胞測序。上海放心單細(xì)胞測序

單細(xì)胞技術(shù)光明的前景也催生了國內(nèi)諸多科技創(chuàng)新型企業(yè)角逐單細(xì)胞市場。像成立于 18 年的新格元,致力于開發(fā)簡便可靠的單細(xì)胞組學(xué)技術(shù),擁有自主產(chǎn)權(quán)的儀器,試劑和生物信息分析軟件等整體解決方案。也獲得了多家資本方的青睞。15 年成立的尋因生物,也自主開發(fā)了高通量單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序試劑盒,加速推動了單細(xì)胞測序技術(shù)的臨床轉(zhuǎn)化應(yīng)用。萬乘基因也建立了自主知識產(chǎn)權(quán)的設(shè)備,試劑和分析平臺,不久即將市場化推廣??;萆锸菫閿?shù)不多的將單細(xì)胞技術(shù)走向臨床的公司之一,其開發(fā)出的單細(xì)胞分選設(shè)備已獲得臨床醫(yī)療器械注冊。來自哈佛團(tuán)隊的墨卓生物也開發(fā)出了高通量單細(xì)胞測序系統(tǒng),基于分析標(biāo)簽和授權(quán)的油包水技術(shù),實現(xiàn)了高效率的細(xì)胞捕獲和成本的大幅下降。湖南專注單細(xì)胞測序胰腺樣本制備單細(xì)胞懸液的難度較大,同時不同狀態(tài)的胰腺樣本處理方法也不相同。

2021年3月30日,暨南大學(xué)生物醫(yī)學(xué)轉(zhuǎn)化研究院舉行了“單細(xì)胞聯(lián)合實驗室”的簽約儀式。簽約儀式由暨南大學(xué)生物醫(yī)學(xué)轉(zhuǎn)化研究院院長尹芝南教授主持,生物醫(yī)學(xué)轉(zhuǎn)化研究院郝健磊副研究員、上海歐易生物醫(yī)學(xué)科技有限公司營銷副總經(jīng)理董棟先生和單細(xì)胞事業(yè)部總經(jīng)理張志明先生等人出席簽約儀式。由上海歐易生物醫(yī)學(xué)科技有限公司、暨南大學(xué)生物醫(yī)學(xué)轉(zhuǎn)化研究院攜手成立的單細(xì)胞聯(lián)合實驗室,旨在促進(jìn)單細(xì)胞技術(shù)在科研領(lǐng)域的深入應(yīng)用,惠及更多的研究工作者,加強(qiáng)產(chǎn)學(xué)研合作,推動科技成果產(chǎn)業(yè)化

目前已在動物組織單細(xì)胞測序中有所應(yīng)用,那么能不能把轉(zhuǎn)錄抑制劑也應(yīng)用于植物原生質(zhì)體解離及測序中呢?雖然植物和動物都是生物組織,但在物種生理特性、理化特性上都有極大的差異,適用于動物細(xì)胞的方法并不一定能簡單適用于植物原生質(zhì)體?;谶@種想法及想解決問題的決心,我們決定突破它!經(jīng)單細(xì)胞測序及生信分析顯示,對照組較實驗組的應(yīng)激基因表達(dá)有明顯的升高,而代謝類的基因表達(dá)有明顯的降低,說明在解離原生質(zhì)體的過程中添加轉(zhuǎn)錄抑制劑,可以抑制由外界刺激導(dǎo)致的原生質(zhì)體的轉(zhuǎn)錄組變化。 經(jīng)單細(xì)胞測序及生信分析顯示,對照組較實驗組的應(yīng)激基因表達(dá)有明顯的升高。

單細(xì)胞懸液制備難于標(biāo)準(zhǔn)化。

基于酶學(xué)的樣本處理方法,大都會存在一定程度的解離偏好性,即不同的酶處理不同的組織往往會有不太一樣的「效果」,而這種效果不僅*反應(yīng)在細(xì)胞得率,細(xì)胞活性和細(xì)胞碎片等參數(shù)上,往往也會在**終細(xì)胞類型有所反映,比如可能會導(dǎo)致部分稀有細(xì)胞的丟失,細(xì)胞比例的失真等,從而偏離組織的真實狀態(tài)。另外,細(xì)胞懸液的制備過程較長,通常需要3-5小時,這個過程會導(dǎo)致細(xì)胞處于「應(yīng)激狀態(tài)」中,轉(zhuǎn)錄的過程可能已經(jīng)發(fā)生變化,偏離臨床實驗的終點設(shè)計,會對結(jié)果的判斷造成一定的影響。針對如上問題,歐易團(tuán)隊從已發(fā)表的高影響力的文獻(xiàn)中,匯總出針對不同類型組織的處理方法,確保實驗結(jié)果與文獻(xiàn)并軌(同頻)。對于應(yīng)激問題,我們也開發(fā)出了低溫解離方法,使樣本始終處于「休眠」?fàn)顟B(tài),從而保證了樣本符合臨床取樣終點,還原其生物學(xué)的真實狀態(tài)。另外細(xì)胞核測序也是一個替代的選擇,對樣本的要求較低,可以解鎖大量臨床信息明確、低溫冷凍的標(biāo)本。細(xì)胞核制備也不依賴于酶學(xué),全程在低溫環(huán)境,也能真實還原樣本的臨床狀態(tài)。歐易在細(xì)胞核測序的核懸液準(zhǔn)備上積累了很多經(jīng)驗。 歐易生物單細(xì)胞事業(yè)部在科研服務(wù)領(lǐng)域取得不菲的成績――國內(nèi)推出單細(xì)胞核測序服務(wù)公司。貴州單細(xì)胞測序銷售價格

10.目前認(rèn)知下的制備單細(xì)胞懸液需要將組織置于37℃保溫,以便蛋白酶發(fā)揮作用。上海放心單細(xì)胞測序

(2)基因檢出率低當(dāng)前主流的單細(xì)胞平臺對基因的捕獲效率較低,常見的臨床標(biāo)本,可檢測到的基因中位值在1-5k不等,占總基因數(shù)的10-20%。低豐度的基因往往捕獲不到。

(3)測序數(shù)據(jù)的高背景單細(xì)胞測序數(shù)據(jù)的背景噪聲大。單個細(xì)胞RNA含量很少,擴(kuò)增和捕獲效率的微小變化,就可能在細(xì)胞間產(chǎn)生與生物學(xué)無關(guān)的巨大差異。批次效應(yīng)處理是單細(xì)胞數(shù)據(jù)分析中必須考慮的因素之一。在不同日期制備的相似樣本,可能會因為純粹的技術(shù)原因而不盡相同,矯正和過矯正也仍是數(shù)據(jù)處理中非常棘手的一件事情。 上海放心單細(xì)胞測序

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