歐易單細胞測序繼續(xù)發(fā)力!近日,歐易生物合作客戶浙江大學醫(yī)學院附屬婦產(chǎn)科醫(yī)院林俊教授、馬俊彥老師、張麗琪博士團隊在Cell bioscience(IF 7.133)期刊發(fā)表題為Single-cell transcriptomic analysis of endometriosis provides insights into fibroblast fates and immune cell heterogeneity的研究結果,揭示了子宮內(nèi)膜異位癥病因和病理特征。歐易生物提供了該項目單細胞轉錄組實驗及測序相關工作。歡迎有意向開展單細胞測序研究的老師們向我們咨詢溝通單細胞相關問題。Adam等人通過使用具有低溫活性的蛋白酶,對小鼠腎臟組織進行單細胞測序,結果證明了在6℃條件下進行解離。廣西推薦單細胞測序
單細胞測序數(shù)據(jù)的背景噪聲大。單個細胞 RNA 含量很少,擴增和捕獲效率的微小變化,就可能在細胞間產(chǎn)生與生物學無關的巨大差異。批次效應處理是單細胞數(shù)據(jù)分析中必須考慮的因素之一。在不同日期制備的相似樣本,可能會因為純粹的技術原因而不盡相同,矯正和過矯正也仍是數(shù)據(jù)處理中非常棘手的一件事情。動輒幾萬的成本在一定程度上限制了單細胞技術的應用。當前主流的技術還是以國外技術為主,不過隨著國內(nèi)單細胞儀器公司的研發(fā)推進,在不久的將來,單細胞測序的價格一定會有大幅的下降,會讓更多的科研工作者使用到單細胞技術,推動生命科學研究。貴州單細胞測序服務電話單細胞測序技術業(yè)已成為生命科學研究的基礎技術手段,為人們理解生命現(xiàn)象背后的機制提供了數(shù)據(jù)。
inferCNV 是一款 R 包,用來探索**單細胞轉錄組數(shù)據(jù)中體細胞大規(guī)模染色體拷貝數(shù)變異,例如整個染色體或大片段染色體的擴增(gain)或缺失(loss)。通過與一組參考的“正常”細胞比較,探索**基因組不同位置的基因表達強度來實現(xiàn)。通過熱圖顯示每條染色體上的相對表達強度,在以正常細胞作為參考的情況下可以直觀地判斷**基因組上的哪些區(qū)域是過表達和低表達。為了提高推斷結果的可靠性,inferCNV 采用幾種 residual expression 過濾方法減少數(shù)據(jù)中噪聲信號,從而發(fā)現(xiàn)真正的 CNV 的信號。
2021 年 1 月,山東大學齊魯醫(yī)院泌尿外科李巖老師發(fā)表了小鼠膀胱尿路上皮細胞圖譜和上皮亞群分化特征的相關成果,文章的 10x Genomics 單細胞轉錄組測序實驗和分析工作由歐易生物提供。該研究對小鼠的膀胱上皮進行了高通量單細胞轉錄組測序,繪制了小鼠膀胱尿路上皮細胞圖譜,發(fā)現(xiàn)了一種可能與宿主反應和傷口愈合有關的新型 Plxna4+ 膀胱尿路上皮細胞,以及一群由 ASPM 標記的基底樣細胞,可能是膀胱尿路上皮祖細胞。通過 SCENIC 分析確定了調(diào)控尿路上皮細胞分化的關鍵轉錄因子,發(fā)現(xiàn)了膀胱疾病相關調(diào)控基因在不同尿路上皮細胞亞群中存在差異表達。該研究解析了小鼠膀胱尿路上皮細胞的特征,為膀胱尿路上皮和膀胱疾病的相關研究提供生物學基礎。10.目前認知下的制備單細胞懸液需要將組織置于37℃保溫,以便蛋白酶發(fā)揮作用。
歐易生物是國內(nèi)早期開展單細胞測序分析的公司之一。目前擁有10x Genomics及BD Rhapsody兩個單細胞測序平臺,以及完整、系統(tǒng)的生物信息學分析技術和流程。除了能夠進行常規(guī)的scRNA-seq(single-cell RNA sequencing),還能夠進行凍存樣本的snRNA-seq(single-nucleus RNA sequencing),為各種類型生物樣本進行單細胞測序提供了系統(tǒng)、完整的解決方案。竭誠為廣大制藥行業(yè)客戶提供高質量的單細胞測序服務,助力您加快藥物研發(fā)進程、降低臨床試驗風險、節(jié)約研發(fā)成本。歡迎有意向開展單細胞測序研究的老師們向我們咨詢溝通單細胞相關問題 。我們將持續(xù)加大單細胞測序相關的研發(fā)投入,從樣本的處理優(yōu)化到多組合標簽技術的開發(fā)應用等。浙江項目單細胞測序
單細胞技術光明的前景也催生了國內(nèi)諸多科技創(chuàng)新型企業(yè)角逐單細胞市場。廣西推薦單細胞測序
在這個飛速發(fā)展的測序時代,DNA和RNA測序已經(jīng)逐漸成為“實驗室中的家常菜”。若要評選出目前很受歡迎的一道菜,那恐怕非單細胞RNA測序莫屬。以往,研究人員通常利用RNA測序(RNA-seq)來檢測樣本中的所有RNA轉錄本,以發(fā)現(xiàn)新型RNA,或開展基因表達分析。不過,測序的對象往往是組織樣本或細胞群,這使得細胞之間的差異有可能被平均值所掩蓋。自2013年被《Nature Methods》評為年度技術以來,這項技術正被迅速地采用,發(fā)表文獻的數(shù)量也在逐年遞增。廣西推薦單細胞測序
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