蛋白質(zhì)組學(xué)、磷酸化蛋白質(zhì)組學(xué)研究案例：2021年12月30日復(fù)旦大學(xué)附屬中山醫(yī)院樊嘉院士、中國科學(xué)院上海藥物研究所周虎研究員、中國科學(xué)院分子細(xì)胞科學(xué)***創(chuàng)新中心高大明研究員、復(fù)旦大學(xué)附屬中山醫(yī)院**教授課題組合作在Cancer Cell上發(fā)表題為“Proteogenomic characterization identifies clinically relevant subgroups of intrahepatic cholangiocarcinoma”的研究論文，通過基因組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)、磷酸化蛋白質(zhì)組學(xué)、微生物組學(xué)研究方法對262例肝內(nèi)膽管*（iCCA）患者的配對**和*旁組織進(jìn)行了分析，通過繪制肝內(nèi)膽管*的多維分子圖譜為進(jìn)一步鑒定iCCA的分子發(fā)病機制、分子分型、預(yù)后等提供了寶貴的資源。蛋白質(zhì)組學(xué)質(zhì)譜分析蛋白質(zhì)組學(xué)三大基本技術(shù)。內(nèi)蒙古蛋白組學(xué) 數(shù)據(jù)分析

本文為中國科學(xué)院海岸帶研究所趙建民課題組在ScienceoftheTotalEnvironment期刊發(fā)表了的文章，通過iTRAQ標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組學(xué)研究弧菌***加劇了海洋酸化造成的牡蠣免疫抑制效應(yīng)。海洋酸化可能增加海洋軟體動物疾病加劇的風(fēng)險。從而將產(chǎn)生重大的經(jīng)濟和生態(tài)影響，因此本研究結(jié)果具有重要的指導(dǎo)意義。在本研究中，研究者將太平洋牡蠣暴露于酸化海水（約2000ppm）中28天，然后用金氏弧菌進(jìn)行***處理，以此研究海洋酸化是否會影響牡蠣對病原菌***的免疫反應(yīng)。此外，利用基于iTRAQ的定量蛋白質(zhì)組學(xué)方法，對牡蠣鰓這一潛在的造血部位進(jìn)行了研究，以分析對OA和金氏弧菌共同作用較敏感的生理過程。內(nèi)蒙古蛋白組學(xué) 數(shù)據(jù)分析歐易鹿明生物蛋白質(zhì)研究技術(shù)。

iTRAQ標(biāo)記定量蛋白組學(xué)研究方法：2021年4月，南京林業(yè)大學(xué)喻方圓教授（一作：吳岐奎）課題組在JournaloftheScienceofFoodandAgriculture期刊發(fā)表了題為“ProteomicanalysisofmetabolicmechanismsassociatedwithfattyacidbiosynthesisduringStyraxtonkinensiskerneldevelopment”的研究成果，通過轉(zhuǎn)錄組學(xué)+iTRAQ標(biāo)記定量蛋白組學(xué)研究方法，分析東京野茉莉種子發(fā)育過程中脂肪酸生物合成相關(guān)基因的表達(dá)趨勢，確定油脂積累的主要影響因子并構(gòu)建其調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。為野茉莉?qū)僦参锓N子油用研究和后續(xù)功能分析研究提供了一定的研究基礎(chǔ)。

轉(zhuǎn)錄組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)分析作者通過轉(zhuǎn)錄組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)分析暴露于DON的C2C12細(xì)胞的差異基因（DEG）。轉(zhuǎn)錄組學(xué)鑒定了2387個DEG，其中72%被下調(diào)。蛋白質(zhì)組學(xué)鑒定出402個DEG，其中74%被下調(diào)。GO和KEGG通路富集分析表明，轉(zhuǎn)錄組學(xué)DEGs參與了“男性主要性征的發(fā)育”、“骨骼肌肌球蛋白粗絲組裝”和“骨骼肌收縮的調(diào)節(jié)”等生物學(xué)過程。**富集的通路是“ECM-受體相互作用”、“人**瘤病毒***”和“蛋白質(zhì)消化吸收”。蛋白質(zhì)組學(xué)分析中，富集到了“肌肉收縮”、“中間絲解聚”和“脂質(zhì)轉(zhuǎn)運”等生物學(xué)過程。細(xì)胞成分中富集到“細(xì)胞骨架”、“細(xì)胞外基質(zhì)”和“整合素”。KEGG通路富集到“新霉素、卡那霉素和慶大霉素生物合成”、“系統(tǒng)性紅斑狼瘡”、“ECM-受體相互作用”和“蛋白質(zhì)消化和吸收”。前兩條通路與上調(diào)的DEG相關(guān)，而后兩條通路與下調(diào)的DEG相關(guān)，這與轉(zhuǎn)錄組學(xué)結(jié)果一致。蛋白質(zhì)組學(xué)多組學(xué)分析蛋白質(zhì)組學(xué)研究進(jìn)展。

iTRAQ標(biāo)記蛋白組學(xué)研究方法：2021年12月歐易/鹿明生物合作客戶甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué)孫萬倉教授課題組在Scientific Reports期刊發(fā)表的題為 “iTRAQ-Based Quantitative Proteome Analysis Insights into Cold Stress of Winter Turnip Rapa (Brassica rapa L.) Grown in the Field ”的研究成果，通過iTRAQ標(biāo)記蛋白組學(xué)+轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究方法，探究了莖尖分生組織的形態(tài)對冬油菜低溫耐受性中的作用。中文標(biāo)題：iTRAQ標(biāo)記蛋白質(zhì)組學(xué)分析揭示了低溫脅迫對田間生長冬油菜的影響研究對象：白菜型冬油菜發(fā)表期刊：ScientificReports影響因子：4.17蛋白組學(xué)技術(shù)對腎錯構(gòu)瘤尿液差異蛋白的研究。江西蛋白組學(xué)服務(wù)

歐易鹿明生物基于質(zhì)譜技術(shù),生物信息學(xué)方法,提供蛋白質(zhì)組學(xué)。內(nèi)蒙古蛋白組學(xué) 數(shù)據(jù)分析

作者通過iTRAQ蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)鑒定敲低NMT1后發(fā)生變化的蛋白質(zhì)。結(jié)果鑒定到三種上調(diào)蛋白(LXN,RPL29andFAU)和六種下調(diào)蛋白（NMT1,MTPN,AHSG,ALB,GON7andTF）（圖2A）。作者將這些蛋白質(zhì)分別命名為N-豆蔻酰化下調(diào)蛋白(NDP)和上調(diào)蛋白(NUP)。有趣的是，敲低NMT1會減少NDP和NUP的N-豆蔻?；?，而過表達(dá)NMT1會誘導(dǎo)NDP和NUP的N-豆蔻?；▓D2B）。在小鼠模型中，敲除NMT1會導(dǎo)致NDP和NUP的去N-豆蔻?；?，這可以通過在肝臟中表達(dá)外源性NMT1來部分逆轉(zhuǎn)（圖2C）。這些發(fā)現(xiàn)表明，盡管NMT1對NDP和NUP的表達(dá)起著相反的作用，但NMT1同時刺激NDP和NUP的N-豆蔻?；?。內(nèi)蒙古蛋白組學(xué) 數(shù)據(jù)分析

上海歐易生物醫(yī)學(xué)科技有限公司是一家從事科研服務(wù)，科研檢測，學(xué)術(shù)研究，技術(shù)咨詢研發(fā)、生產(chǎn)、銷售及售后的服務(wù)型企業(yè)。公司坐落在聯(lián)航路1188號25幢，成立于2009-03-10。公司通過創(chuàng)新型可持續(xù)發(fā)展為重心理念，以客戶滿意為重要標(biāo)準(zhǔn)。主要經(jīng)營科研服務(wù)，科研檢測，學(xué)術(shù)研究，技術(shù)咨詢等產(chǎn)品服務(wù)，現(xiàn)在公司擁有一支經(jīng)驗豐富的研發(fā)設(shè)計團(tuán)隊，對于產(chǎn)品研發(fā)和生產(chǎn)要求極為嚴(yán)格，完全按照行業(yè)標(biāo)準(zhǔn)研發(fā)和生產(chǎn)。上海歐易生物醫(yī)學(xué)科技有限公司每年將部分收入投入到科研服務(wù)，科研檢測，學(xué)術(shù)研究，技術(shù)咨詢產(chǎn)品開發(fā)工作中，也為公司的技術(shù)創(chuàng)新和人材培養(yǎng)起到了很好的推動作用。公司在長期的生產(chǎn)運營中形成了一套完善的科技激勵政策，以激勵在技術(shù)研發(fā)、產(chǎn)品改進(jìn)等。上海歐易生物醫(yī)學(xué)科技有限公司注重以人為本、團(tuán)隊合作的企業(yè)文化，通過保證科研服務(wù)，科研檢測，學(xué)術(shù)研究，技術(shù)咨詢產(chǎn)品質(zhì)量合格，以誠信經(jīng)營、用戶至上、價格合理來服務(wù)客戶。建立一切以客戶需求為前提的工作目標(biāo)，真誠歡迎新老客戶前來洽談業(yè)務(wù)。