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山東蛋白組學(xué)結(jié)果怎么分析

來(lái)源: 發(fā)布時(shí)間:2022-11-10

蛋白組學(xué)技術(shù)是以蛋白質(zhì)組為研究對(duì)象,研究細(xì)胞、組織或生物體蛋白質(zhì)組成及其變化規(guī)律的科學(xué)。DIA作為一種新的質(zhì)譜數(shù)據(jù)采集方式穩(wěn)定性高,覆蓋度廣的優(yōu)點(diǎn)。DIA蛋白組學(xué)技術(shù)已經(jīng)越來(lái)越多的疾病研究中發(fā)揮重大作用。本研究通過(guò)DIA蛋白組學(xué)技術(shù)分析了8個(gè)SAPHO病人和8個(gè)健康人的蛋白表達(dá)譜。蛋白表達(dá)的相關(guān)性圖顯示組內(nèi)相關(guān)性良好,差異蛋白的PCA圖顯示兩組得到明顯的區(qū)分。蛋白質(zhì)組學(xué)通過(guò)研究生物樣本中蛋白質(zhì)組成和變化,從而推動(dòng)疾病的病理機(jī)制研究,為臨床診斷和預(yù)后提供潛在生物標(biāo)志物。蛋白質(zhì)組學(xué)測(cè)序 蛋白組學(xué)技術(shù)缺點(diǎn)。山東蛋白組學(xué)結(jié)果怎么分析

iTRAQ標(biāo)記蛋白組學(xué)研究方法:2021年12月歐易/鹿明生物合作客戶甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué)孫萬(wàn)倉(cāng)教授課題組在Scientific Reports期刊發(fā)表的題為 “iTRAQ-Based Quantitative Proteome Analysis Insights into Cold Stress of Winter Turnip Rapa (Brassica rapa L.) Grown in the Field ”的研究成果,通過(guò)iTRAQ標(biāo)記蛋白組學(xué)+轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究方法,探究了莖尖分生組織的形態(tài)對(duì)冬油菜低溫耐受性中的作用。中文標(biāo)題:iTRAQ標(biāo)記蛋白質(zhì)組學(xué)分析揭示了低溫脅迫對(duì)田間生長(zhǎng)冬油菜的影響研究對(duì)象:白菜型冬油菜發(fā)表期刊:ScientificReports影響因子:4.17福建蛋白組學(xué) 數(shù)據(jù)分析蛋白組學(xué)翻譯后修飾篩選,檢測(cè),鑒定,定性,定量。

作者運(yùn)用iTRAQ標(biāo)記定量蛋白組學(xué)對(duì)種子發(fā)育過(guò)程中蛋白質(zhì)表達(dá)的定量比較,同時(shí)進(jìn)行GO和KEGG通路富集分析。結(jié)果表明所有鑒定的蛋白被分為29類,主要涉及翻譯和碳水化合物代謝。并且作者繪制了p值小于0.01的前20條KEGG通路的氣泡圖。在三對(duì)比較中,普遍富集的途徑包括脂肪酸降解、苯丙素生物合成和脂肪酸代謝。其中,參與α-亞麻酸代謝的DAPs在S3 vs. S1組和S4 vs. S1組中都非?;钴S。為了評(píng)估轉(zhuǎn)錄組和蛋白質(zhì)組之間的一致性,以及了解轉(zhuǎn)錄后的mRNA在蛋白質(zhì)水平上是如何表現(xiàn)的,作者進(jìn)行了RNA-seq和iTRAQ分析的聯(lián)合分析。證明DEGs和DAPs參與類黃酮的生物合成和脂肪酸代謝。

蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)分析鑒定出了幾種參與肝葡萄糖脂代謝的蛋白質(zhì)(ACC、FASN、SCD1、CPT1A、GLUT2、GK、GS、G6Pase、PEPCK)。此外,AC顯示出抑制脂肪生成酶(ACC,F(xiàn)ASN和SCD1)表達(dá)的趨勢(shì),同時(shí)***上調(diào)了GLUT2。與對(duì)照組相比,AC***增加了PEPCK的表達(dá),兩種化學(xué)物質(zhì)對(duì)G6Pase均無(wú)***影響(圖4A)。PRM蛋白靶向驗(yàn)證測(cè)定結(jié)果與蛋白質(zhì)組變化相一致,這進(jìn)一步證實(shí)了蛋白質(zhì)組學(xué)數(shù)據(jù)中蛋白質(zhì)的表達(dá)(圖4B)。轉(zhuǎn)錄組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)聯(lián)合分析結(jié)果顯示AC和AL***改善了線粒體功能。GSEA分析顯示,處理組的氧化磷酸化(OXPHOS)通路***上調(diào),AC組和AL組的富集得分分別為0.826和0.535。修飾蛋白質(zhì)組試-蛋白質(zhì)組學(xué) 解決方案。

蛋白質(zhì)組學(xué)、磷酸化蛋白質(zhì)組學(xué)研究案例:2021年12月30日復(fù)旦大學(xué)附屬中山醫(yī)院樊嘉院士、中國(guó)科學(xué)院上海藥物研究所周虎研究員、中國(guó)科學(xué)院分子細(xì)胞科學(xué)***創(chuàng)新中心高大明研究員、復(fù)旦大學(xué)附屬中山醫(yī)院**教授課題組合作在Cancer Cell上發(fā)表題為“Proteogenomic characterization identifies clinically relevant subgroups of intrahepatic cholangiocarcinoma”的研究論文,通過(guò)基因組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)、磷酸化蛋白質(zhì)組學(xué)、微生物組學(xué)研究方法對(duì)262例肝內(nèi)膽管*(iCCA)患者的配對(duì)**和*旁組織進(jìn)行了分析,通過(guò)繪制肝內(nèi)膽管*的多維分子圖譜為進(jìn)一步鑒定iCCA的分子發(fā)病機(jī)制、分子分型、預(yù)后等提供了寶貴的資源。蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)簡(jiǎn)介及應(yīng)用場(chǎng)景。天津蛋白組學(xué) 公司

蛋白組學(xué)研究必看的經(jīng)典綜述。山東蛋白組學(xué)結(jié)果怎么分析

蛋白質(zhì)組學(xué)研究方法研究案例:2021年10月,中國(guó)科學(xué)院上海營(yíng)養(yǎng)與健康研究所武愛(ài)波研究員課題組在Ecotoxicology and Environmental Safety發(fā)表了題為“Mycotoxin deoxynivalenol affects myoblast differentiation via downregulating cytoskeleton and ECM-integrin-FAK-RAC-PAK signaling pathway"的研究成果,通過(guò)轉(zhuǎn)錄組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)研究方法,探究了脫氧雪腐鐮刀菌烯醇(DON)對(duì)成肌細(xì)胞分化的影響,發(fā)現(xiàn)了DON處理使得細(xì)胞骨架蛋白和細(xì)胞外基質(zhì)蛋白表達(dá)下調(diào),并抑制ECM-integrin-FAK-RAC-PAK信號(hào)通路的機(jī)理,為食品和飼料污染的防治提供了理論依據(jù)。山東蛋白組學(xué)結(jié)果怎么分析

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