當前的技術主要有四種策略：1、基于組學實驗結合空間重建的計算策略。這種計算方法可以充分利用內在基因表達模式或共表達的趨勢，從單個細胞的大量轉錄組數(shù)據(jù)中重構細胞間的環(huán)境。然而，這些推論方法在某些情況下*呈現(xiàn)空間趨勢或特定組織的總體布局。2、激光切割與NGS測序結合的策略?；贚CM的轉錄組學或基因組學成功地獲得了單個細胞的空間轉錄組，盡管其通量很低，但是在可以標記成千上萬個單個細胞位置的多路復用條形碼策略可行之前，將少量細胞的數(shù)據(jù)粗略地整合到構成***的巨大背景中，可能具有一定價值。3、基于熒光物質原位的轉錄組學。基于圖像的原位轉錄組學在很大程度上增加了可檢測區(qū)域，但也存在一些問題，例如幾種smFISH方法很難從包括信號干擾、轉錄本積累等復雜背景中提取單個細胞。4、基于寡核苷酸的空間條碼加上NGS測序。費用較高且無法在單個細胞中獲得轉錄組。空間轉錄組測序技術在進行 HE 染色的同時需要保證獲取組織基因表達信息。江蘇發(fā)展空間轉錄組

10x Genomics空間轉錄組技術的準確性高嗎？下圖是一個將10x Genomics空間轉錄組技術應用于小鼠海馬體研究的案例。A圖為腦組織切片的HE染色結果，從10x Genomics空間轉錄組分析結果中，可以清晰看到Tmsb4x（B圖）和Selenow（C圖）在海馬體區(qū)域高表達，和已知的研究結果一致性較高。開展10x Genomics空間轉錄組需要做哪些準備？空間轉錄組是一項十分前沿的技術，涉及到很多細節(jié)方面的準備工作，例如組織類型的選擇、前期預實驗的設計、病理區(qū)域的確認等一系列內容。而且實驗中存在很多不確定性因素，處理不慎容易導致整個項目失敗。安徽什么是空間轉錄組空間轉錄組測序結果為未來人類心臟發(fā)育的研究提供重要的借鑒意義。

空間轉錄組數(shù)據(jù)分析的是根據(jù)每個芯片上每個 spot 的基因表達信息進行聚類，然后將 spot 根據(jù)坐標位置序列放回到組織的圖像上，同時可以對每個 gene 在組織上表達的空間位置進行定位。獲得測序數(shù)據(jù)后，首先利用 Space Ranger  軟件可以自動化的對圖像進行處理、數(shù)據(jù)比對和 Barcode 處理。另外一個軟件 Loupe Cell Browser 是一個適用于 Windows 和 MacOS 的桌面應用程序，它可以快速、輕松地可視化和分析10X Visium 數(shù)據(jù)。歐易生物具有上百例空間轉錄組項目執(zhí)行經(jīng)驗，致力通過質量的服務，助力各位科研工作者取得新的突破。

什么是空間轉錄組？空間轉錄組是一種用于從空間層面上解析RNA-seq數(shù)據(jù)的技術，從而解析單個組織切片中的所有mRNA?？臻g條形碼逆轉錄oligo(dT)引物在顯微鏡載玻片表面的有序附著，使得在mRNA樣品處理和后續(xù)測序過程中位置信息的編碼和獲取成為可能。單細胞RNA測序或組織樣本RNA測序，均無法為研究人員提供精確的空間信息。通過空間轉錄組技術可獲取組織中具體的位置的轉錄信息，為研究和診斷提供有效數(shù)據(jù)支撐。歐易生物具有上百例空間轉錄組項目執(zhí)行經(jīng)驗，致力通過質量的服務，助力各位科研工作者取得新的突破?？臻g轉錄組是一項前沿技術，涉及到很多細節(jié)方面的準備工作。

10x Genomics空間轉錄組的實現(xiàn)原理是什么？10x Genomics空間轉錄組用于文庫構建的每張載玻片上有四個捕獲區(qū)域，每個捕獲區(qū)域的大小為6.5x6.5mm，包含5000個被條形碼標記的點（barcoded spots），每個點的直徑為55 μm，點和點之間中心的距離為100 μm，并且每個點都有一個barcode序列。組織切片的細胞中會釋放出mRNA，遷移到每個spot的mRNA會被標記上相應的barcode序列，然后進行文庫構建并進行測序。根據(jù)數(shù)據(jù)的條形碼信息對數(shù)據(jù)進行分析，以確定哪些數(shù)據(jù)來自哪個位置，從而實現(xiàn)空間基因表達的可視化。 空間轉錄組使得在mRNA樣品處理和后續(xù)測序過程中位置信息的編碼和獲取成為可能。安徽什么是空間轉錄組

除大腦以外的其他***的技術現(xiàn)代化，將為開發(fā)有用的空間轉錄組學地圖集提供廣闊的前景。江蘇發(fā)展空間轉錄組

本文利用空間轉錄組學研究了在AD小鼠模型中，淀粉樣斑塊周圍直徑為100mm的組織域中發(fā)生的轉錄變化。發(fā)現(xiàn)了富含髓鞘和少突膠質細胞基因（OLIGs）的基因共表達網(wǎng)絡的早期改變，而斑塊誘導的基因（PIGs）的多細胞基因共表達網(wǎng)絡涉及補體系統(tǒng)、氧化應激、溶酶體和炎癥，在疾病的后期非常突出。此外作者通過對小鼠和人腦切片進行原位測序（ISS），證實了大多數(shù)觀察到的細胞水平的變化?？臻g轉錄組學分析為探究AD和其他腦部疾病致病特征附近失調的細胞網(wǎng)絡提供了可能。江蘇發(fā)展空間轉錄組

上海歐易生物醫(yī)學科技有限公司位于聯(lián)航路1188號25幢，是一家專業(yè)的檢驗檢測服務。（依法須經(jīng)批準的項目，經(jīng)相關部門批準后方可開展經(jīng)營活動，具體經(jīng)營項目以相關部門批準文件或許可證件為準）一般項目：生物醫(yī)藥產(chǎn)品、生化產(chǎn)品的研發(fā)，醫(yī)藥中間體、化工原料及產(chǎn)品（除危險品化學品、監(jiān)控化學品、易制毒化學品）的研發(fā)、銷售，儀器儀表的銷售，并提供相關技術咨詢、技術服務，會務服務，企業(yè)管理咨詢。公司。在歐易生物近多年發(fā)展歷史，公司旗下現(xiàn)有品牌歐易生物等。公司不僅*提供專業(yè)的檢驗檢測服務。（依法須經(jīng)批準的項目，經(jīng)相關部門批準后方可開展經(jīng)營活動，具體經(jīng)營項目以相關部門批準文件或許可證件為準）一般項目：生物醫(yī)藥產(chǎn)品、生化產(chǎn)品的研發(fā)，醫(yī)藥中間體、化工原料及產(chǎn)品（除危險品化學品、監(jiān)控化學品、易制毒化學品）的研發(fā)、銷售，儀器儀表的銷售，并提供相關技術咨詢、技術服務，會務服務，企業(yè)管理咨詢。，同時還建立了完善的售后服務體系，為客戶提供良好的產(chǎn)品和服務。誠實、守信是對企業(yè)的經(jīng)營要求，也是我們做人的基本準則。公司致力于打造***的科研服務，科研檢測，學術研究，技術咨詢。