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RNA測序公司

來源: 發(fā)布時(shí)間:2022-06-03

空間轉(zhuǎn)錄組測序與單細(xì)胞測序的結(jié)果不同,這里存在一個(gè)概念叫做Number of Spots under tissue,即,空間轉(zhuǎn)錄組片子上組織覆蓋的有效的spot位點(diǎn)。這個(gè)有效Spot的篩選標(biāo)準(zhǔn)是有UMI以及有序列表達(dá)。那么這個(gè)時(shí)候,貼片的質(zhì)量就成為了制約空間轉(zhuǎn)錄組有效區(qū)域的要點(diǎn)了。如果組織沒有很好地覆蓋到空轉(zhuǎn)片上,那么容易出現(xiàn)雖然有HE染色有組織片子,但是沒有基因表達(dá),即無有效Spot位點(diǎn)。同樣的,另一個(gè)就是組織切片的大小,也就是說組織切片在整個(gè)玻片的覆蓋面積越小,分析的有效區(qū)域就越少。這兩者基本上決定了整個(gè)空間轉(zhuǎn)錄組分析結(jié)果的基礎(chǔ)質(zhì)量。深度的單細(xì)胞測序數(shù)據(jù)解讀助力生物健康醫(yī)療時(shí)代。RNA測序公司

基于10X Next GEM技術(shù),單細(xì)胞免疫組庫測序一次實(shí)驗(yàn)可以同時(shí)檢測近萬個(gè)細(xì)胞,可在一個(gè)樣本中同時(shí)獲5'端mRNA表達(dá)譜、TCR和BCR的信息,結(jié)合基因的表達(dá)譜和V(D)J數(shù)據(jù)進(jìn)行復(fù)雜組織樣本的是影響免疫應(yīng)答分析,監(jiān)測免疫療法的效果,研究疾病發(fā)生、發(fā)展的分子機(jī)制。 烈冰單細(xì)胞免疫組庫平臺具備:1000+ TCR/BCR項(xiàng)目經(jīng)驗(yàn),一次實(shí)驗(yàn)可同時(shí)獲取1000-20000個(gè)細(xì)胞的文庫構(gòu)建,獲得轉(zhuǎn)錄組和免疫組數(shù)據(jù); 具備完善的免疫組庫測序和實(shí)驗(yàn)質(zhì)控流程,獲取V(D)J全長序列的配對信息;豐富的免疫組庫測序和數(shù)據(jù)分析經(jīng)驗(yàn),實(shí)現(xiàn)專屬個(gè)性化數(shù)據(jù)分析服務(wù),搭配單細(xì)胞分析云平臺,一鍵導(dǎo)出交互性的動(dòng)態(tài)結(jié)果報(bào)告。上海10X單細(xì)胞測序高通量測序技術(shù)是對傳統(tǒng)測序一次翻天覆地的改變,一次對幾十萬到幾百萬條核酸序列進(jìn)行測定。

針對單細(xì)胞測序的細(xì)胞數(shù)量判斷環(huán)節(jié):主要是對細(xì)胞數(shù)量、基因表達(dá)量、測序質(zhì)量進(jìn)行整體描述。過濾標(biāo)準(zhǔn):由于細(xì)胞破碎后游離RNA會(huì)釋放到環(huán)境或孔中,并且測序中也會(huì)存在一些死細(xì)胞,導(dǎo)致數(shù)據(jù)存在background值。因此,我們需要設(shè)定一定的標(biāo)準(zhǔn)來過濾掉假細(xì)胞或死細(xì)胞。以10× Genomics為例,細(xì)胞數(shù)量判斷主要通過分析UMI Counts-Barcode曲線斜率拐點(diǎn),當(dāng)存在多個(gè)斜率拐點(diǎn)的時(shí)候,結(jié)合預(yù)期UMI=500時(shí)的細(xì)胞數(shù)量進(jìn)行過濾。當(dāng)斜率拐點(diǎn)低于UMI=500的時(shí)候,選擇UMI=500作為細(xì)胞的判斷的標(biāo)準(zhǔn);否則,選擇和預(yù)期細(xì)胞數(shù)量非常接近的拐點(diǎn)作為細(xì)胞判斷的位置。這樣我們能夠有效獲得真實(shí)的并且在基因數(shù)量上可以分析的數(shù)據(jù)。

同恒檢測可以實(shí)現(xiàn)方法開發(fā)驗(yàn)證、配方成分檢測、元素分析測定、綜合解決方案、結(jié)構(gòu)分析確證、指定成分分析、腐蝕分析、模擬實(shí)驗(yàn)、未知物成分分析、異物分析工業(yè)診斷、含量檢測測定等服務(wù)項(xiàng)目,業(yè)務(wù)范圍不僅涵蓋了傳統(tǒng)的日化、消費(fèi)品、金屬、材料、保健食品、農(nóng)藥、紡織、涂料、醫(yī)療;還包含了現(xiàn)代熱點(diǎn)的5G通訊、人工智能、新能源產(chǎn)業(yè);從精密的半導(dǎo)體芯片、生物制藥、細(xì)菌病毒到宏觀的橋梁建筑、航天工業(yè)、工業(yè)生產(chǎn),同恒檢測始終堅(jiān)持為您提供精益求精的服務(wù)。從樣本處理到終端數(shù)據(jù)分析,只要您需要,烈冰提供全流程的無憂服務(wù)。

RNA測序(RNA-seq)是轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究的重要工具,也是生命科學(xué)領(lǐng)域常用的技術(shù)之一。相比于傳統(tǒng)通路研究低維度、低通量的局限性,轉(zhuǎn)錄組學(xué)有以下優(yōu)勢:1)能夠動(dòng)態(tài)考察細(xì)胞基因組的表達(dá),多維度地反映差異變化;2)可用于研究占RNA絕大部分的非編碼RNA,研究其結(jié)構(gòu)以及在細(xì)胞生命活動(dòng)中的重要調(diào)控作用;3)與蛋白組學(xué)研究相互補(bǔ)充,多角度呈現(xiàn)細(xì)胞水平的變化信息。作為轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究的技術(shù)基礎(chǔ),RNA測序技術(shù)也在不斷地更新迭代,現(xiàn)如今更大通量、更深精度的測序?yàn)楸姸嗫蒲泻歪t(yī)學(xué)工作者提供了豐富的工具和探索真理的手段。單細(xì)胞測序數(shù)據(jù)分析,認(rèn)準(zhǔn)烈冰NovelBrain生物信息數(shù)據(jù)分析平臺。武漢單細(xì)胞細(xì)胞核測序平臺

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烈冰與國內(nèi)高校、研究所、醫(yī)院和藥企單位開展深度合作,服務(wù)于600+臨床與研究機(jī)構(gòu),1000+客戶和5000+重要科研項(xiàng)目,助力并聯(lián)合發(fā)表300+篇CNS等國際學(xué)術(shù)期刊(不完全統(tǒng)計(jì)),在單細(xì)胞領(lǐng)域,烈冰助力用戶發(fā)表單細(xì)胞文獻(xiàn)30+篇,總IF>300+,IF>10+以上文章占比65%以上,包含Immunity、Nature Cell Biology、Nature Plants 、Advanced Science等生物領(lǐng)域國際主流學(xué)術(shù)期刊,已發(fā)表文章研究領(lǐng)域涵蓋包括COVID-19研究、疾病發(fā)生轉(zhuǎn)移機(jī)制,免疫研究、腦神經(jīng)、白血病、胚胎發(fā)育、糖尿病、退行性疾病和植物領(lǐng)域研究等。RNA測序公司

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