烈冰科技作為國內(nèi)率先同時擁有10X Genomics和BD Rhapsody雙分選平臺的測序服務(wù)商及云計算服務(wù)供應(yīng)商,經(jīng)過多年實戰(zhàn),擁有豐富的單細(xì)胞懸液制備和分選經(jīng)驗,實測BD Rhapsody對能夠高效捕獲粒細(xì)胞。針對不同的分選平臺、建庫方法,實戰(zhàn)總結(jié)搭建出不同的數(shù)據(jù)預(yù)處理工作流程;烈冰科技NovelBrain?生物大數(shù)據(jù)平臺能有效支撐生命科學(xué)研究、醫(yī)療健康等領(lǐng)域?qū)Υ髷?shù)據(jù)分析的需求。高通量測序?qū)嶒炂脚_,包括NovaSeq 6000、10X Chromium X、BD FACSMelody、PANNORAMIC數(shù)字切片掃描儀等,配合一支來自海內(nèi)外名校、多學(xué)科交叉型的高素質(zhì)綜合團隊,為您的科學(xué)研究保駕護航。截至2021年10月,烈冰助力發(fā)表單細(xì)胞測序文章近20篇。單細(xì)胞測序服務(wù)公司
烈冰科技自主研發(fā)的單細(xì)胞云平臺致力于幫助每一位客戶定制化分析數(shù)據(jù),深度解讀數(shù)據(jù)分析結(jié)果,深入挖掘其背后的生物學(xué)意義;從操作便捷、結(jié)果可視化、分析可追溯、系統(tǒng)穩(wěn)定等方面助力單細(xì)胞研究,加速科研進程!此外,烈冰生信團隊根據(jù)豐富的實戰(zhàn)經(jīng)驗為用戶量身打造了一款單細(xì)胞測序結(jié)果解讀的神兵利器——單細(xì)胞瀏覽器(Single Cell Browser),不但可以將海量復(fù)雜的結(jié)果文件可視化,還是可以實現(xiàn)三維立體化展示的軟件。專業(yè)的生信代碼交給專業(yè)的烈冰,專業(yè)的生物學(xué)意義交給專業(yè)的您,詳情請咨詢烈冰生物。重慶二代測序單細(xì)胞測序服務(wù)全線搭建10X Genomics Chromium Controller單細(xì)胞測序平臺。
針對單細(xì)胞測序的細(xì)胞上樣數(shù),為什么不建議捕獲到的細(xì)胞數(shù)量越高越好?一味地追求高數(shù)量的細(xì)胞捕獲可能會存在一些問題。例如在上機細(xì)胞懸液濃度固定時,如果目標(biāo)細(xì)胞捕獲數(shù)增加到8000甚至10000,上樣細(xì)胞懸液體積勢必增加,在細(xì)胞懸液質(zhì)量不是很理想(細(xì)胞活性<90%、碎片率>5%、結(jié)團率均>5%)的情況下,引入的背景信號會增加,分析結(jié)果不理想的直接體現(xiàn)包括:cell、non-cell無法有效區(qū)分和Fraction reads in cells偏低。當(dāng)cell和non-cell無法有效區(qū)分時,會使得數(shù)據(jù)出現(xiàn)假陽性和假陰性結(jié)果!當(dāng)目標(biāo)細(xì)胞捕獲數(shù)很大時,多細(xì)胞率會增加,數(shù)據(jù)分析時,此部分“cell”表現(xiàn)為基因檢測數(shù)和UMI檢測數(shù)是正常cell的N倍(N是一個GEM包裹的細(xì)胞數(shù)),導(dǎo)致所有細(xì)胞的統(tǒng)計數(shù)據(jù)(單個細(xì)胞基因檢測中位數(shù)、單個細(xì)胞UMI檢測中位數(shù))虛高。此部分“cell”雖然可以通過設(shè)置數(shù)據(jù)分析閾值進行過濾,但是容易會有此類數(shù)據(jù)的殘留和正常高基因檢測細(xì)胞的人為去除!
作為單細(xì)胞測序的一個重要里程碑,10x genomic公司于2016年2月推出10x Chromium Single Cell Gene Expression Solution,此平臺整合了儀器、試劑盒和信息學(xué)軟件,能精確對接illumina測序儀,因此可實現(xiàn)大量大細(xì)胞的快速高效標(biāo)記、測序和分析,獲得單細(xì)胞水平的基因表達譜和差異情況,并通過對復(fù)雜細(xì)胞群體進行深入細(xì)致分析,繪制大規(guī)模單細(xì)胞表達圖譜。 以量化細(xì)胞內(nèi)的群體異質(zhì)性,并逐個鑒定細(xì)胞類型、細(xì)胞狀態(tài)和動態(tài)細(xì)胞躍遷。除了有望鑒定新的細(xì)胞亞型和稀有細(xì)胞群體,單細(xì)胞技術(shù)還能更好地了解轉(zhuǎn)錄動態(tài)和基因調(diào)控關(guān)系。烈冰測序服務(wù)已助力300余篇國際期刊研究文章發(fā)表。
Single Cell Sequencing技術(shù),即利用優(yōu)化后的高通量測序技術(shù)(NGS,Next Generation Sequencing)分析每一個單個細(xì)胞的序列信息,從而更高分辨率地揭示細(xì)胞間的細(xì)胞差異以及其在微環(huán)境中的功能情況。那么問題來了,如何獲得單個細(xì)胞?如果無法獲得單個細(xì)胞這一切都是不成立的;如何獲得大批量的單個細(xì)胞?單個組織細(xì)胞群體通常在百萬級別以上,如果被檢測的測序細(xì)胞數(shù)量過小精確度不足;如何低成本地獲得大批量單個細(xì)胞?單細(xì)胞測序成本非常高,尤其是需要測2000~3000個以上的細(xì)胞的時候,如果單個細(xì)胞的分選成本也很高,技術(shù)根本無法普及。所以,正因為這些問題的存在使得高通量測序在單個細(xì)胞測序應(yīng)用中的普及度一直不足,直到幾個突破性技術(shù)的誕生。附加流式分選細(xì)胞表面Marker,對于較低分辨率的標(biāo)志物也能有效鑒定,助力高要求測序項目。北京二代測序單細(xì)胞測序技術(shù)支持
烈冰專精單細(xì)胞多組學(xué)測序領(lǐng)域。單細(xì)胞測序服務(wù)公司
基因和基因產(chǎn)物并不是單獨運作的,而是參與了相互關(guān)聯(lián)的復(fù)雜通路、網(wǎng)絡(luò)和分子系統(tǒng),這些合在一起實現(xiàn)了細(xì)胞、組織和生物體的運作。定義這些系統(tǒng)并確定它們的特征和相互作用,對于了解生物系統(tǒng)如何運作至關(guān)重要?!睘榱送苿涌茖W(xué)發(fā)現(xiàn),科學(xué)家們需要各種能夠幫助多方位了解其樣本的潛在生物復(fù)雜性的研究工具。對于越來越多的研究人員來說,單細(xì)胞RNA測序和單細(xì)胞多組學(xué)——即在單細(xì)胞分辨率下對基因表達及其他基于DNA、RNA或蛋白質(zhì)的分析物進行定量分析的基因組方法——在幫助解決他們面臨的生物學(xué)問題上已證實是行之有效的。單細(xì)胞測序服務(wù)公司
上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司位于江月路999號奇亞特中心22幢。烈冰生物致力于為客戶提供良好的單細(xì)胞測序,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺,空間轉(zhuǎn)錄組測序,單細(xì)胞多組學(xué)測序,一切以用戶需求為中心,深受廣大客戶的歡迎。公司注重以質(zhì)量為中心,以服務(wù)為理念,秉持誠信為本的理念,打造醫(yī)藥健康良好品牌。烈冰生物秉承“客戶為尊、服務(wù)為榮、創(chuàng)意為先、技術(shù)為實”的經(jīng)營理念,全力打造公司的重點競爭力。