什么時(shí)候要用到去死細(xì)胞的操作呢?跟進(jìn)烈冰生物多年單細(xì)胞測(cè)序服務(wù)經(jīng)驗(yàn)來(lái)看,當(dāng)細(xì)胞懸液進(jìn)行質(zhì)量和活性檢測(cè)后,考慮對(duì)細(xì)胞活性在50%-70%的懸液進(jìn)行去除死細(xì)胞的操作。而太低活性的懸液(小于30%),懸液中細(xì)胞大量死亡,可能已經(jīng)丟失了原組織內(nèi)的細(xì)胞比例和狀態(tài),失真嚴(yán)重,建議重新收集樣本進(jìn)行新的實(shí)驗(yàn),保證數(shù)據(jù)的高質(zhì)量和實(shí)驗(yàn)結(jié)果的準(zhǔn)確性。但需要注意到,去除死細(xì)胞的操作會(huì)損失一定的細(xì)胞數(shù)量,因此希望您在提供樣本時(shí),盡可能提供足量的細(xì)胞,以備實(shí)驗(yàn)過(guò)程中可能存在的細(xì)胞死亡的問(wèn)題,BD Rhapsody單細(xì)胞捕獲平臺(tái)對(duì)樣本起始細(xì)胞量的要求較低,一般提供10萬(wàn)個(gè)細(xì)胞以上均可滿足需求,特殊樣本可詳細(xì)咨詢烈冰生物。單細(xì)胞測(cè)序因其強(qiáng)大的探究疾病--細(xì)胞--基因的關(guān)系,一度成為高通量測(cè)序技術(shù)的“天花板”。江蘇BD單細(xì)胞服務(wù)機(jī)構(gòu)
單細(xì)胞測(cè)序龐大的數(shù)據(jù)烈冰生信團(tuán)隊(duì)傾情研發(fā)的NovelBrain?生信大數(shù)據(jù)分析平臺(tái),可實(shí)現(xiàn)零代碼操作、簡(jiǎn)單方便:?jiǎn)渭?xì)胞瀏覽器的操作簡(jiǎn)單,不需要命令行操作。簡(jiǎn)單拖拽、設(shè)置參數(shù)即可運(yùn)行,即使生信0基礎(chǔ)用戶也可以運(yùn)用自如;可視化展示海量結(jié)果文件:可視化展示Cluster的基因數(shù),UMI數(shù)量、線粒體RNA占比信息;以及不同Cluster對(duì)應(yīng)的細(xì)胞數(shù)量、基因表達(dá)量、RNA表達(dá)量、樣本細(xì)胞分布、線粒體RNA表達(dá)量等;3D立體展示,文章動(dòng)圖先人一步:?jiǎn)渭?xì)胞瀏覽器針對(duì)t-SNE圖、UMAP圖和pseudotime結(jié)果進(jìn)行三維立體展示,更加直觀立體的觀察細(xì)胞分布和聚類情況。深圳BD VDJ單細(xì)胞測(cè)序公司烈冰生物全國(guó)五大實(shí)驗(yàn)中心,多地部署B(yǎng)D Rahpsody平臺(tái),助您的樣本更快速抵達(dá)“戰(zhàn)場(chǎng)”。
BD Rhapsody單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序是利用單細(xì)胞水平上的高通量測(cè)序分析基因表達(dá)譜的技術(shù),突破傳統(tǒng)高通量測(cè)序的局限性,針對(duì)多種組織類型的樣本,采用BD 細(xì)胞懸液制備protocol組織解離后,單個(gè)樣本一次上機(jī)能捕獲500-10000個(gè)細(xì)胞, 基于每個(gè)細(xì)胞分別建庫(kù)測(cè)序,獲得單個(gè)細(xì)胞的基因結(jié)構(gòu)和基因表達(dá)狀態(tài),并鑒定細(xì)胞的類型,可以在不同樣本間從細(xì)胞類型的組成和豐度角度進(jìn)行比較,反映細(xì)胞間的異質(zhì)性,提供足夠靈活的定制測(cè)定法以滿足多種實(shí)驗(yàn)需要,并有效縮短實(shí)驗(yàn)是時(shí)間和降低測(cè)序成本。
烈冰生物單細(xì)胞測(cè)序服務(wù),為您提供可視化質(zhì)控系統(tǒng),保證每次實(shí)驗(yàn)的可靠性:BD Rhapsody 掃描儀具有直接成像功能,可在工作流程的不同階段進(jìn)行質(zhì)量控制,如細(xì)胞捕獲率和細(xì)胞多態(tài)率(雙細(xì)胞率)。成像儀指標(biāo)可以確認(rèn)起始細(xì)胞樣本的質(zhì)量,并確認(rèn)微孔板工作流程中每個(gè)步驟的成功完成狀態(tài) ;在細(xì)胞裂解前的步驟中評(píng)估細(xì)胞活性;并對(duì)通過(guò)測(cè)序確定的細(xì)胞回收量進(jìn)行可靠估算。利用這些信息,在進(jìn)行高成本的下游測(cè)序之前,用戶可根據(jù)需要改變方向并解決實(shí)驗(yàn)中遇到的問(wèn)題。這些指標(biāo)允許用戶對(duì)不同工作日間的或者不同研究中心間的工作流程性能進(jìn)行跟蹤。烈冰生物成立于2010年,專注于單細(xì)胞測(cè)序領(lǐng)域科研服務(wù)。
針對(duì)單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)分析時(shí)的reads數(shù)、基因表達(dá)量及細(xì)胞數(shù)量判定過(guò)程中:以捕獲5000個(gè)細(xì)胞、100G的測(cè)序量為標(biāo)準(zhǔn),每個(gè)細(xì)胞的reads數(shù)大約在50k左右;每個(gè)細(xì)胞的基因中位數(shù)取決于樣本的細(xì)胞類型,例如成熟的B,T,粒細(xì)胞數(shù)量較多的組織中,由于該類型細(xì)胞表達(dá)的基因數(shù)普遍較少,導(dǎo)致基因中位數(shù)下降。而某些疾病組織、或者體外培養(yǎng)的如干細(xì)胞等,他們的基因表達(dá)數(shù)較高,甚至可以超過(guò)1W,這就導(dǎo)致該類樣本基因中位數(shù)非常高。因此,我們對(duì)細(xì)胞數(shù)量以及基因中位數(shù)確認(rèn)時(shí),需要考察實(shí)際組織的細(xì)胞組成。烈冰全線實(shí)驗(yàn)平臺(tái)滿足超深度、大規(guī)模發(fā)現(xiàn)和復(fù)雜疾病研究的測(cè)序。南京單細(xì)胞平臺(tái)
深度的單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)解讀助力醫(yī)療健康大時(shí)代。江蘇BD單細(xì)胞服務(wù)機(jī)構(gòu)
從單細(xì)胞測(cè)序描述性分析轉(zhuǎn)向復(fù)雜樣本中不同細(xì)胞類型的功能解析,越來(lái)越需要一種多組學(xué)的細(xì)胞生物學(xué)視角。通過(guò)單細(xì)胞多組學(xué)——即對(duì)不同組學(xué)的數(shù)據(jù)集進(jìn)行分析和整合——科學(xué)家能夠從同一個(gè)單細(xì)胞來(lái)源中檢測(cè)多種細(xì)胞特征。這些特征包括全轉(zhuǎn)錄組基因表達(dá)、細(xì)胞表面蛋白表達(dá)、免疫組庫(kù)序列(包括T細(xì)胞和B細(xì)胞受體)以及用于了解表觀基因組調(diào)控的開(kāi)放染色質(zhì)區(qū)域。隨著單個(gè)實(shí)驗(yàn)可提供更多信息豐富的數(shù)據(jù),研究人員的獲益更多,包括保留珍貴樣本、提高生產(chǎn)力、減少因批次效應(yīng)引起的錯(cuò)誤,并節(jié)省更多的高科技資源(從資助基金到人員時(shí)間)。江蘇BD單細(xì)胞服務(wù)機(jī)構(gòu)
上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司位于江月路999號(hào)奇亞特中心22幢。公司業(yè)務(wù)涵蓋單細(xì)胞測(cè)序,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺(tái),空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序等,價(jià)格合理,品質(zhì)有保證。公司秉持誠(chéng)信為本的經(jīng)營(yíng)理念,在醫(yī)藥健康深耕多年,以技術(shù)為先導(dǎo),以自主產(chǎn)品為重點(diǎn),發(fā)揮人才優(yōu)勢(shì),打造醫(yī)藥健康良好品牌。烈冰生物憑借創(chuàng)新的產(chǎn)品、專業(yè)的服務(wù)、眾多的成功案例積累起來(lái)的聲譽(yù)和口碑,讓企業(yè)發(fā)展再上新高。