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scRNA單細胞測序服務

來源: 發(fā)布時間:2022-07-10

單細胞測序結果動輒上百G數(shù)據(jù)量,龐大的數(shù)據(jù)對于分析平臺和分析能力有著很高的要求,首先針對下機數(shù)據(jù)的質控環(huán)節(jié):單細胞測序產(chǎn)生數(shù)億的結果序列,不可避免的會出現(xiàn)低質量的測序結果,存在各種情況的序列污染。因此序列過濾及質量評估就會變得極為重要。序列質量主要通過測序質量值Q20/Q30的占比來表征,即堿基測序結果的錯誤率在1% / 0.1%以下的比例。理想的測序結果reads的堿基質量均高于30。保證數(shù)據(jù)獲得后的處理結果的準確性,為后續(xù)細胞類型鑒定和功能分析打下堅實基礎。烈冰一站式單細胞測序服務:立足科學研究,解碼生命本質。scRNA單細胞測序服務

樣本制備后的保存 為了盡可能地減少轉錄組的變化,在對細胞進行清洗和計數(shù)后,單細胞懸液應當保存于冰上,直至用于后續(xù)的上機和文庫制備步驟。在理想狀況下,一旦制備好樣本,應當在3min鐘內(nèi)將其用于下游步驟。然而,您還有必要了解各類細胞的不同性質,因為這可能會影響細胞應在冰上保存的時間,以及它們在制備后多久便應當被盡快使用。例如,有些細胞(如PBMC)如果在冰上放置一段時間,它們就開始形成團塊。這些團塊很難解離,增加了堵塞的風險,而且每個團塊被當成單細胞計數(shù),又降低了細胞計數(shù)的準確性。此外,有些細胞更加粘稠,形成團塊的速度更快。對于這些細胞,必須盡量減少制備和使用之間的時間差。深圳BD單細胞多組學測序搭配BD FACSMelody流式分選儀,全線搭建BD Rahpsody單細胞測序平臺。

基因和基因產(chǎn)物并不是單獨運作的,而是參與了相互關聯(lián)的復雜通路、網(wǎng)絡和分子系統(tǒng),這些合在一起實現(xiàn)了細胞、組織和生物體的運作。定義這些系統(tǒng)并確定它們的特征和相互作用,對于了解生物系統(tǒng)如何運作至關重要?!睘榱送苿涌茖W發(fā)現(xiàn),科學家們需要各種能夠幫助多方位了解其樣本的潛在生物復雜性的研究工具。對于越來越多的研究人員來說,單細胞RNA測序和單細胞多組學——即在單細胞分辨率下對基因表達及其他基于DNA、RNA或蛋白質的分析物進行定量分析的基因組方法——在幫助解決他們面臨的生物學問題上已證實是行之有效的。

您的珍貴樣本,還可以放心依賴烈冰生物BD Rhapsody單細胞捕獲系統(tǒng),BD RhapsodyTM單細胞捕獲系統(tǒng)采用微孔技術,對細胞的捕獲沒有偏好性,實現(xiàn)高達80%的微孔板捕獲率,由于單個微孔板中容納了22萬+個微孔,而現(xiàn)階段單細胞測序實驗技術通常要求單個樣本捕獲3000-5000,至高達10000個細胞,即可滿足科研探索需求,因此這種“泊松分布”的原理類似于上樣細胞的無限稀釋過程,但22萬+微孔的存在,也對大體量細胞數(shù)目的科學研究有很好的包容性,細胞通量分為可擴展至100-40000個細胞的捕獲(單個微孔板),滿足您的多重需求。BD Scanner,是您實驗過程的又一雙眼睛,實時監(jiān)測,精細質控。

烈冰生物在上海、北京、廣州、西安、江西等多地部署單細胞測序實驗組中心,多地部署搭建BD Rhapsody單細胞實驗平臺,基于微孔的強大的高通量單細胞分析系統(tǒng),為您提供可靠的單細胞分析工作流程,該系統(tǒng)可通過簡單的唯恐把工作流程和多重條碼標記系統(tǒng),對高通量單細胞進行多組學的信息捕獲,由此捕獲的信息科進一步生成各種類型的二代測序(NGS)文庫。之后對文庫進行測序和基于NovelBrain生物大數(shù)據(jù)分析平臺(云平臺)的數(shù)據(jù)可視化分析,實現(xiàn)高位分辨率下的組織內(nèi)基因的表達差異和表達豐度。對于消化背景雜,樣本初始數(shù)量少,關注粒細胞的項目,推薦您使用烈冰BD 單細胞測序平臺。長春BD VDJ單細胞平臺

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BD Rhapsody單細胞轉錄組測序是利用單細胞水平上的高通量測序分析基因表達譜的技術,突破傳統(tǒng)高通量測序的局限性,針對多種組織類型的樣本,采用BD 細胞懸液制備protocol組織解離后,單個樣本一次上機能捕獲500-10000個細胞, 基于每個細胞分別建庫測序,獲得單個細胞的基因結構和基因表達狀態(tài),并鑒定細胞的類型,可以在不同樣本間從細胞類型的組成和豐度角度進行比較,反映細胞間的異質性,提供足夠靈活的定制測定法以滿足多種實驗需要,并有效縮短實驗是時間和降低測序成本。scRNA單細胞測序服務

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