基于測序的數(shù)據(jù)能夠?qū)⒄蔑@其強大之處,因為它能夠了解同一單細胞的多種生物分析指標。如果說單細胞基因表達提供了一種顏色的詳細信息,那么單細胞多組學(xué)提供了同一細節(jié)的全彩色圖譜,為您帶來樣本的真實視圖。烈冰自2019年引進的BD Rhapsody單細胞平臺以來,能夠從同一單細胞中讀取細胞復(fù)雜性的多組學(xué)特征。與傳統(tǒng)方法不同,單細胞多組學(xué)簡化了您需要開展的實驗,也節(jié)省了您需要分析的樣本,而能獲得相同的結(jié)果。這不但節(jié)省了寶貴的樣本,還保證了更高的生物學(xué)準確性,因為您不需要匹配拆分樣本的數(shù)據(jù)集并通過計算來推斷各個組學(xué)之間的關(guān)系。烈冰生物作為BD 中國聯(lián)合成立單細胞測序?qū)嶒炇?,為推動單細胞測序技術(shù)發(fā)展貢獻中國力量。深圳BD Rhapsody單細胞服務(wù)機構(gòu)
細胞計數(shù)和活力評估在評估樣本質(zhì)量時,需要在細胞清洗和過濾之后測定細胞活力,這一點至關(guān)重要。測定細胞活力有許多種方法,烈冰多年單細胞測序經(jīng)驗發(fā)現(xiàn)臺盼藍法在鑒定活細胞與死細胞的比例時效果很好。細胞計數(shù)的準確性以及目標回收量和實際回收量之間的一致性,取決于我們了解樣本中有多少個細胞。一旦過濾和清洗完成,可采用細胞計數(shù)設(shè)備(如血球計數(shù)器或自動細胞計數(shù)儀)進行定量。這些設(shè)備不但能提供準確的細胞計數(shù),還能計算出向微流體芯片上樣適量細胞所需的細胞懸液體積。無錫BD VDJ單細胞測序服務(wù)十二年測序經(jīng)驗,累計服務(wù)與5000余項重要科研項目。
所謂的高通量測序技術(shù),又名大規(guī)模平行測序,是將 DNA(或者 cDNA)隨機片段化、加接頭,制備測序文庫,通過對文庫中數(shù)以萬計的克隆(colony)進行延伸反應(yīng),檢測對應(yīng)的信號,獲取序列信息。與傳統(tǒng)測序法(Sanger法等)相比,高通量測序技術(shù)在處理大規(guī)模樣品時具有明顯的優(yōu)勢,又快(兩天)又多(數(shù)百萬克?。蔀槟壳敖M學(xué)研究的主要技術(shù)。單細胞測序是一個系統(tǒng)的工程,開展項目前您可能會先評估它提供的見解是否與您的研究問題相匹配,如果匹配,實驗過程如何規(guī)劃,實驗平臺如何選擇,樣本如何制備,數(shù)據(jù)如何分析等等,而在這一切開始之前,我們的服務(wù)就已經(jīng)開始了,從銷售到實驗到專業(yè)技術(shù)支持,我們開通全線對接渠道,幫助您快速定位項目訴求,提供從實驗設(shè)計到文章發(fā)表的全流程,我們始終是您貼心的科學(xué)合作伙伴。
據(jù)不完全統(tǒng)計,截至2022年6月,烈冰生物助力發(fā)表單細胞文章近40篇,從平臺應(yīng)用比例來看,應(yīng)用10X Genomics和BD Rhapsody兩大平臺發(fā)文比例各占50%左右,研究類型涵蓋疾病發(fā)展,靶點探索,免疫研究,神經(jīng)發(fā)育,干細胞分化,植物發(fā)育,退行病變,糖尿病,COVID-19等等研究;從發(fā)表期刊水平來看,烈冰生物聯(lián)合發(fā)表的單細胞文章,CNS一區(qū)期刊占比在30%以上,其中包括immunity三篇,Nature子刊3篇(Nature cell biology,Nature Plants,Nature communication),風(fēng)濕類領(lǐng)域ARD期刊1篇,CUT 1篇,Advanced Science多篇,IF大于10分以上文章占比高達68.5%,烈冰專屬單細胞測序服務(wù)團隊,將與您攜手譜寫下一篇“高分”新文章。基于磁珠Barcode和UMI及polyT的探針結(jié)構(gòu),精細區(qū)分上萬個細胞中mRNA的來源及表達豐度。
針對單細胞測序的細胞數(shù)量判斷環(huán)節(jié):主要是對細胞數(shù)量、基因表達量、測序質(zhì)量進行整體描述。過濾標準:由于細胞破碎后游離RNA會釋放到環(huán)境或孔中,并且測序中也會存在一些死細胞,導(dǎo)致數(shù)據(jù)存在background值。因此,我們需要設(shè)定一定的標準來過濾掉假細胞或死細胞。以10× Genomics為例,細胞數(shù)量判斷主要通過分析UMI Counts-Barcode曲線斜率拐點,當存在多個斜率拐點的時候,結(jié)合預(yù)期UMI=500時的細胞數(shù)量進行過濾。當斜率拐點低于UMI=500的時候,選擇UMI=500作為細胞的判斷的標準;否則,選擇和預(yù)期細胞數(shù)量接近的拐點作為細胞判斷的位置。這樣我們能夠有效獲得真實的并且在基因數(shù)量上可以分析的數(shù)據(jù)。截至2022年6月,烈冰助力發(fā)表單細胞測序文章30+篇。廣州BD單細胞服務(wù)機構(gòu)
搭配BD FACSMelody流式分選儀,全線搭建BD Rahpsody單細胞測序平臺。深圳BD Rhapsody單細胞服務(wù)機構(gòu)
由于高通量測序?qū)嶒灧椒ㄏ嚓P(guān)的測序成本,使得單細胞實驗往往非常昂貴,烈冰生物BD Rhapsody單細胞測序服務(wù)珍視您的每一份樣本,在平臺搭建前,我們測試評估了BD Rhapsody的性能,與BD官方公布的數(shù)據(jù)結(jié)合來看,將人293T和小鼠NIH/3T3細胞的1:1混合物以不同濃度上樣到BD Rhapsody卡式芯片上。存儲的cDNA分子普遍擴增并進行低通量測序(每個細胞月8700個讀數(shù))。在測序數(shù)據(jù)中檢測到1109個細胞的上樣條件下,每個細胞中,來自每個細胞的平均99.4%的分子經(jīng)檢測為人或小鼠,這表明微孔之間的串擾非常小,在測序數(shù)據(jù)中檢測到1000個或更少細胞的上樣密度下,多重態(tài)發(fā)生率接近零,并且在15000個細胞下小于5%。深圳BD Rhapsody單細胞服務(wù)機構(gòu)
上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司致力于醫(yī)藥健康,是一家服務(wù)型的公司。公司業(yè)務(wù)涵蓋單細胞測序,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺,空間轉(zhuǎn)錄組測序,單細胞多組學(xué)測序等,價格合理,品質(zhì)有保證。公司注重以質(zhì)量為中心,以服務(wù)為理念,秉持誠信為本的理念,打造醫(yī)藥健康良好品牌。在社會各界的鼎力支持下,持續(xù)創(chuàng)新,不斷鑄造***服務(wù)體驗,為客戶成功提供堅實有力的支持。