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合肥單細(xì)胞多組學(xué)測序

來源: 發(fā)布時間:2022-07-20

單細(xì)胞測序龐大的數(shù)據(jù)烈冰生信團(tuán)隊傾情研發(fā)的NovelBrain?生信大數(shù)據(jù)分析平臺,可實現(xiàn)零代碼操作、簡單方便:單細(xì)胞瀏覽器的操作簡單,不需要命令行操作。簡單拖拽、設(shè)置參數(shù)即可運(yùn)行,即使生信0基礎(chǔ)用戶也可以運(yùn)用自如;可視化展示海量結(jié)果文件:可視化展示Cluster的基因數(shù),UMI數(shù)量、線粒體RNA占比信息;以及不同Cluster對應(yīng)的細(xì)胞數(shù)量、基因表達(dá)量、RNA表達(dá)量、樣本細(xì)胞分布、線粒體RNA表達(dá)量等;3D立體展示,文章動圖先人一步:單細(xì)胞瀏覽器針對t-SNE圖、UMAP圖和pseudotime結(jié)果進(jìn)行三維立體展示,更加直觀立體的觀察細(xì)胞分布和聚類情況。2019年,烈冰已助力發(fā)表了采用BD Rahpsody平臺的單細(xì)胞風(fēng)濕類文章。合肥單細(xì)胞多組學(xué)測序

烈冰生物為您的實驗定制工作流程: 對于不同用戶和實驗,單細(xì)胞實驗工作流程往往需要不同程度的樣本操作、質(zhì)量和通量。BD儀器選項可以根據(jù)具體需求進(jìn)行配置。烈冰生物搭建BD FACS流式分選平臺(如 BD FACSMelody),是上游樣本富集的良好選擇。此外,我們具備BD Rhapsody單細(xì)胞成像儀提供自動化細(xì)胞計數(shù)和細(xì)胞樣本活性測試,幫助用戶制備適用于Cartridge微孔板單細(xì)胞捕獲濃度的樣本。掃描儀提供了微孔板上磁珠捕獲細(xì)胞的計數(shù)。BD Rhapsody 樣品上樣工作站輕巧便攜,可在實驗室內(nèi)輕松移動。搭配烈冰傾情研發(fā)多年的成果NovelBrain生物信息大數(shù)據(jù)分析系統(tǒng),完成測序數(shù)據(jù)的生物信息分析和結(jié)果可視化呈現(xiàn)。這些工具包括 UMI 分析算法和可視化工具,即使沒有經(jīng)驗的用戶也可分析和理解單細(xì)胞數(shù)據(jù)。烈冰科技單細(xì)胞數(shù)據(jù)分析烈冰生物為您提供多平臺一站式全流程BD單細(xì)胞測序服務(wù)。

烈冰科技自主研發(fā)的單細(xì)胞云平臺致力于幫助每一位客戶定制化分析數(shù)據(jù),深度解讀數(shù)據(jù)分析結(jié)果,深入挖掘其背后的生物學(xué)意義;從操作便捷、結(jié)果可視化、分析可追溯、系統(tǒng)穩(wěn)定等方面助力單細(xì)胞研究,加速科研進(jìn)程!此外,烈冰生信團(tuán)隊根據(jù)豐富的實戰(zhàn)經(jīng)驗為用戶量身打造了一款單細(xì)胞測序結(jié)果解讀的神兵利器——單細(xì)胞瀏覽器(Single Cell Browser),不但可以將海量復(fù)雜的結(jié)果文件可視化,還是可以實現(xiàn)三維立體化展示的軟件。專業(yè)的生信代碼交給專業(yè)的烈冰,專業(yè)的生物學(xué)意義交給專業(yè)的您,詳情請咨詢烈冰生物。

現(xiàn)有的單細(xì)胞測序技術(shù)陣營在幾個主要領(lǐng)域存在差別。一個是基于微流控通道的細(xì)胞與Beads的在通道內(nèi)的動態(tài)結(jié)合,通過油相水相不相容的特點(diǎn)將結(jié)合了的細(xì)胞和Beads進(jìn)行分隔,在這個空間,單個細(xì)胞的內(nèi)容物釋放,轉(zhuǎn)錄本或其他生物分析物被標(biāo)記或添加索引,以便下游識別。BD Rhapsody單細(xì)胞測序平臺采用靜態(tài)微孔技術(shù)(Cyto-Seq具有類似的技術(shù)原理)。通過微孔板的物理分隔,將一個個單個細(xì)胞和帶有標(biāo)簽的磁珠,一對一的“框”在微反應(yīng)的物理平臺中。這樣,每一個細(xì)胞都會結(jié)合一個磁珠,那么在每一個磁珠中上長滿了不同的Cell Barcode和UMI Barcode連接形成的序列,再加上一端PolyT的抓手,這個抓手就會使用oligo dT抓住mRNA構(gòu)建文庫。烈冰生物全國五大實驗中心,多地部署B(yǎng)D Rahpsody平臺,助您的樣本更快速抵達(dá)“戰(zhàn)場”。

為什么需要單細(xì)胞分辨率? 生物學(xué)就像宇宙一樣。它非常復(fù)雜,有許多獨(dú)特的單體,也就是細(xì)胞。這些細(xì)胞相互作用并扮演不同的角色,在更大的體系中構(gòu)建并驅(qū)動多個過程。就像伽利略探索宇宙的努力一樣,發(fā)現(xiàn)和定義這些細(xì)胞也需要高分辨率的工具,才能解開促成生物學(xué)復(fù)雜性的基因表達(dá)異質(zhì)性。單細(xì)胞測序能夠在以一個細(xì)胞為功能單位中開展生物學(xué)研究,闡明具體細(xì)節(jié),構(gòu)建出一幅更大、更精細(xì)的圖譜,說明導(dǎo)致產(chǎn)生某種外在表型的不同類型的分子和細(xì)胞之間是如何相互作用的:患者為什么會復(fù)發(fā)?是什么讓這種疫苗能夠有效防止傳染等等諸多問題。烈冰對于一個細(xì)胞群體中的每個細(xì)胞單獨(dú)進(jìn)行建庫測序分析。溫州single cell RNA單細(xì)胞測序服務(wù)

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單細(xì)胞測序技術(shù)(Single Cell Sequencing)從一種新興的研究角度,借助已有的高通量測序手段,幫助研究者在樣本中細(xì)胞的異質(zhì)性、免疫微環(huán)境、發(fā)育學(xué)、免疫學(xué)以及其他領(lǐng)域中進(jìn)行單細(xì)胞層面的數(shù)據(jù)解析,解決了Bulk Population Sequencing所無法解決的問題。這樣一個新的研究領(lǐng)域必然也需要足夠可靠的實驗手段來支撐。BD Rhapsody單細(xì)胞分選系統(tǒng)為此提供了完善的硬件設(shè)備,保證了從單細(xì)胞懸液質(zhì)量評估到單細(xì)胞分選標(biāo)記過程中每一個實驗步驟的準(zhǔn)確質(zhì)控。NovelBio單細(xì)胞實驗團(tuán)隊借助BD Rhapsody單細(xì)胞分選系統(tǒng),在實驗實施層面對單細(xì)胞測序結(jié)果的可靠性提供了強(qiáng)有力的保證。繼單細(xì)胞懸液制備之后,又在另一道關(guān)鍵關(guān)卡提供了可靠的支持,幫助研究者在單細(xì)胞測序領(lǐng)域收獲更多的成果。合肥單細(xì)胞多組學(xué)測序

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