機體為響應(yīng)各種應(yīng)激，其細(xì)胞會從一種功能“狀態(tài)”轉(zhuǎn)變?yōu)榱硪环N功能“狀態(tài)”；當(dāng)細(xì)胞在不同狀態(tài)之間轉(zhuǎn)變時，往往會經(jīng)歷轉(zhuǎn)錄重組，導(dǎo)致一些基因被沉默，一些基因被重新“喚醒”，但純化這些瞬態(tài)細(xì)胞進行研究是很困難或不可能的；scRNA-seq擬時序分析可以讓我們在不需要純化的情況下查看這些細(xì)胞狀態(tài)。擬時序分析，即根據(jù)不同細(xì)胞亞群基因表達(dá)量隨時間的變化情況，構(gòu)建細(xì)胞譜系發(fā)育，但這里的時間并不是真時間，而是一個虛擬的時間，是指的細(xì)胞與細(xì)胞之間的轉(zhuǎn)化和演替的順序和軌跡。即使在同一個樣本中，也會存在多種不同的細(xì)胞形態(tài)。因此，不論測定了多少樣本，我們都可以采用擬時序分析對樣本中的細(xì)胞轉(zhuǎn)化和變化進行描述。烈冰生物成立于2010年，專注于單細(xì)胞測序領(lǐng)域科研服務(wù)。廣州scRNA單細(xì)胞測序服務(wù)公司

針對單細(xì)胞測序數(shù)據(jù)分析時的reads數(shù)、基因表達(dá)量及細(xì)胞數(shù)量判定過程中：以捕獲5000個細(xì)胞、100G的測序量為標(biāo)準(zhǔn)，每個細(xì)胞的reads數(shù)大約在50k左右；每個細(xì)胞的基因中位數(shù)取決于樣本的細(xì)胞類型，例如成熟的B，T，粒細(xì)胞數(shù)量較多的組織中，由于該類型細(xì)胞表達(dá)的基因數(shù)普遍較少，導(dǎo)致基因中位數(shù)下降。而某些疾病組織、或者體外培養(yǎng)的如干細(xì)胞等，他們的基因表達(dá)數(shù)較高，甚至可以超過1W，這就導(dǎo)致該類樣本基因中位數(shù)非常高。因此，我們對細(xì)胞數(shù)量以及基因中位數(shù)確認(rèn)時，需要考察實際組織的細(xì)胞組成。廣州單細(xì)胞平臺烈冰專注單細(xì)胞多組學(xué)測序領(lǐng)域。

烈冰生物單細(xì)胞測序服務(wù)體系，不僅提供10X Genomics和BD Rhapsody兩大國際認(rèn)可的單細(xì)胞實驗平臺，在“附加”產(chǎn)品上，我們提供BD FACS Melody流式細(xì)胞儀，滿足您對特殊細(xì)胞類型的富集需求，自主研發(fā)的Panocell單細(xì)胞捕獲芯片，可兼容BD 平臺全套原裝磁珠、試劑和protocol,為您提供完整的單細(xì)胞多組學(xué)解決方案。從細(xì)胞多樣本分析和染色所需的試劑到檢測試劑盒，生物信息分析工具，和在線大數(shù)據(jù)分析系統(tǒng)、精簡方案和專業(yè)團隊技術(shù)支持，烈冰生物可為您提供用于單細(xì)胞多組學(xué)甚至到空間轉(zhuǎn)錄組測序的各種工具，助您加速科研探索之旅。

多樣本數(shù)據(jù)合并：Fraction of Reads Kept：合并樣本時，各樣本根據(jù)Mapped Barcoded Reads per Cell數(shù)量計算出來的數(shù)據(jù)利用率。如果各樣本間該參數(shù)值相差很大，需要進行Downsample處理，以數(shù)據(jù)量少的樣本為基準(zhǔn)將不同樣本中細(xì)胞測序深度標(biāo)化到同一水平，從而避免因測序深度差異導(dǎo)致的基因檢測數(shù)量、基因表達(dá)水平的差異。烈冰科技自主研發(fā)的單細(xì)胞云平臺致力于幫助每一位客戶定制化分析數(shù)據(jù)，深度解讀數(shù)據(jù)分析結(jié)果，深入挖掘其背后的生物學(xué)意義；從操作便捷、結(jié)果可視化、分析可追溯、系統(tǒng)穩(wěn)定等方面助力單細(xì)胞研究，加速科研進程！烈冰全線實驗平臺滿足超深度、大規(guī)模發(fā)現(xiàn)和復(fù)雜疾病研究的測序。

根據(jù)烈冰多年單細(xì)胞測序服務(wù)經(jīng)驗，為什么不建議您一味的追求高細(xì)胞數(shù)量的捕獲：單細(xì)胞測序所有的分析都是基于細(xì)胞聚類進行，而細(xì)胞聚類是在區(qū)分cell和non-cell后，獲得細(xì)胞基因表達(dá)譜，通過降維（pca），無監(jiān)督聚類以及可視化（t-SNE）得到的。進行細(xì)胞聚類時需要考慮到每個細(xì)胞的基因表達(dá)模式，因此即使是相同的數(shù)據(jù)，在剔除幾個細(xì)胞的情況下，前后獲得的聚類圖也會出現(xiàn)明顯不同。而當(dāng)細(xì)胞捕獲數(shù)過多時，無論是假陰性和假陽性數(shù)據(jù)還是多細(xì)胞數(shù)據(jù)，都會對正常細(xì)胞聚類產(chǎn)生影響，造成聚類結(jié)果失真。這也是很多文章，特別是很多高分文章，為什么單個樣本捕獲細(xì)胞數(shù)在2000-3000的原因了。烈冰建議單個樣本捕獲細(xì)胞數(shù)在3000-5000個時，數(shù)據(jù)量在100G左右時，可以滿足分析和文章發(fā)表的多重需求。自2019年起，烈冰生物BD單細(xì)胞測序平臺已助力發(fā)表近20篇一區(qū)CNS高分文章。溫州BD VDJ單細(xì)胞多組學(xué)測序

基于“靜態(tài)蜂巢”技術(shù)，實現(xiàn)落孔細(xì)胞的物力分割和磁珠的一對一匹配。廣州scRNA單細(xì)胞測序服務(wù)公司

作為單細(xì)胞測序的又一個重要里程碑，BD Rhapsody單細(xì)胞捕獲平臺整合了儀器、試劑盒和基礎(chǔ)信息學(xué)軟件，能精確對接illumina測序儀，因此可實現(xiàn)大量大細(xì)胞的快速高效標(biāo)記、測序和分析，獲得單細(xì)胞水平的基因表達(dá)譜和差異情況，并通過對復(fù)雜細(xì)胞群體進行深入細(xì)致分析，繪制大規(guī)模單細(xì)胞表達(dá)圖譜。 以量化細(xì)胞內(nèi)的群體異質(zhì)性，并逐個鑒定細(xì)胞類型、細(xì)胞狀態(tài)和動態(tài)細(xì)胞躍遷。除了有望鑒定新的細(xì)胞亞型和稀有細(xì)胞群體，單細(xì)胞技術(shù)還能更好地了解轉(zhuǎn)錄動態(tài)和基因調(diào)控關(guān)系。廣州scRNA單細(xì)胞測序服務(wù)公司

上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司位于江月路999號奇亞特中心22幢。公司業(yè)務(wù)分為單細(xì)胞測序，生物大數(shù)據(jù)云分析平臺，空間轉(zhuǎn)錄組測序，單細(xì)胞多組學(xué)測序等，目前不斷進行創(chuàng)新和服務(wù)改進，為客戶提供良好的產(chǎn)品和服務(wù)。公司從事醫(yī)藥健康多年，有著創(chuàng)新的設(shè)計、強大的技術(shù)，還有一批專業(yè)化的隊伍，確保為客戶提供良好的產(chǎn)品及服務(wù)。烈冰生物立足于全國市場，依托強大的研發(fā)實力，融合前沿的技術(shù)理念，及時響應(yīng)客戶的需求。