單細(xì)胞測序龐大的數(shù)據(jù)烈冰生信團(tuán)隊傾情研發(fā)的NovelBrain®生信大數(shù)據(jù)分析平臺，可實(shí)現(xiàn)零代碼操作、簡單方便：單細(xì)胞瀏覽器的操作簡單，不需要命令行操作。簡單拖拽、設(shè)置參數(shù)即可運(yùn)行，即使生信0基礎(chǔ)用戶也可以運(yùn)用自如；可視化展示海量結(jié)果文件：可視化展示Cluster的基因數(shù)，UMI數(shù)量、線粒體RNA占比信息；以及不同Cluster對應(yīng)的細(xì)胞數(shù)量、基因表達(dá)量、RNA表達(dá)量、樣本細(xì)胞分布、線粒體RNA表達(dá)量等；3D立體展示，文章動圖先人一步：單細(xì)胞瀏覽器針對t-SNE圖、UMAP圖和pseudotime結(jié)果進(jìn)行三維立體展示，更加直觀立體的觀察細(xì)胞分布和聚類情況。烈冰科技成立10余年，為科研學(xué)者提供專注的測序數(shù)據(jù)分析服務(wù)。上海10X Chromium X單細(xì)胞測序多組學(xué)測序

烈冰生信團(tuán)隊傾情研發(fā)的NovelBrain®生信大數(shù)據(jù)分析平臺，針對龐大的單細(xì)胞測序數(shù)據(jù)，能夠?qū)崿F(xiàn)細(xì)胞類型鑒定的快、精、準(zhǔn)：一鍵導(dǎo)入genelist構(gòu)建個性化基因列表；輕松一點(diǎn)即可展示Marker基因的Featureplot；任意修改Cluster的顏色和名稱助力高效鑒定細(xì)胞類型；一鍵獲得t-SNE圖、Heatmap和Violin圖：輕松獲得并下載基因表達(dá)的t-SNE圖、Heatmap、Violin圖，還可以通過調(diào)節(jié)寬、高和系數(shù)比例來調(diào)節(jié)美觀。平臺上線300+task自主分析工具、50+pipeline工作流模板，幫助烈冰生信分析團(tuán)隊和自主分析用戶實(shí)現(xiàn)分析工具和模板的快速調(diào)用和一站式全流程自動化分析，節(jié)省工作時間并提升整體工作效率烈冰生物單細(xì)胞測序數(shù)據(jù)分析可視化烈冰生物全轉(zhuǎn)錄組測序通過雙文庫構(gòu)建，實(shí)現(xiàn)多種RNA的一網(wǎng)打盡。

單細(xì)胞多組學(xué)提升見解基于測序的數(shù)據(jù)能夠?qū)⒄蔑@其強(qiáng)大之處，因?yàn)樗軌蛄私馔粏渭?xì)胞的多種生物分析指標(biāo)。如果說單細(xì)胞基因表達(dá)提供了一種顏色的詳細(xì)信息，那么單細(xì)胞多組學(xué)提供了同一細(xì)節(jié)的全彩色圖譜，為您帶來樣本的真實(shí)視圖。烈冰2021年強(qiáng)勢引進(jìn)的10xGenomicsChromium單細(xì)胞平臺能夠從同一單細(xì)胞中讀取細(xì)胞復(fù)雜性的多組學(xué)特征。與傳統(tǒng)方法不同，單細(xì)胞多組學(xué)簡化了您需要開展的實(shí)驗(yàn)，也節(jié)省了您需要分析的樣本，而能獲得相同的結(jié)果。這不但節(jié)省了寶貴的樣本，還保證了更高的生物學(xué)準(zhǔn)確性，因?yàn)槟恍枰ヅ洳鸱謽颖镜臄?shù)據(jù)集并通過計算來推斷各個組學(xué)之間的關(guān)系。

相對于Smart-Seq技術(shù)在細(xì)胞數(shù)量上的問題，10X平臺普遍提供的細(xì)胞數(shù)量都在1000-20000不等的測序細(xì)胞量，這個量級的測序細(xì)胞量已經(jīng)可以說能夠完全覆蓋絕大部分組織的SingleCell群體類型。因此，這兩種技術(shù)對于基于基因表達(dá)進(jìn)行準(zhǔn)確細(xì)胞分型上，無論是從細(xì)胞數(shù)量上來說還是表達(dá)檢測可靠性來說，都會更實(shí)用。同時依托RandomCellLabel技術(shù)，使得其對于NovaSeq、HiSeqXTen、Hiseq4000等設(shè)備存在的Indexhooping現(xiàn)象，相對于Smart-Seq數(shù)據(jù)來說，影響幾乎可以忽略不計（10XGenomics官方網(wǎng)站曾給出hooping測試結(jié)果，顯示無影響。烈冰斥巨資引進(jìn)Novaseq6000，開啟更大通量測序新紀(jì)元。

科研的魅力之處，在于無窮盡的探尋生命的本底，通過單細(xì)胞測序，我們對組織的分子基礎(chǔ)的研究也從初級到深層，并在單細(xì)胞層面逐漸達(dá)成一致，那么不禁要問一句，組織的空間位置到底重不重要？空間異質(zhì)性是功能的關(guān)鍵特征，細(xì)胞的位置信息更能反應(yīng)細(xì)胞命運(yùn)調(diào)控機(jī)制和細(xì)胞譜系發(fā)生過程。因此時間和空間即像組織的AB面，而不可否認(rèn)的是，此時空間坐標(biāo)的記錄，像一個還未長大的娃娃，雖未觸及分子基礎(chǔ)研究的深層，但仍在努力攀登探尋生命本底的下一個高峰。全線搭建10X Genomics Chromium X單細(xì)胞實(shí)驗(yàn)測序平臺。西安10X單細(xì)胞測序多組學(xué)測序

深度的單細(xì)胞測序數(shù)據(jù)解讀助力醫(yī)療健康大時代。上海10X Chromium X單細(xì)胞測序多組學(xué)測序

單細(xì)胞測序結(jié)果動輒上百G數(shù)據(jù)量，龐大的數(shù)據(jù)對于分析平臺和分析能力有著很高的要求，首先針對下機(jī)數(shù)據(jù)的質(zhì)控環(huán)節(jié)：單細(xì)胞測序產(chǎn)生數(shù)億的結(jié)果序列，不可避免的會出現(xiàn)低質(zhì)量的測序結(jié)果，存在各種情況的序列污染。因此序列過濾及質(zhì)量評估就會變得極為重要。序列質(zhì)量主要通過測序質(zhì)量值Q20/Q30的占比來表征，即堿基測序結(jié)果的錯誤率在1%/0.1%以下的比例。理想的測序結(jié)果reads的堿基質(zhì)量均高于30。保證數(shù)據(jù)獲得后的處理結(jié)果的準(zhǔn)確性，為后續(xù)細(xì)胞類型鑒定和功能分析打下堅實(shí)基礎(chǔ)。上海10X Chromium X單細(xì)胞測序多組學(xué)測序

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